MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 17497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017461	TCA	2	6	11	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017461	CAA	2	6	17	22	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017461	AGA	2	6	155	160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017461	CTG	2	6	208	213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017461	TAG	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017461	CTG	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017461	CAA	3	9	694	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017461	CTT	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
9	NC_017461	CTT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
10	NC_017461	GAA	2	6	895	900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805052
11	NC_017461	GCT	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
12	NC_017461	AGT	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
13	NC_017461	TCA	2	6	966	971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
14	NC_017461	ATC	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
15	NC_017461	TCT	3	9	1107	1115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
16	NC_017461	GAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
17	NC_017461	CTT	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
18	NC_017461	CCA	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385805052
19	NC_017461	CCG	2	6	1580	1585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805052
20	NC_017461	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
21	NC_017461	TTA	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805052
22	NC_017461	CTG	2	6	1768	1773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
23	NC_017461	GGT	2	6	1788	1793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805052
24	NC_017461	AAT	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
25	NC_017461	TCC	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805052
26	NC_017461	CAT	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
27	NC_017461	AAT	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
28	NC_017461	GCT	2	6	2468	2473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
29	NC_017461	GTA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
30	NC_017461	TGG	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805053
31	NC_017461	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805053
32	NC_017461	CTT	2	6	2965	2970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805053
33	NC_017461	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805053
34	NC_017461	ATG	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017461	ATG	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017461	CTG	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017461	GAC	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017461	GTT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017461	AAG	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017461	CAG	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017461	ATG	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017461	TAA	2	6	3755	3760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017461	TTG	2	6	3862	3867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017461	TCT	2	6	4081	4086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017461	AAT	2	6	4091	4096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017461	TCG	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017461	CTG	2	6	4219	4224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017461	AAT	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017461	CCT	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805054
50	NC_017461	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
51	NC_017461	CTC	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805055
52	NC_017461	CTA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805055
53	NC_017461	GGC	2	6	4700	4705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385805055
54	NC_017461	TGA	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
55	NC_017461	TAT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805055
56	NC_017461	ATT	2	6	4778	4783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805055
57	NC_017461	AGA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805055
58	NC_017461	TAG	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
59	NC_017461	CAT	2	6	4914	4919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017461	TAA	2	6	4954	4959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017461	AAG	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017461	CCG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017461	CCT	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017461	ACA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017461	CTT	2	6	5279	5284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017461	CGG	2	6	5350	5355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017461	TCT	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017461	CAT	2	6	5437	5442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017461	ATA	2	6	5537	5542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805056
70	NC_017461	TTA	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805056
71	NC_017461	CTT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805056
72	NC_017461	TCC	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805057
73	NC_017461	ATG	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805057
74	NC_017461	CAG	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805057
75	NC_017461	TCG	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805057
76	NC_017461	AAC	2	6	6106	6111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
77	NC_017461	GAG	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805057
78	NC_017461	CAA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
79	NC_017461	GTC	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805057
80	NC_017461	ACA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
81	NC_017461	AGC	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805057
82	NC_017461	AAG	2	6	6328	6333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805057
83	NC_017461	CAA	2	6	6414	6419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
84	NC_017461	TTC	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805057
85	NC_017461	ACT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805057
86	NC_017461	CTT	2	6	6496	6501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805057
87	NC_017461	ATA	2	6	6532	6537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805057
88	NC_017461	TCT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017461	AAT	2	6	6977	6982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
90	NC_017461	ATT	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805058
91	NC_017461	GCC	2	6	7064	7069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805058
92	NC_017461	AAT	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
93	NC_017461	AAT	2	6	7143	7148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
94	NC_017461	GCG	2	6	7194	7199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385805058
95	NC_017461	ATA	2	6	7282	7287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
96	NC_017461	TTC	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805058
97	NC_017461	CTG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805058
98	NC_017461	TTC	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805058
99	NC_017461	CGA	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805058
100	NC_017461	CCG	3	9	7623	7631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805058
101	NC_017461	CTA	2	6	7654	7659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805058
102	NC_017461	ATA	2	6	7671	7676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805058
103	NC_017461	ATT	2	6	7683	7688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805058
104	NC_017461	CTC	2	6	7713	7718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805059
105	NC_017461	TTC	2	6	7738	7743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805059
106	NC_017461	CAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805059
107	NC_017461	TGA	2	6	7894	7899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017461	GCA	2	6	7944	7949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017461	TTA	2	6	8120	8125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805060
110	NC_017461	ATT	2	6	8461	8466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805060
111	NC_017461	GCC	2	6	8494	8499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805060
112	NC_017461	AGC	2	6	8524	8529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805060
113	NC_017461	TGT	2	6	8578	8583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385805060
114	NC_017461	TAA	2	6	8700	8705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805060
115	NC_017461	TCC	2	6	9010	9015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805060
116	NC_017461	AAT	2	6	9017	9022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805060
117	NC_017461	ATT	2	6	9110	9115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805060
118	NC_017461	CCT	2	6	9116	9121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805060
119	NC_017461	ATT	2	6	9122	9127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805060
120	NC_017461	GAA	2	6	9139	9144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805060
121	NC_017461	GCC	2	6	9388	9393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805060
122	NC_017461	TAT	2	6	9636	9641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017461	ATT	2	6	9660	9665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017461	ATA	2	6	9749	9754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017461	TTC	2	6	9924	9929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017461	GAT	2	6	9959	9964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017461	CTG	2	6	10066	10071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805061
128	NC_017461	AAC	2	6	10161	10166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805061
129	NC_017461	AGA	2	6	10205	10210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805061
130	NC_017461	TTC	2	6	10212	10217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805061
131	NC_017461	TGC	2	6	10320	10325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017461	TAT	2	6	10592	10597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017461	GGA	2	6	10794	10799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805063
134	NC_017461	GAA	2	6	10886	10891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017461	TTC	2	6	10899	10904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805064
136	NC_017461	ATC	2	6	10917	10922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805064
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138	NC_017461	TTC	2	6	11078	11083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805064
139	NC_017461	GGA	2	6	11233	11238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805064
140	NC_017461	AAG	2	6	11264	11269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805064
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144	NC_017461	AGT	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017461	TGG	2	6	11991	11996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017461	ACC	2	6	12924	12929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_017461	ATA	2	6	12933	12938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017461	TAG	2	6	13038	13043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_017461	GAG	2	6	19872	19877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805077
264	NC_017461	CCT	2	6	19957	19962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805077
265	NC_017461	GAG	2	6	20004	20009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805077
266	NC_017461	AAG	2	6	20014	20019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805077
267	NC_017461	GCT	2	6	20113	20118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805078
268	NC_017461	CAG	2	6	20170	20175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805078
269	NC_017461	CCT	2	6	20296	20301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805078
270	NC_017461	GAG	2	6	20491	20496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805078
271	NC_017461	ATT	2	6	20603	20608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805078
272	NC_017461	TCC	2	6	20687	20692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805078
273	NC_017461	ATG	2	6	20793	20798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805078
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279	NC_017461	CTT	2	6	21528	21533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805079
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283	NC_017461	TCA	2	6	21659	21664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805080
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296	NC_017461	GTT	2	6	22521	22526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017461	TTC	2	6	22546	22551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_017461	CAA	2	6	22664	22669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_017461	TCC	2	6	22741	22746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805081
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301	NC_017461	CCT	2	6	22783	22788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805081
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379	NC_017461	GAA	2	6	28488	28493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805087
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382	NC_017461	GAG	2	6	28596	28601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805087
383	NC_017461	TAG	2	6	28657	28662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805087
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