MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 2104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017461	GGC	2	6	1237639	1237644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_017461	TAA	2	6	1237812	1237817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_017461	TAA	2	6	1238743	1238748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_017461	ATA	2	6	1242804	1242809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_017461	ATT	2	6	1242893	1242898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_017461	ATT	2	6	1242917	1242922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_017461	ATT	2	6	1242940	1242945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_017461	TCA	3	9	1243016	1243024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_017461	CCT	2	6	1245025	1245030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_017461	GTT	2	6	1245057	1245062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_017461	TAA	2	6	1247590	1247595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_017461	CTT	2	6	1247622	1247627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_017461	TTG	2	6	1247652	1247657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_017461	AGG	2	6	1247730	1247735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_017461	TAA	2	6	1247848	1247853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_017461	ATG	2	6	1247861	1247866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_017461	ATG	2	6	1247895	1247900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_017461	TTA	2	6	1249340	1249345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_017461	AAT	2	6	1250768	1250773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_017461	AAT	2	6	1253340	1253345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_017461	GGT	2	6	1253963	1253968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_017461	TAA	2	6	1255473	1255478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_017461	TCA	2	6	1255614	1255619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_017461	TAA	2	6	1255621	1255626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_017461	GAG	2	6	1255678	1255683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_017461	TTC	2	6	1255689	1255694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_017461	TCT	2	6	1255707	1255712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2028	NC_017461	ATT	2	6	1257648	1257653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_017461	AAT	2	6	1258889	1258894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_017461	ATT	2	6	1258904	1258909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_017461	ATT	2	6	1258914	1258919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_017461	CTT	2	6	1261063	1261068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_017461	TAA	2	6	1261079	1261084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_017461	TTA	2	6	1261121	1261126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_017461	TAA	2	6	1261160	1261165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_017461	TTA	2	6	1261285	1261290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_017461	TAA	2	6	1261332	1261337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_017461	ATT	2	6	1261350	1261355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_017461	TAG	2	6	1261472	1261477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_017461	GAA	2	6	1262910	1262915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_017461	CGT	2	6	1263280	1263285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_017461	ATT	2	6	1263555	1263560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_017461	GCC	2	6	1263617	1263622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2044	NC_017461	TGG	2	6	1263632	1263637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_017461	GAT	2	6	1263669	1263674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_017461	CTT	2	6	1267657	1267662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_017461	GAA	2	6	1267672	1267677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_017461	CCT	2	6	1267882	1267887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2049	NC_017461	TAT	2	6	1270792	1270797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_017461	ATT	2	6	1270889	1270894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_017461	AAT	2	6	1270974	1270979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_017461	CAA	2	6	1271004	1271009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_017461	TAA	2	6	1274034	1274039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_017461	TCA	2	6	1275469	1275474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2055	NC_017461	TTA	2	6	1275601	1275606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_017461	TCT	2	6	1275621	1275626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2057	NC_017461	ATA	2	6	1275627	1275632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_017461	GAA	2	6	1276056	1276061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_017461	AAG	2	6	1276074	1276079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_017461	ATT	2	6	1277434	1277439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_017461	TGT	2	6	1277465	1277470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_017461	GAG	2	6	1289786	1289791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_017461	CTC	2	6	1289823	1289828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2064	NC_017461	GAG	3	9	1290257	1290265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_017461	AAG	2	6	1290289	1290294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_017461	GAG	2	6	1290347	1290352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_017461	GCA	2	6	1290382	1290387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_017461	TAT	2	6	1290448	1290453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_017461	ATT	2	6	1292954	1292959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_017461	GTA	2	6	1293031	1293036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2071	NC_017461	TAA	2	6	1296605	1296610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_017461	ACT	2	6	1296660	1296665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2073	NC_017461	ATT	2	6	1296705	1296710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_017461	CTT	2	6	1298216	1298221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2075	NC_017461	ATT	2	6	1298331	1298336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_017461	ATT	2	6	1298357	1298362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_017461	CTG	2	6	1305623	1305628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2078	NC_017461	GAC	2	6	1305629	1305634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2079	NC_017461	ATT	2	6	1305679	1305684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_017461	ATT	2	6	1305704	1305709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_017461	ATG	2	6	1305715	1305720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_017461	CCA	2	6	1307732	1307737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2083	NC_017461	TCA	2	6	1307811	1307816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_017461	GGT	2	6	1308836	1308841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_017461	CCT	2	6	1309122	1309127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2086	NC_017461	TTA	2	6	1309226	1309231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2087	NC_017461	CAG	2	6	1309958	1309963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2088	NC_017461	AGA	2	6	1309987	1309992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_017461	TCT	3	9	1310003	1310011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_017461	TAA	2	6	1310380	1310385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_017461	GTC	2	6	1313874	1313879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_017461	TGG	2	6	1313907	1313912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_017461	CAG	2	6	1313919	1313924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2094	NC_017461	ACC	2	6	1315673	1315678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2095	NC_017461	AGC	2	6	1316022	1316027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2096	NC_017461	AGC	2	6	1316186	1316191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_017461	GAG	2	6	1316378	1316383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_017461	AGG	2	6	1316460	1316465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_017461	ACC	2	6	1316551	1316556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2100	NC_017461	ATT	2	6	1316871	1316876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_017461	CAA	2	6	1316880	1316885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_017461	AGA	2	6	1317706	1317711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_017461	CTT	2	6	1317905	1317910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_017461	GAA	2	6	1318131	1318136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.