MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 267 chromosome

Total Repeats: 796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017462	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017462	TCGC	2	8	8250	8257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017462	GAAA	2	8	20227	20234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017462	TCAT	2	8	23818	23825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017462	TGAT	2	8	23836	23843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017462	GCTA	2	8	29130	29137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017462	TACT	2	8	39038	39045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017462	AAGA	2	8	39120	39127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017462	TGCG	2	8	39570	39577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017462	GCTG	2	8	41458	41465	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017462	AATG	2	8	44453	44460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017462	AAAT	2	8	46097	46104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017462	TTGC	2	8	47826	47833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017462	ATTA	2	8	47901	47908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017462	GTTT	2	8	50864	50871	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017462	TTGG	2	8	57773	57780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017462	GCAC	2	8	59645	59652	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017462	CTTT	2	8	61407	61414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017462	AGTG	2	8	69186	69193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017462	ATGA	2	8	71802	71809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017462	GGAA	2	8	74746	74753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017462	TAAT	2	8	76494	76501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017462	TCCT	2	8	79221	79228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017462	TCTT	2	8	90228	90235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017462	TCTT	2	8	104979	104986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017462	GAGG	2	8	113642	113649	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017462	TACC	2	8	117281	117288	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017462	GAAT	2	8	117308	117315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017462	GGCA	2	8	117318	117325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017462	CCAC	2	8	119571	119578	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017462	TCCT	2	8	121268	121275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017462	TCTT	2	8	121472	121479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017462	TTGG	2	8	124426	124433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017462	GCCG	2	8	124862	124869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017462	GGCA	2	8	124871	124878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017462	ATTT	2	8	127458	127465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017462	TGTT	2	8	129805	129812	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017462	TGGA	2	8	132474	132481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017462	TGCG	2	8	141020	141027	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017462	CAAA	2	8	150042	150049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017462	TTCC	2	8	155723	155730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017462	ATGC	2	8	157217	157224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017462	CGGC	2	8	163078	163085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017462	TTTG	2	8	164243	164250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017462	ATGC	2	8	164269	164276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017462	GATG	2	8	169156	169163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017462	TGTT	2	8	169230	169237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017462	GAGG	2	8	171174	171181	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017462	TGCT	2	8	171188	171195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017462	AAAT	2	8	171467	171474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017462	GGAC	2	8	171729	171736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017462	ATAG	2	8	175195	175202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017462	AGCC	2	8	184461	184468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017462	ATCT	2	8	186336	186343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017462	CAGT	2	8	195116	195123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017462	ATGG	2	8	196702	196709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017462	TCAC	2	8	202739	202746	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017462	CTTT	2	8	208005	208012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017462	TCAC	2	8	208183	208190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017462	ATCT	2	8	208368	208375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017462	CAAA	2	8	210436	210443	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017462	CGAA	2	8	210531	210538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017462	GTTC	2	8	214577	214584	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017462	CGGG	2	8	215718	215725	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017462	TAGA	2	8	223007	223014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017462	GCCC	2	8	224837	224844	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_017462	GTCT	2	8	225195	225202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017462	TTCA	2	8	235977	235984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017462	TCCT	2	8	237983	237990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017462	GATA	2	8	238098	238105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017462	GTAG	2	8	238112	238119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017462	CCTA	2	8	238141	238148	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017462	AGCC	2	8	241059	241066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017462	TTTA	2	8	243344	243351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017462	CGCC	2	8	251182	251189	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_017462	AGTT	2	8	252345	252352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017462	TAAA	2	8	252479	252486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017462	ACTC	2	8	260084	260091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017462	ATGA	2	8	260556	260563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017462	ATTA	2	8	260619	260626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017462	GAAT	2	8	265234	265241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017462	TATT	2	8	267789	267796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017462	AAAT	2	8	280735	280742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017462	GTTC	2	8	280801	280808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017462	GCGG	2	8	281261	281268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017462	TCCC	2	8	287064	287071	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_017462	ATCA	2	8	293312	293319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017462	CTCG	2	8	294449	294456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017462	AAGG	2	8	294495	294502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017462	GCTG	2	8	310620	310627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017462	ATCG	2	8	312227	312234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017462	TGCC	2	8	313452	313459	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017462	CCTT	2	8	319795	319802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017462	GCTT	2	8	322023	322030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017462	TTAT	2	8	327824	327831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017462	AGGA	2	8	329245	329252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017462	AGCG	2	8	333201	333208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017462	GTAT	2	8	339032	339039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017462	AGTA	2	8	348965	348972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017462	GCTT	2	8	356298	356305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017462	TGGT	2	8	356375	356382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017462	AGTG	2	8	357647	357654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017462	TCCT	2	8	359878	359885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017462	GCCG	2	8	359959	359966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017462	ATTA	2	8	376761	376768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017462	ATTA	2	8	379059	379066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017462	AAGA	2	8	382275	382282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017462	TTAA	2	8	383459	383466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017462	AGCG	2	8	385249	385256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017462	TCGC	2	8	397274	397281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017462	ACTA	2	8	397284	397291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017462	CTTG	2	8	397471	397478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017462	GCTG	2	8	400789	400796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017462	CATC	2	8	401074	401081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017462	TCCG	2	8	404734	404741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017462	AGTC	2	8	412118	412125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017462	GGGA	2	8	418769	418776	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017462	GGCA	2	8	418964	418971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017462	AGGC	2	8	419454	419461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017462	CTGG	2	8	419697	419704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017462	AGAC	2	8	419712	419719	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017462	TTGA	2	8	426914	426921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017462	TTCT	2	8	426947	426954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017462	ACCC	2	8	429200	429207	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_017462	ATGC	2	8	436814	436821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017462	AGGA	2	8	443335	443342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017462	CTTA	2	8	447562	447569	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017462	AGCC	2	8	461465	461472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017462	CGCA	2	8	461660	461667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017462	GCTC	2	8	462297	462304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017462	GGGC	2	8	462496	462503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017462	ATCC	2	8	462596	462603	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017462	TCCC	2	8	463548	463555	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_017462	GTTT	2	8	465453	465460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017462	GTAT	2	8	476860	476867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017462	ATTT	2	8	482830	482837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017462	GTCC	2	8	482911	482918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017462	TCCC	2	8	483064	483071	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_017462	CATG	2	8	483160	483167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017462	CTAT	2	8	483210	483217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017462	TTTC	2	8	486988	486995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017462	CAAA	2	8	490077	490084	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017462	TCTG	2	8	490319	490326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017462	GATA	2	8	498957	498964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017462	GCGG	2	8	500714	500721	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017462	TTTG	2	8	505139	505146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017462	TGAA	2	8	517886	517893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017462	GCGT	2	8	521507	521514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017462	CAAG	2	8	521517	521524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017462	CGGT	2	8	529341	529348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017462	TCGG	2	8	529684	529691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_017462	TCGA	2	8	1596746	1596753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_017462	GACC	2	8	1596776	1596783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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499	NC_017462	ATGT	2	8	1602799	1602806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017462	AACG	2	8	1603260	1603267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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