MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 8870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017459	ACCC	2	8	253	260	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017459	TGGA	2	8	370	377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017459	AGAT	2	8	544	551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017459	GTCA	2	8	1164	1171	25 %	25 %	25 %	25 %	385802383
5	NC_017459	TCAA	2	8	1337	1344	50 %	25 %	0 %	25 %	385802383
6	NC_017459	TTCA	2	8	1871	1878	25 %	50 %	0 %	25 %	385802383
7	NC_017459	ACTT	2	8	1963	1970	25 %	50 %	0 %	25 %	385802383
8	NC_017459	AATT	2	8	2421	2428	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
9	NC_017459	ATAA	2	8	2794	2801	75 %	25 %	0 %	0 %	385802384
10	NC_017459	TCAC	2	8	2909	2916	25 %	25 %	0 %	50 %	385802384
11	NC_017459	CAAC	2	8	3419	3426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017459	ACCA	2	8	3431	3438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017459	AATT	2	8	3498	3505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017459	GTTA	2	8	4162	4169	25 %	50 %	25 %	0 %	385802385
15	NC_017459	TCGA	2	8	4177	4184	25 %	25 %	25 %	25 %	385802385
16	NC_017459	GGCA	2	8	5070	5077	25 %	0 %	50 %	25 %	385802385
17	NC_017459	CGGT	2	8	5093	5100	0 %	25 %	50 %	25 %	385802385
18	NC_017459	CTCA	2	8	5435	5442	25 %	25 %	0 %	50 %	385802386
19	NC_017459	GTTT	2	8	5596	5603	0 %	75 %	25 %	0 %	385802386
20	NC_017459	ATAA	2	8	7172	7179	75 %	25 %	0 %	0 %	385802387
21	NC_017459	AATA	2	8	7300	7307	75 %	25 %	0 %	0 %	385802387
22	NC_017459	AAGT	2	8	7390	7397	50 %	25 %	25 %	0 %	385802387
23	NC_017459	ACAG	2	8	7469	7476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017459	TGAG	2	8	7635	7642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017459	GAAC	2	8	7645	7652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017459	GCGT	2	8	7703	7710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017459	CGGT	2	8	7967	7974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017459	TCAA	2	8	8400	8407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017459	AGAT	2	8	8415	8422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017459	GTTC	2	8	8432	8439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017459	ATAC	2	8	9234	9241	50 %	25 %	0 %	25 %	385802388
32	NC_017459	TCAC	2	8	9296	9303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017459	GGGT	2	8	9620	9627	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017459	AAAC	2	8	10085	10092	75 %	0 %	0 %	25 %	385802389
35	NC_017459	CGTC	2	8	10739	10746	0 %	25 %	25 %	50 %	385802390
36	NC_017459	CATA	2	8	10819	10826	50 %	25 %	0 %	25 %	385802390
37	NC_017459	ACAA	2	8	10838	10845	75 %	0 %	0 %	25 %	385802390
38	NC_017459	GCTG	2	8	10935	10942	0 %	25 %	50 %	25 %	385802390
39	NC_017459	AGCA	2	8	11378	11385	50 %	0 %	25 %	25 %	385802390
40	NC_017459	ATTG	2	8	12172	12179	25 %	50 %	25 %	0 %	385802390
41	NC_017459	GTTT	2	8	12330	12337	0 %	75 %	25 %	0 %	385802390
42	NC_017459	ATGA	2	8	13023	13030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017459	CTTC	2	8	13560	13567	0 %	50 %	0 %	50 %	385802392
44	NC_017459	CATA	2	8	13696	13703	50 %	25 %	0 %	25 %	385802393
45	NC_017459	TCGT	2	8	13799	13806	0 %	50 %	25 %	25 %	385802393
46	NC_017459	ACAG	2	8	14037	14044	50 %	0 %	25 %	25 %	385802393
47	NC_017459	TCGT	2	8	14072	14079	0 %	50 %	25 %	25 %	385802393
48	NC_017459	TGGA	2	8	14105	14112	25 %	25 %	50 %	0 %	385802393
49	NC_017459	GATT	2	8	14676	14683	25 %	50 %	25 %	0 %	385802393
50	NC_017459	AATA	2	8	15244	15251	75 %	25 %	0 %	0 %	385802393
51	NC_017459	CGAC	2	8	15583	15590	25 %	0 %	25 %	50 %	385802393
52	NC_017459	CACT	2	8	16929	16936	25 %	25 %	0 %	50 %	385802394
53	NC_017459	GGAA	2	8	17136	17143	50 %	0 %	50 %	0 %	385802394
54	NC_017459	TTCT	2	8	17713	17720	0 %	75 %	0 %	25 %	385802395
55	NC_017459	GTAT	2	8	17765	17772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017459	AGTG	2	8	17833	17840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017459	TTGT	2	8	17876	17883	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017459	GATA	2	8	18634	18641	50 %	25 %	25 %	0 %	385802396
59	NC_017459	GTAC	2	8	18919	18926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017459	GACA	2	8	19092	19099	50 %	0 %	25 %	25 %	385802397
61	NC_017459	GACT	2	8	19831	19838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017459	AATG	2	8	20002	20009	50 %	25 %	25 %	0 %	385802398
63	NC_017459	TTTA	2	8	20260	20267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017459	TGAG	3	12	20334	20345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017459	TCGT	2	8	20442	20449	0 %	50 %	25 %	25 %	385802399
66	NC_017459	AGTG	2	8	21254	21261	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017459	ATTT	2	8	21847	21854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017459	TTCT	2	8	22592	22599	0 %	75 %	0 %	25 %	385802400
69	NC_017459	GAGC	2	8	23119	23126	25 %	0 %	50 %	25 %	385802401
70	NC_017459	CACT	2	8	23458	23465	25 %	25 %	0 %	50 %	385802401
71	NC_017459	TTCG	2	8	23551	23558	0 %	50 %	25 %	25 %	385802401
72	NC_017459	ATGG	2	8	23709	23716	25 %	25 %	50 %	0 %	385802401
73	NC_017459	GCAG	2	8	23724	23731	25 %	0 %	50 %	25 %	385802401
74	NC_017459	AAGG	2	8	24459	24466	50 %	0 %	50 %	0 %	385802402
75	NC_017459	ACGC	2	8	24774	24781	25 %	0 %	25 %	50 %	385802402
76	NC_017459	TCAG	2	8	24824	24831	25 %	25 %	25 %	25 %	385802402
77	NC_017459	TCAA	2	8	24932	24939	50 %	25 %	0 %	25 %	385802402
78	NC_017459	CAAA	2	8	25604	25611	75 %	0 %	0 %	25 %	385802402
79	NC_017459	CTAT	2	8	26743	26750	25 %	50 %	0 %	25 %	385802403
80	NC_017459	AATT	2	8	27005	27012	50 %	50 %	0 %	0 %	385802403
81	NC_017459	TCAT	2	8	27293	27300	25 %	50 %	0 %	25 %	385802403
82	NC_017459	AGAA	2	8	27305	27312	75 %	0 %	25 %	0 %	385802403
83	NC_017459	CGAC	2	8	27482	27489	25 %	0 %	25 %	50 %	385802403
84	NC_017459	TCCC	2	8	27786	27793	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017459	GAGT	2	8	28181	28188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017459	TTCA	2	8	29252	29259	25 %	50 %	0 %	25 %	385802405
87	NC_017459	AATC	2	8	29897	29904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017459	GCTG	2	8	30268	30275	0 %	25 %	50 %	25 %	385802406
89	NC_017459	AACC	2	8	30324	30331	50 %	0 %	0 %	50 %	385802406
90	NC_017459	GACT	2	8	31195	31202	25 %	25 %	25 %	25 %	385802406
91	NC_017459	GAAT	2	8	31777	31784	50 %	25 %	25 %	0 %	385802407
92	NC_017459	TCAA	2	8	32129	32136	50 %	25 %	0 %	25 %	385802407
93	NC_017459	ATTC	2	8	32946	32953	25 %	50 %	0 %	25 %	385802408
94	NC_017459	AACT	2	8	33163	33170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017459	CCGA	2	8	33665	33672	25 %	0 %	25 %	50 %	385802409
96	NC_017459	CGGT	2	8	34232	34239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017459	CCCG	2	8	34274	34281	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_017459	GACC	2	8	34338	34345	25 %	0 %	25 %	50 %	385802410
99	NC_017459	CCAA	2	8	34942	34949	50 %	0 %	0 %	50 %	385802410
100	NC_017459	ACTT	2	8	35937	35944	25 %	50 %	0 %	25 %	385802411
101	NC_017459	TATC	2	8	36213	36220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017459	GTTA	2	8	36617	36624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017459	TCTG	2	8	37030	37037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017459	CGAG	3	12	37040	37051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017459	CCTC	2	8	37059	37066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_017459	GATT	2	8	37090	37097	25 %	50 %	25 %	0 %	385802414
107	NC_017459	CGTC	2	8	37521	37528	0 %	25 %	25 %	50 %	385802415
108	NC_017459	GCTC	2	8	37948	37955	0 %	25 %	25 %	50 %	385802415
109	NC_017459	GATT	2	8	37979	37986	25 %	50 %	25 %	0 %	385802415
110	NC_017459	TTAT	2	8	38107	38114	25 %	75 %	0 %	0 %	385802415
111	NC_017459	GCAC	2	8	39202	39209	25 %	0 %	25 %	50 %	385802417
112	NC_017459	GGAT	2	8	39589	39596	25 %	25 %	50 %	0 %	385802417
113	NC_017459	ATGG	2	8	39679	39686	25 %	25 %	50 %	0 %	385802417
114	NC_017459	GGGT	2	8	40439	40446	0 %	25 %	75 %	0 %	385802418
115	NC_017459	AACC	2	8	41084	41091	50 %	0 %	0 %	50 %	385802418
116	NC_017459	TCAC	2	8	41197	41204	25 %	25 %	0 %	50 %	385802418
117	NC_017459	CTTC	2	8	41458	41465	0 %	50 %	0 %	50 %	385802418
118	NC_017459	TGGT	2	8	41757	41764	0 %	50 %	50 %	0 %	385802418
119	NC_017459	GCTT	2	8	41788	41795	0 %	50 %	25 %	25 %	385802418
120	NC_017459	ATGG	2	8	41833	41840	25 %	25 %	50 %	0 %	385802418
121	NC_017459	ATCT	2	8	41903	41910	25 %	50 %	0 %	25 %	385802418
122	NC_017459	TTAA	2	8	42288	42295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017459	CTGT	2	8	42953	42960	0 %	50 %	25 %	25 %	385802419
124	NC_017459	AGAC	2	8	43715	43722	50 %	0 %	25 %	25 %	385802421
125	NC_017459	CGAC	2	8	43784	43791	25 %	0 %	25 %	50 %	385802421
126	NC_017459	GAAT	2	8	44144	44151	50 %	25 %	25 %	0 %	385802422
127	NC_017459	AGCG	2	8	44210	44217	25 %	0 %	50 %	25 %	385802422
128	NC_017459	ATTG	2	8	44789	44796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017459	TTAT	2	8	44808	44815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017459	TCTA	2	8	44823	44830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017459	ATGG	2	8	46278	46285	25 %	25 %	50 %	0 %	385802424
132	NC_017459	CCGA	2	8	46845	46852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017459	ATCA	2	8	47020	47027	50 %	25 %	0 %	25 %	385802425
134	NC_017459	ATCC	2	8	48085	48092	25 %	25 %	0 %	50 %	385802425
135	NC_017459	TTCA	2	8	48412	48419	25 %	50 %	0 %	25 %	385802425
136	NC_017459	CTGT	2	8	48632	48639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017459	TATG	2	8	48651	48658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017459	AATG	2	8	48883	48890	50 %	25 %	25 %	0 %	385802426
139	NC_017459	GTCC	2	8	49328	49335	0 %	25 %	25 %	50 %	385802426
140	NC_017459	CATG	2	8	49372	49379	25 %	25 %	25 %	25 %	385802426
141	NC_017459	AAAT	2	8	49672	49679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017459	CCCG	2	8	50518	50525	0 %	0 %	25 %	75 %	385802427
143	NC_017459	ACCC	2	8	50540	50547	25 %	0 %	0 %	75 %	385802427
144	NC_017459	TCAG	2	8	51179	51186	25 %	25 %	25 %	25 %	385802428
145	NC_017459	GCTC	2	8	52868	52875	0 %	25 %	25 %	50 %	385802428
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184	NC_017459	CATG	2	8	65936	65943	25 %	25 %	25 %	25 %	385802436
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272	NC_017459	AATC	2	8	98516	98523	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_017459	GTCG	2	8	99898	99905	0 %	25 %	50 %	25 %	385802462
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286	NC_017459	TCGT	2	8	104052	104059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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