MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 267 chromosome

Total Repeats: 1309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017462	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	385806438
2	NC_017462	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	385806443
3	NC_017462	TTATC	2	10	14086	14095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017462	ACGTA	2	10	14249	14258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017462	CAGTA	2	10	14632	14641	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017462	CAGTG	2	10	15503	15512	20 %	20 %	40 %	20 %	385806453
7	NC_017462	AAAAT	2	10	16763	16772	80 %	20 %	0 %	0 %	385806454
8	NC_017462	TAGCG	2	10	18331	18340	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017462	CTTTT	2	10	19238	19247	0 %	80 %	0 %	20 %	385806458
10	NC_017462	GCTCT	2	10	19275	19284	0 %	40 %	20 %	40 %	385806458
11	NC_017462	TGGAT	2	10	23216	23225	20 %	40 %	40 %	0 %	385806468
12	NC_017462	TGCGT	2	10	24499	24508	0 %	40 %	40 %	20 %	385806469
13	NC_017462	CTGAT	2	10	28530	28539	20 %	40 %	20 %	20 %	385806473
14	NC_017462	GGAGC	2	10	29483	29492	20 %	0 %	60 %	20 %	385806474
15	NC_017462	TTGCT	2	10	30572	30581	0 %	60 %	20 %	20 %	385806475
16	NC_017462	TGAGG	2	10	37405	37414	20 %	20 %	60 %	0 %	385806479
17	NC_017462	CACAT	2	10	39589	39598	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017462	TGCGG	2	10	40522	40531	0 %	20 %	60 %	20 %	385806483
19	NC_017462	GCCTC	2	10	47299	47308	0 %	20 %	20 %	60 %	385806490
20	NC_017462	GAAGG	2	10	47313	47322	40 %	0 %	60 %	0 %	385806490
21	NC_017462	CAGTG	2	10	49205	49214	20 %	20 %	40 %	20 %	385806492
22	NC_017462	TGAGA	2	10	49547	49556	40 %	20 %	40 %	0 %	385806492
23	NC_017462	AGTGA	2	10	49597	49606	40 %	20 %	40 %	0 %	385806492
24	NC_017462	GCGGT	2	10	51747	51756	0 %	20 %	60 %	20 %	385806496
25	NC_017462	TTGGA	2	10	52633	52642	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017462	TTGAT	2	10	52668	52677	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017462	CTGGC	2	10	53021	53030	0 %	20 %	40 %	40 %	385806499
28	NC_017462	GCAGC	2	10	53520	53529	20 %	0 %	40 %	40 %	385806499
29	NC_017462	GACTG	2	10	53536	53545	20 %	20 %	40 %	20 %	385806499
30	NC_017462	AAGGC	2	10	55777	55786	40 %	0 %	40 %	20 %	385806501
31	NC_017462	ATGGC	2	10	58637	58646	20 %	20 %	40 %	20 %	385806505
32	NC_017462	ATGTG	2	10	62807	62816	20 %	40 %	40 %	0 %	385806509
33	NC_017462	TCTGT	2	10	64627	64636	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017462	GCTGG	2	10	64968	64977	0 %	20 %	60 %	20 %	385806511
35	NC_017462	AGGGA	2	10	67576	67585	40 %	0 %	60 %	0 %	385806514
36	NC_017462	AAGAT	2	10	69383	69392	60 %	20 %	20 %	0 %	385806516
37	NC_017462	GGAGC	2	10	69490	69499	20 %	0 %	60 %	20 %	385806516
38	NC_017462	GGTCT	2	10	71204	71213	0 %	40 %	40 %	20 %	385806518
39	NC_017462	CATGT	2	10	71780	71789	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017462	CAGCG	2	10	72657	72666	20 %	0 %	40 %	40 %	385806519
41	NC_017462	CAGGC	2	10	73063	73072	20 %	0 %	40 %	40 %	385806519
42	NC_017462	ATGGC	2	10	73908	73917	20 %	20 %	40 %	20 %	385806520
43	NC_017462	AGGCA	2	10	75228	75237	40 %	0 %	40 %	20 %	385806521
44	NC_017462	TAATT	2	10	76474	76483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017462	GCTTT	2	10	81069	81078	0 %	60 %	20 %	20 %	385806528
46	NC_017462	TGACC	2	10	81325	81334	20 %	20 %	20 %	40 %	385806528
47	NC_017462	CGTTA	2	10	82067	82076	20 %	40 %	20 %	20 %	385806529
48	NC_017462	TGCTG	2	10	82701	82710	0 %	40 %	40 %	20 %	385806529
49	NC_017462	TGGCC	2	10	84692	84701	0 %	20 %	40 %	40 %	385806530
50	NC_017462	GCGAC	2	10	85496	85505	20 %	0 %	40 %	40 %	385806530
51	NC_017462	TGGGA	2	10	88911	88920	20 %	20 %	60 %	0 %	385806536
52	NC_017462	GATCG	2	10	90011	90020	20 %	20 %	40 %	20 %	385806538
53	NC_017462	CAAAA	2	10	90743	90752	80 %	0 %	0 %	20 %	385806539
54	NC_017462	AACAA	2	10	93584	93593	80 %	0 %	0 %	20 %	385806541
55	NC_017462	TGCAA	2	10	96591	96600	40 %	20 %	20 %	20 %	385806544
56	NC_017462	TGCAG	2	10	96811	96820	20 %	20 %	40 %	20 %	385806544
57	NC_017462	AGGTC	2	10	99247	99256	20 %	20 %	40 %	20 %	385806547
58	NC_017462	ACCAA	2	10	101106	101115	60 %	0 %	0 %	40 %	385806547
59	NC_017462	TCATC	2	10	102369	102378	20 %	40 %	0 %	40 %	385806548
60	NC_017462	TGCAC	2	10	104184	104193	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017462	ACCTG	2	10	104399	104408	20 %	20 %	20 %	40 %	385806549
62	NC_017462	CGGTG	2	10	104608	104617	0 %	20 %	60 %	20 %	385806549
63	NC_017462	CGGCG	2	10	107227	107236	0 %	0 %	60 %	40 %	385806552
64	NC_017462	CGCGG	2	10	107287	107296	0 %	0 %	60 %	40 %	385806553
65	NC_017462	CAGCG	2	10	107823	107832	20 %	0 %	40 %	40 %	385806554
66	NC_017462	GGATC	2	10	118387	118396	20 %	20 %	40 %	20 %	385806565
67	NC_017462	TGTTT	2	10	120859	120868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017462	CGGGA	2	10	125503	125512	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017462	GACTG	2	10	127764	127773	20 %	20 %	40 %	20 %	385806571
70	NC_017462	TTGGT	2	10	129073	129082	0 %	60 %	40 %	0 %	385806571
71	NC_017462	TTAAG	2	10	130857	130866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017462	GTGCG	2	10	131397	131406	0 %	20 %	60 %	20 %	385806573
73	NC_017462	GTGGC	2	10	133135	133144	0 %	20 %	60 %	20 %	385806574
74	NC_017462	CGCGT	2	10	133452	133461	0 %	20 %	40 %	40 %	385806575
75	NC_017462	GGGGC	2	10	133580	133589	0 %	0 %	80 %	20 %	385806575
76	NC_017462	AGACG	2	10	135385	135394	40 %	0 %	40 %	20 %	385806577
77	NC_017462	GGGGC	2	10	135603	135612	0 %	0 %	80 %	20 %	385806578
78	NC_017462	ACGGT	2	10	136757	136766	20 %	20 %	40 %	20 %	385806579
79	NC_017462	CGATC	2	10	137030	137039	20 %	20 %	20 %	40 %	385806579
80	NC_017462	TGGCC	2	10	137237	137246	0 %	20 %	40 %	40 %	385806579
81	NC_017462	TGGTG	2	10	137615	137624	0 %	40 %	60 %	0 %	385806579
82	NC_017462	GGAGT	2	10	138087	138096	20 %	20 %	60 %	0 %	385806579
83	NC_017462	ATTGC	2	10	142021	142030	20 %	40 %	20 %	20 %	385806582
84	NC_017462	AAAAC	2	10	144847	144856	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017462	TCACT	2	10	145892	145901	20 %	40 %	0 %	40 %	385806587
86	NC_017462	ATTTC	2	10	146509	146518	20 %	60 %	0 %	20 %	385806587
87	NC_017462	AATGG	2	10	150209	150218	40 %	20 %	40 %	0 %	385806590
88	NC_017462	GTGAG	2	10	151192	151201	20 %	20 %	60 %	0 %	385806592
89	NC_017462	CTGAA	2	10	151990	151999	40 %	20 %	20 %	20 %	385806592
90	NC_017462	CCAGC	2	10	153282	153291	20 %	0 %	20 %	60 %	385806593
91	NC_017462	TTGCC	2	10	153792	153801	0 %	40 %	20 %	40 %	385806594
92	NC_017462	GTACC	2	10	155752	155761	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017462	TACGC	2	10	156309	156318	20 %	20 %	20 %	40 %	385806596
94	NC_017462	GCGAC	2	10	159803	159812	20 %	0 %	40 %	40 %	385806601
95	NC_017462	GGTTG	2	10	161078	161087	0 %	40 %	60 %	0 %	385806602
96	NC_017462	CCTTG	2	10	161454	161463	0 %	40 %	20 %	40 %	385806603
97	NC_017462	GCATA	2	10	163178	163187	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017462	TGTGC	2	10	164401	164410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017462	CGGTG	2	10	165423	165432	0 %	20 %	60 %	20 %	385806606
100	NC_017462	CATGG	2	10	167556	167565	20 %	20 %	40 %	20 %	385806608
101	NC_017462	CAGAT	2	10	167912	167921	40 %	20 %	20 %	20 %	385806608
102	NC_017462	GGATG	2	10	168810	168819	20 %	20 %	60 %	0 %	385806608
103	NC_017462	GGGAC	2	10	171436	171445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017462	CACTT	2	10	171616	171625	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017462	AAACT	2	10	172494	172503	60 %	20 %	0 %	20 %	385806611
106	NC_017462	ACCGG	2	10	172889	172898	20 %	0 %	40 %	40 %	385806611
107	NC_017462	ATTGA	2	10	178699	178708	40 %	40 %	20 %	0 %	385806615
108	NC_017462	GTGGA	2	10	181108	181117	20 %	20 %	60 %	0 %	385806617
109	NC_017462	TTAAG	2	10	184440	184449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017462	TGACC	2	10	185358	185367	20 %	20 %	20 %	40 %	385806620
111	NC_017462	ATATA	2	10	186160	186169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017462	AGGTG	2	10	186311	186320	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017462	TTGCA	2	10	186644	186653	20 %	40 %	20 %	20 %	385806622
114	NC_017462	GTTTG	2	10	188584	188593	0 %	60 %	40 %	0 %	385806625
115	NC_017462	CGGAT	2	10	189524	189533	20 %	20 %	40 %	20 %	385806626
116	NC_017462	AGCGC	2	10	190682	190691	20 %	0 %	40 %	40 %	385806627
117	NC_017462	GCAGT	2	10	192169	192178	20 %	20 %	40 %	20 %	385806628
118	NC_017462	CAATG	2	10	192440	192449	40 %	20 %	20 %	20 %	385806628
119	NC_017462	TAACG	2	10	193392	193401	40 %	20 %	20 %	20 %	385806629
120	NC_017462	AAGCC	2	10	194719	194728	40 %	0 %	20 %	40 %	385806630
121	NC_017462	GGCCC	2	10	196791	196800	0 %	0 %	40 %	60 %	385806633
122	NC_017462	GAATT	2	10	200356	200365	40 %	40 %	20 %	0 %	385806638
123	NC_017462	CAAGG	2	10	201245	201254	40 %	0 %	40 %	20 %	385806638
124	NC_017462	GATGG	2	10	203694	203703	20 %	20 %	60 %	0 %	385806639
125	NC_017462	TGGCG	2	10	204428	204437	0 %	20 %	60 %	20 %	385806640
126	NC_017462	TGCCA	2	10	206451	206460	20 %	20 %	20 %	40 %	385806641
127	NC_017462	AAATA	2	10	206553	206562	80 %	20 %	0 %	0 %	385806641
128	NC_017462	ATTCT	2	10	207149	207158	20 %	60 %	0 %	20 %	385806642
129	NC_017462	CAGGC	2	10	211966	211975	20 %	0 %	40 %	40 %	385806649
130	NC_017462	TTGTA	2	10	212376	212385	20 %	60 %	20 %	0 %	385806650
131	NC_017462	GCGAC	2	10	216892	216901	20 %	0 %	40 %	40 %	385806655
132	NC_017462	AGATC	2	10	216917	216926	40 %	20 %	20 %	20 %	385806655
133	NC_017462	CAAGG	2	10	217831	217840	40 %	0 %	40 %	20 %	385806656
134	NC_017462	AGAAA	2	10	218560	218569	80 %	0 %	20 %	0 %	385806657
135	NC_017462	CGGGG	2	10	224594	224603	0 %	0 %	80 %	20 %	385806664
136	NC_017462	GAAAA	2	10	224733	224742	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017462	CGAGA	2	10	225374	225383	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017462	TGCGC	2	10	227032	227041	0 %	20 %	40 %	40 %	385806667
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177	NC_017462	GGCCC	2	10	285199	285208	0 %	0 %	40 %	60 %	385806722
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199	NC_017462	TTGTG	2	10	322005	322014	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017462	GGTGG	2	10	451381	451390	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_017462	TGGGA	2	10	488212	488221	20 %	20 %	60 %	0 %	385806925
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379	NC_017462	CGTCA	2	10	620293	620302	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
380	NC_017462	GTGTT	2	10	620575	620584	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
381	NC_017462	TGTGT	2	10	620720	620729	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
382	NC_017462	GGGAG	2	10	621378	621387	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
383	NC_017462	TGACA	2	10	623964	623973	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
384	NC_017462	TGTGT	2	10	623979	623988	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
385	NC_017462	CAAAT	2	10	625439	625448	60 %	20 %	0 %	20 %	385807047
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