MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017461	CTGCC	2	10	5285	5294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017461	TAAAA	2	10	12012	12021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017461	TCAAG	2	10	13595	13604	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017461	ATATT	2	10	14535	14544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017461	GAAAA	2	10	26015	26024	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017461	TGAAT	2	10	34856	34865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017461	TTGCC	2	10	44663	44672	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017461	ACGAA	2	10	55911	55920	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017461	TTCGT	2	10	62044	62053	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017461	ATCAA	2	10	73718	73727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017461	CATCT	2	10	75485	75494	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017461	TAGCT	2	10	89745	89754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017461	ATCAA	2	10	96529	96538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017461	AATTC	2	10	98276	98285	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017461	CAGGC	2	10	101439	101448	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017461	TGCTG	2	10	113273	113282	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017461	AATTT	2	10	118234	118243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017461	TTTTA	2	10	129697	129706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017461	GATTT	2	10	129837	129846	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017461	TTATG	2	10	138198	138207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017461	AGTAT	2	10	139990	139999	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017461	GGCTA	2	10	145525	145534	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017461	TTTAA	2	10	149482	149491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017461	TTAAT	2	10	176954	176963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017461	TTTAA	2	10	184252	184261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017461	ATATA	2	10	196805	196814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017461	ATTTT	2	10	222281	222290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017461	AGTCG	2	10	223878	223887	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017461	TGAAT	2	10	223890	223899	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017461	ATAAG	2	10	226347	226356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017461	TAAAT	2	10	231812	231821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017461	TTATT	2	10	236283	236292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017461	TTGTT	2	10	243165	243174	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017461	AAGCT	2	10	244281	244290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017461	TTGCT	2	10	248802	248811	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017461	TTTAA	2	10	249596	249605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017461	ATTTT	2	10	252302	252311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017461	TAAAA	2	10	259342	259351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017461	TAGCC	2	10	262441	262450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017461	TTTTC	2	10	262517	262526	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017461	TATTT	2	10	264909	264918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017461	ATTTA	2	10	272750	272759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017461	TAAAA	2	10	272812	272821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017461	TTTGT	2	10	272968	272977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017461	AATTA	2	10	274517	274526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017461	ATTTT	2	10	287958	287967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017461	ATTTT	2	10	305448	305457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017461	CAATA	2	10	308185	308194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017461	AAATA	2	10	336005	336014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017461	TTTTA	2	10	336561	336570	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017461	TTTTA	2	10	341458	341467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017461	AATTA	2	10	357048	357057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017461	CTTTT	2	10	360884	360893	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017461	AATAA	2	10	361513	361522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017461	ATATT	2	10	368188	368197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017461	ACTTT	2	10	378587	378596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017461	TTCTG	2	10	384740	384749	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017461	TAGGA	2	10	404197	404206	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017461	TTACT	2	10	408372	408381	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017461	TGATA	2	10	412288	412297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017461	GTTAT	2	10	431483	431492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017461	AAAGA	2	10	433286	433295	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017461	ATATT	2	10	433298	433307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017461	AAAGG	2	10	433330	433339	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017461	TAAAA	2	10	446904	446913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017461	TTAAT	2	10	455650	455659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017461	ATTTT	2	10	461981	461990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017461	TCAAA	2	10	464319	464328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017461	ATTAA	2	10	468681	468690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017461	TCCTT	2	10	469970	469979	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017461	AACTA	2	10	486896	486905	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017461	ATTTT	2	10	488319	488328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017461	AGAGA	2	10	498276	498285	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017461	AAAAC	2	10	508012	508021	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017461	TATTT	2	10	514798	514807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017461	TTTCT	2	10	516509	516518	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017461	TCTTT	2	10	533966	533975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017461	TCAAT	2	10	535369	535378	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017461	AATTC	2	10	535451	535460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017461	TTTAT	2	10	537027	537036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017461	AAGTA	2	10	537157	537166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017461	TAAAA	2	10	539691	539700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017461	ATTTT	2	10	557482	557491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017461	ATTTT	2	10	567177	567186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017461	CATAA	2	10	568031	568040	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017461	AGAAA	2	10	570303	570312	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017461	GAGAG	2	10	579602	579611	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017461	CTTTT	2	10	607394	607403	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017461	TTCTA	2	10	611562	611571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017461	CTATT	2	10	617018	617027	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017461	AAAGA	2	10	621077	621086	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017461	AGGGA	2	10	628239	628248	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017461	AGGAG	2	10	629887	629896	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017461	GGAGG	2	10	630226	630235	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017461	GAATT	2	10	631314	631323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017461	ATATA	2	10	638266	638275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017461	AAAAG	2	10	667338	667347	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017461	ATTAA	2	10	669148	669157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017461	TGATT	2	10	670757	670766	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017461	GTAAT	2	10	683433	683442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017461	ACATT	2	10	688846	688855	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017461	TAAAA	2	10	692624	692633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017461	CTTTT	2	10	693949	693958	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017461	ATTTA	2	10	715540	715549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017461	CTTAA	2	10	718040	718049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017461	ATTAA	2	10	718053	718062	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017461	TTTGT	2	10	723007	723016	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017461	TATCA	2	10	738059	738068	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017461	TGAAA	2	10	738426	738435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017461	TATTT	2	10	758625	758634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017461	TTCCT	2	10	769583	769592	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017461	TATTT	2	10	772164	772173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017461	ATTTA	2	10	772848	772857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017461	AAAAT	2	10	779494	779503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017461	AAATA	2	10	779627	779636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017461	TATTT	2	10	786899	786908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017461	TAAAA	2	10	789352	789361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017461	ATAAA	2	10	824031	824040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017461	TGAAC	2	10	828192	828201	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017461	ATTTT	2	10	828464	828473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017461	TTTTA	2	10	843707	843716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017461	AAATT	2	10	845393	845402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017461	AAATT	2	10	847067	847076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017461	ACTTT	2	10	847111	847120	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017461	TAAAT	2	10	848175	848184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017461	TAAAA	2	10	854530	854539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017461	TAAAA	2	10	856057	856066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017461	TAAAG	2	10	859839	859848	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017461	AAATA	2	10	864512	864521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017461	AAATT	2	10	864637	864646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017461	ATTTT	2	10	867905	867914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017461	TTTAA	2	10	872444	872453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017461	AGCGG	2	10	876332	876341	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017461	TATTT	2	10	876650	876659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017461	TCTTT	2	10	892233	892242	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017461	TTTAC	2	10	894136	894145	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017461	ATTTT	2	10	896971	896980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017461	TTTAC	2	10	898741	898750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017461	TATCA	2	10	898761	898770	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017461	CCTCC	2	10	900823	900832	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
141	NC_017461	TTTTA	2	10	902257	902266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017461	TATAA	2	10	916025	916034	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017461	AATAT	2	10	936176	936185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017461	CTAAA	2	10	940959	940968	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017461	ATTTA	2	10	965203	965212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017461	ATTAA	2	10	983591	983600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017461	AATAT	2	10	983686	983695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017461	TTAAT	2	10	984721	984730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.