MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL6A

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017460	AAG	2	6	60	65	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017460	GAC	2	6	185	190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017460	GTC	2	6	267	272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017460	GAC	2	6	423	428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805045
5	NC_017460	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805045
6	NC_017460	CGA	2	6	540	545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805045
7	NC_017460	GTC	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805045
8	NC_017460	CGA	2	6	629	634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805045
9	NC_017460	GTC	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805045
10	NC_017460	CAC	2	6	835	840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385805045
11	NC_017460	ACG	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805045
12	NC_017460	TCG	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805045
13	NC_017460	GTT	2	6	1164	1169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385805045
14	NC_017460	AAC	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805045
15	NC_017460	CGA	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805045
16	NC_017460	GAC	2	6	1228	1233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805045
17	NC_017460	CGA	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805046
18	NC_017460	CGC	2	6	1293	1298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805046
19	NC_017460	ACG	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805046
20	NC_017460	CGT	2	6	1608	1613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805046
21	NC_017460	ACG	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805046
22	NC_017460	TTA	2	6	1985	1990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805046
23	NC_017460	ACT	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805046
24	NC_017460	GAC	2	6	2154	2159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805046
25	NC_017460	CGA	2	6	2174	2179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805046
26	NC_017460	GGT	2	6	2439	2444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805046
27	NC_017460	GAC	2	6	2479	2484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805046
28	NC_017460	CAA	2	6	2607	2612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805046
29	NC_017460	CGC	2	6	2624	2629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805046
30	NC_017460	TTG	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385805046
31	NC_017460	ATC	2	6	2748	2753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805046
32	NC_017460	AAG	2	6	2779	2784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805046
33	NC_017460	GAC	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805046
34	NC_017460	CTC	2	6	2952	2957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805046
35	NC_017460	CGA	2	6	2991	2996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017460	TCG	2	6	3048	3053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017460	GTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017460	TGT	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017460	AAG	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017460	GAG	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017460	GAC	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017460	ATC	2	6	3717	3722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805047
43	NC_017460	GGT	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805047
44	NC_017460	CCT	2	6	3788	3793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805047
45	NC_017460	CGA	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805047
46	NC_017460	TTA	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805047
47	NC_017460	CGG	2	6	4064	4069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017460	GTC	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805048
49	NC_017460	GGT	2	6	4155	4160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805048
50	NC_017460	ACA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805048
51	NC_017460	CTT	2	6	4295	4300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805048
52	NC_017460	TCA	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805048
53	NC_017460	GAT	2	6	4360	4365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805048
54	NC_017460	AGT	2	6	4366	4371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805048
55	NC_017460	CGT	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805048
56	NC_017460	CGG	2	6	4850	4855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385805048
57	NC_017460	ATA	2	6	4900	4905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805048
58	NC_017460	CAC	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385805048
59	NC_017460	ATC	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805048
60	NC_017460	ATT	2	6	4978	4983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805048
61	NC_017460	ATC	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805049
62	NC_017460	CAT	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805049
63	NC_017460	TCC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805049
64	NC_017460	TTG	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385805049
65	NC_017460	ACA	2	6	5247	5252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805049
66	NC_017460	TTG	2	6	5258	5263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385805049
67	NC_017460	GTC	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805049
68	NC_017460	GAA	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805049
69	NC_017460	CGT	3	9	5587	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805049
70	NC_017460	GGT	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805049
71	NC_017460	TGA	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805050
72	NC_017460	ACC	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385805050
73	NC_017460	TCA	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805050

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.