MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 267 chromosome

Total Repeats: 28086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017462	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806438
2	NC_017462	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806438
3	NC_017462	TTA	2	6	330	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806438
4	NC_017462	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806438
5	NC_017462	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806438
6	NC_017462	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806438
7	NC_017462	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806438
8	NC_017462	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806438
9	NC_017462	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806438
10	NC_017462	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806438
11	NC_017462	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806438
12	NC_017462	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385806438
13	NC_017462	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806438
14	NC_017462	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806438
15	NC_017462	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806438
16	NC_017462	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806438
17	NC_017462	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806438
18	NC_017462	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806438
19	NC_017462	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806438
20	NC_017462	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806438
21	NC_017462	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806438
22	NC_017462	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806438
23	NC_017462	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806438
24	NC_017462	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806439
25	NC_017462	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806440
26	NC_017462	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806440
27	NC_017462	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806440
28	NC_017462	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806440
29	NC_017462	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806440
30	NC_017462	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806440
31	NC_017462	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806440
32	NC_017462	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806440
33	NC_017462	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806440
34	NC_017462	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806440
35	NC_017462	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806441
36	NC_017462	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806441
37	NC_017462	GTG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806441
38	NC_017462	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806441
39	NC_017462	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806441
40	NC_017462	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806441
41	NC_017462	CGT	2	6	4396	4401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806441
42	NC_017462	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806441
43	NC_017462	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806441
44	NC_017462	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806442
45	NC_017462	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806442
46	NC_017462	TGC	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806442
47	NC_017462	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806442
48	NC_017462	ACG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806442
49	NC_017462	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806442
50	NC_017462	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806442
51	NC_017462	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806442
52	NC_017462	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806442
53	NC_017462	CGG	2	6	5770	5775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806443
54	NC_017462	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806443
55	NC_017462	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806443
56	NC_017462	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806443
57	NC_017462	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806443
58	NC_017462	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806443
59	NC_017462	TCG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806443
60	NC_017462	GAA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806443
61	NC_017462	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806443
62	NC_017462	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806443
63	NC_017462	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806443
64	NC_017462	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806443
65	NC_017462	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806443
66	NC_017462	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806443
67	NC_017462	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806443
68	NC_017462	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806443
69	NC_017462	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806443
70	NC_017462	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806443
71	NC_017462	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806443
72	NC_017462	GGT	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806443
73	NC_017462	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806443
74	NC_017462	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806443
75	NC_017462	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806443
76	NC_017462	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806443
77	NC_017462	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806443
78	NC_017462	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806443
79	NC_017462	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806443
80	NC_017462	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806443
81	NC_017462	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806443
82	NC_017462	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806443
83	NC_017462	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806443
84	NC_017462	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806443
85	NC_017462	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806444
86	NC_017462	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806444
87	NC_017462	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806444
88	NC_017462	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806444
89	NC_017462	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806444
90	NC_017462	ATT	2	6	8303	8308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806445
91	NC_017462	CTG	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806446
92	NC_017462	GGA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806446
93	NC_017462	TGT	2	6	8592	8597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806446
94	NC_017462	CTG	2	6	8600	8605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806446
95	NC_017462	TGC	2	6	8651	8656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806446
96	NC_017462	GTC	2	6	8661	8666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806446
97	NC_017462	GCG	2	6	8723	8728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806447
98	NC_017462	TGA	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806447
99	NC_017462	GCT	2	6	8826	8831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806447
100	NC_017462	CGA	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806448
101	NC_017462	GCG	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385806448
102	NC_017462	GAG	2	6	9142	9147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806448
103	NC_017462	CCG	2	6	9234	9239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806448
104	NC_017462	ACG	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806448
105	NC_017462	CGC	2	6	9450	9455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806448
106	NC_017462	TTC	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806448
107	NC_017462	TGA	2	6	9599	9604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806448
108	NC_017462	TCT	2	6	9680	9685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806448
109	NC_017462	GAA	2	6	9859	9864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806448
110	NC_017462	TGC	2	6	10157	10162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806448
111	NC_017462	TTA	2	6	10164	10169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806448
112	NC_017462	TCG	2	6	10197	10202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806448
113	NC_017462	GAA	2	6	10219	10224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806448
114	NC_017462	CGA	2	6	10278	10283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806448
115	NC_017462	AGA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806448
116	NC_017462	CGT	2	6	10555	10560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806448
117	NC_017462	ATT	2	6	10567	10572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806448
118	NC_017462	GAA	2	6	10594	10599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806448
119	NC_017462	GTG	3	9	10621	10629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806448
120	NC_017462	CGT	2	6	10687	10692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806448
121	NC_017462	CTT	2	6	10746	10751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806448
122	NC_017462	AAG	2	6	10972	10977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806448
123	NC_017462	GGT	2	6	11011	11016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806448
124	NC_017462	GAA	2	6	11038	11043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806448
125	NC_017462	ATG	2	6	11075	11080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806448
126	NC_017462	GCT	2	6	11085	11090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806448
127	NC_017462	GAA	2	6	11101	11106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806448
128	NC_017462	TGA	3	9	11130	11138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806448
129	NC_017462	CGA	2	6	11196	11201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806448
130	NC_017462	GCT	2	6	11205	11210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806448
131	NC_017462	TCT	2	6	11241	11246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806448
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251	NC_017462	TTG	2	6	19521	19526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806458
252	NC_017462	TGG	2	6	19591	19596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806458
253	NC_017462	ATC	2	6	19623	19628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806458
254	NC_017462	GTA	2	6	19664	19669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806458
255	NC_017462	TTG	2	6	19677	19682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806458
256	NC_017462	GTT	2	6	19720	19725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806458
257	NC_017462	GCA	2	6	19775	19780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806459
258	NC_017462	AAT	2	6	19940	19945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385806460
259	NC_017462	GTT	2	6	20012	20017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806460
260	NC_017462	GAA	2	6	20830	20835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806461
261	NC_017462	CAT	2	6	20867	20872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806461
262	NC_017462	GAA	2	6	20938	20943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806461
263	NC_017462	GAA	2	6	21018	21023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806461
264	NC_017462	CCT	2	6	21096	21101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385806462
265	NC_017462	GCC	2	6	21122	21127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806462
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267	NC_017462	CGA	2	6	21593	21598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806463
268	NC_017462	ACA	2	6	21655	21660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806463
269	NC_017462	GCT	2	6	21861	21866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806464
270	NC_017462	ATG	2	6	21893	21898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806464
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272	NC_017462	AGT	2	6	21972	21977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806465
273	NC_017462	AGC	3	9	21990	21998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806465
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275	NC_017462	TCG	2	6	22283	22288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806467
276	NC_017462	CAT	2	6	22486	22491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806467
277	NC_017462	GAT	2	6	22660	22665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806468
278	NC_017462	CCA	2	6	22739	22744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385806468
279	NC_017462	CGA	2	6	22834	22839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806468
280	NC_017462	CAA	2	6	22859	22864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806468
281	NC_017462	AGA	2	6	22886	22891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806468
282	NC_017462	TTC	2	6	22893	22898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806468
283	NC_017462	TGC	2	6	22976	22981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806468
284	NC_017462	TCC	2	6	23032	23037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385806468
285	NC_017462	AAG	2	6	23384	23389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806468
286	NC_017462	ACG	2	6	23472	23477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806468
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290	NC_017462	GTT	2	6	24125	24130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806469
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292	NC_017462	TGT	2	6	24190	24195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806469
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294	NC_017462	ATG	2	6	24345	24350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806469
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326	NC_017462	GAT	2	6	26513	26518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806471
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375	NC_017462	CTT	2	6	30212	30217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806475
376	NC_017462	AGA	2	6	30285	30290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806475
377	NC_017462	GTG	2	6	30307	30312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806475
378	NC_017462	TGA	2	6	30350	30355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806475
379	NC_017462	GCT	2	6	30413	30418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806475
380	NC_017462	TGC	2	6	30488	30493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806475
381	NC_017462	GCC	2	6	30522	30527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385806475
382	NC_017462	TTC	2	6	30597	30602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806475
383	NC_017462	GTG	2	6	30712	30717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806475
384	NC_017462	AGC	2	6	30765	30770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806475
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390	NC_017462	CGT	2	6	31238	31243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806475
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392	NC_017462	CAA	2	6	31415	31420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806475
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403	NC_017462	GAG	2	6	32027	32032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806476
404	NC_017462	TCC	2	6	32082	32087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385806476
405	NC_017462	TTG	2	6	32095	32100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806476
406	NC_017462	GTG	2	6	32187	32192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806476
407	NC_017462	CTG	2	6	32252	32257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806476
408	NC_017462	GTA	2	6	32301	32306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806476
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499	NC_017462	AGC	2	6	38121	38126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806481
500	NC_017462	CGT	2	6	38260	38265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806481

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