MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017461	TATAAA	2	12	1203126	1203137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017461	ATGGAA	2	12	1203223	1203234	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385806299
503	NC_017461	GCTGCA	2	12	1207502	1207513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385806308
504	NC_017461	AAAAGA	2	12	1208529	1208540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385806309
505	NC_017461	TACAAA	2	12	1208722	1208733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385806309
506	NC_017461	TATTTT	2	12	1210071	1210082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385806311
507	NC_017461	GTTAAA	2	12	1210641	1210652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385806312
508	NC_017461	CCTGCT	2	12	1212817	1212828	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385806316
509	NC_017461	TAATTC	2	12	1214297	1214308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
510	NC_017461	TCTTTT	2	12	1217218	1217229	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385806319
511	NC_017461	CCAAAC	2	12	1226410	1226421	50 %	0 %	0 %	50 %	385806329
512	NC_017461	TAAATA	2	12	1227420	1227431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385806329
513	NC_017461	TAGCAT	2	12	1229879	1229890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385806332
514	NC_017461	CTTCCT	2	12	1237842	1237853	0 %	50 %	0 %	50 %	385806342
515	NC_017461	CATTTG	2	12	1240552	1240563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385806343
516	NC_017461	AGATAA	2	12	1243319	1243330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385806344
517	NC_017461	ATTTTT	2	12	1243631	1243642	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385806344
518	NC_017461	ATTGTA	2	12	1245608	1245619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385806346
519	NC_017461	ATTTTT	2	12	1246473	1246484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017461	TTTTAA	2	12	1261396	1261407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017461	TGAAAA	2	12	1263514	1263525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017461	CCATAG	2	12	1264722	1264733	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385806370
523	NC_017461	ACTGCA	2	12	1269889	1269900	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385806375
524	NC_017461	TTCCCT	2	12	1270566	1270577	0 %	50 %	0 %	50 %	385806377
525	NC_017461	TTTATA	2	12	1271024	1271035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017461	AGTGAA	2	12	1274981	1274992	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385806383
527	NC_017461	GGAAAC	2	12	1275179	1275190	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385806384
528	NC_017461	AGCTTT	2	12	1276425	1276436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385806388
529	NC_017461	AAGACT	2	12	1284053	1284064	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385806396
530	NC_017461	TATGCA	2	12	1285536	1285547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385806398
531	NC_017461	TTTGTA	2	12	1286929	1286940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385806399
532	NC_017461	GTCGAT	2	12	1287571	1287582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385806399
533	NC_017461	GTATCA	2	12	1291115	1291126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385806401
534	NC_017461	AAATGA	2	12	1294726	1294737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385806405
535	NC_017461	GAGTTG	2	12	1301920	1301931	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385806411
536	NC_017461	TGTACT	2	12	1304936	1304947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385806412
537	NC_017461	ACATGC	2	12	1307900	1307911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385806417
538	NC_017461	CTCTCG	2	12	1312403	1312414	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385806424
539	NC_017461	CGAGGA	2	12	1313210	1313221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385806425
540	NC_017461	TTGAGG	2	12	1314473	1314484	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385806426
541	NC_017461	AGAGGA	2	12	1316739	1316750	50 %	0 %	50 %	0 %	385806432
542	NC_017461	TAACAT	2	12	1318138	1318149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

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