MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 3587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017461	ATCG	2	8	1284714	1284721	25 %	25 %	25 %	25 %	385806397
3502	NC_017461	AAAT	2	8	1284755	1284762	75 %	25 %	0 %	0 %	385806397
3503	NC_017461	CAGG	2	8	1285111	1285118	25 %	0 %	50 %	25 %	385806398
3504	NC_017461	AAAG	2	8	1285300	1285307	75 %	0 %	25 %	0 %	385806398
3505	NC_017461	CTTC	2	8	1285507	1285514	0 %	50 %	0 %	50 %	385806398
3506	NC_017461	TTTA	2	8	1285583	1285590	25 %	75 %	0 %	0 %	385806398
3507	NC_017461	GAGC	2	8	1286018	1286025	25 %	0 %	50 %	25 %	385806398
3508	NC_017461	TTCT	2	8	1286129	1286136	0 %	75 %	0 %	25 %	385806398
3509	NC_017461	TGAA	2	8	1286170	1286177	50 %	25 %	25 %	0 %	385806398
3510	NC_017461	TTCT	2	8	1286209	1286216	0 %	75 %	0 %	25 %	385806398
3511	NC_017461	ACTA	2	8	1286434	1286441	50 %	25 %	0 %	25 %	385806399
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3513	NC_017461	TCAT	2	8	1286543	1286550	25 %	50 %	0 %	25 %	385806399
3514	NC_017461	GCCA	2	8	1287368	1287375	25 %	0 %	25 %	50 %	385806399
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3520	NC_017461	CATT	2	8	1289743	1289750	25 %	50 %	0 %	25 %	385806400
3521	NC_017461	ATGG	2	8	1289907	1289914	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017461	GGAG	2	8	1289940	1289947	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017461	AGGG	2	8	1290066	1290073	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017461	GCTT	2	8	1290353	1290360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3535	NC_017461	CCTT	2	8	1294612	1294619	0 %	50 %	0 %	50 %	385806405
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3537	NC_017461	ATCT	2	8	1295314	1295321	25 %	50 %	0 %	25 %	385806406
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3539	NC_017461	AGGG	2	8	1297490	1297497	25 %	0 %	75 %	0 %	385806407
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3543	NC_017461	GTGA	2	8	1298343	1298350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017461	GATA	2	8	1298816	1298823	50 %	25 %	25 %	0 %	385806409
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3585	NC_017461	TCCT	2	8	1318238	1318245	0 %	50 %	0 %	50 %	385806435
3586	NC_017461	TAAA	2	8	1318949	1318956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_017461	TGAA	2	8	1318963	1318970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.