MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 267 chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017462	AGCTTC	2	12	21472	21483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017462	CAGAAG	2	12	74720	74731	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017462	CTCACT	2	12	121009	121020	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017462	TGGGGC	2	12	182578	182589	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017462	TTTGCC	2	12	320971	320982	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017462	ACGGTA	2	12	322066	322077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017462	GCTATA	2	12	378640	378651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017462	ACGTTG	2	12	379168	379179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017462	TGAGTA	2	12	390434	390445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017462	CTAAAA	2	12	397522	397533	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017462	AGGGCT	2	12	429748	429759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017462	GTGCCT	2	12	480537	480548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017462	TGGTTC	2	12	483945	483956	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017462	AAAAAG	2	12	613753	613764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017462	GGGTGT	2	12	618406	618417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017462	GTTTTT	2	12	620442	620453	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017462	AGCGAA	2	12	621519	621530	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017462	CTGAGC	2	12	650787	650798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017462	GATCTA	2	12	686215	686226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017462	ACTGAA	2	12	686368	686379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017462	GGCTGC	2	12	770135	770146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017462	AGGGGT	2	12	874246	874257	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017462	CCGTGC	2	12	939192	939203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017462	GACGGT	2	12	948213	948224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017462	GTGGTT	2	12	966132	966143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017462	GGGTGT	2	12	1029422	1029433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017462	GTTTTT	2	12	1031458	1031469	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017462	AGCGAA	2	12	1032535	1032546	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017462	ATTCAA	2	12	1073935	1073946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017462	TCAACT	2	12	1085160	1085171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017462	AGAAAA	2	12	1150723	1150734	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017462	TCTTTT	2	12	1150744	1150755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017462	AAGCTC	2	12	1207578	1207589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017462	CAAGAA	2	12	1289537	1289548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017462	ATAAGA	2	12	1378907	1378918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017462	AATCTA	2	12	1417027	1417038	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017462	TATTTC	2	12	1431173	1431184	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017462	TCCTTG	2	12	1440949	1440960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017462	GACGGT	2	12	1450059	1450070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017462	GTCTGT	2	12	1477794	1477805	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017462	AATTTC	2	12	1511229	1511240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017462	TTGTTC	2	12	1550514	1550525	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017462	CTGTGC	2	12	1551628	1551639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017462	GCAACC	2	12	1589194	1589205	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017462	AGCTGG	2	12	1600483	1600494	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017462	TCGTGG	2	12	1604164	1604175	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017462	TTGTGT	2	12	1640340	1640351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017462	ATTTTT	2	12	1754118	1754129	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017462	ACCCCT	2	12	1769153	1769164	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017462	AAAAGA	2	12	1815069	1815080	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017462	AGCTTT	2	12	1816268	1816279	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017462	ACCTTT	2	12	1835666	1835677	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017462	AGTGGT	2	12	1840511	1840522	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017462	TTCGCT	2	12	1857749	1857760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017462	AAAAAC	2	12	1858826	1858837	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017462	CACCCA	2	12	1860863	1860874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017462	GTCGCG	2	12	1889425	1889436	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017462	TAATTT	2	12	1935870	1935881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017462	CGCATA	2	12	1944845	1944856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017462	AAACAA	2	12	1952239	1952250	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017462	CATTAT	2	12	1978600	1978611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017462	ACAGCC	2	12	1982074	1982085	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017462	TACCCC	2	12	2043862	2043873	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017462	CATATA	2	12	2058627	2058638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017462	ATGTTG	2	12	2065897	2065908	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017462	GATGAG	2	12	2066361	2066372	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017462	CAAGGA	2	12	2066450	2066461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017462	TTCAAT	2	12	2071222	2071233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017462	GCACGC	2	12	2072444	2072455	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017462	TCCTTA	2	12	2087770	2087781	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017462	AGGTCA	2	12	2088941	2088952	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017462	GCTTGG	2	12	2089429	2089440	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017462	TTTAGT	2	12	2097575	2097586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017462	GCAGGC	2	12	2176783	2176794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017462	CATAGA	2	12	2189315	2189326	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017462	AGAAAA	2	12	2197656	2197667	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017462	TTCGCT	2	12	2230946	2230957	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017462	AAAAAC	2	12	2232023	2232034	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.