MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL6A

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017460	GTCA	2	8	209	216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017460	GAGT	2	8	339	346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017460	GCGA	2	8	551	558	25 %	0 %	50 %	25 %	385805045
4	NC_017460	GTCT	2	8	1144	1151	0 %	50 %	25 %	25 %	385805045
5	NC_017460	GAAC	2	8	1673	1680	50 %	0 %	25 %	25 %	385805046
6	NC_017460	CGTG	2	8	1838	1845	0 %	25 %	50 %	25 %	385805046
7	NC_017460	GTCG	2	8	2363	2370	0 %	25 %	50 %	25 %	385805046
8	NC_017460	TGAC	2	8	3337	3344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017460	AATC	2	8	3636	3643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017460	CTTG	2	8	3740	3747	0 %	50 %	25 %	25 %	385805047
11	NC_017460	ATGT	2	8	3778	3785	25 %	50 %	25 %	0 %	385805047
12	NC_017460	ATCT	2	8	3833	3840	25 %	50 %	0 %	25 %	385805047
13	NC_017460	TTCT	2	8	3936	3943	0 %	75 %	0 %	25 %	385805047
14	NC_017460	GTCG	2	8	4161	4168	0 %	25 %	50 %	25 %	385805048
15	NC_017460	CGGT	2	8	5153	5160	0 %	25 %	50 %	25 %	385805049
16	NC_017460	GAAT	2	8	5438	5445	50 %	25 %	25 %	0 %	385805049
17	NC_017460	TTGC	2	8	5470	5477	0 %	50 %	25 %	25 %	385805049
18	NC_017460	TTTC	2	8	5557	5564	0 %	75 %	0 %	25 %	385805049
19	NC_017460	GTTT	2	8	5814	5821	0 %	75 %	25 %	0 %	385805050
20	NC_017460	CATA	2	8	6061	6068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017460	ACTG	2	8	6100	6107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.