MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 10313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017459	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017459	AAG	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017459	TCT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017459	ACA	2	6	150	155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017459	ACG	2	6	162	167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017459	ACT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017459	AGA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017459	TGA	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017459	CAT	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017459	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017459	TAA	2	6	3324	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017459	CGT	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017459	TAA	2	6	3373	3378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017459	GAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017459	TCT	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017459	AAT	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017459	GTG	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017459	TAT	3	9	5900	5908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017459	TAT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017459	GCA	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017459	CTT	2	6	7627	7632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017459	AAT	2	6	7674	7679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017459	CGA	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017459	GGC	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017459	CAC	2	6	8019	8024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017459	CTG	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017459	AGT	2	6	8139	8144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017459	AGT	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017459	CAG	2	6	8156	8161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017459	CCA	2	6	8245	8250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017459	TCC	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017459	GGA	3	9	8389	8397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017459	ACT	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017459	CAA	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017459	TGT	2	6	8510	8515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017459	AAT	2	6	8567	8572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017459	CGA	2	6	9249	9254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017459	GTA	2	6	9260	9265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017459	TGG	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017459	ACT	2	6	9421	9426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017459	CTC	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017459	ATA	2	6	9464	9469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017459	ATT	2	6	9489	9494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017459	TCG	2	6	9498	9503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017459	TTG	2	6	12619	12624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017459	CGG	2	6	12651	12656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017459	TAC	2	6	12661	12666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017459	ACT	2	6	13058	13063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017459	TCG	2	6	13068	13073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017459	ATT	2	6	13119	13124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017459	ATT	2	6	13186	13191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017459	ATT	2	6	13333	13338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017459	ACA	2	6	13356	13361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017459	GAG	2	6	16006	16011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017459	CCA	2	6	16062	16067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017459	GGA	2	6	17486	17491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017459	CAA	2	6	17754	17759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017459	GAT	2	6	17817	17822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017459	AAT	2	6	17892	17897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017459	GTG	2	6	18018	18023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017459	CAA	2	6	18036	18041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017459	TTG	2	6	18049	18054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017459	CTC	2	6	18849	18854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017459	TTA	2	6	19415	19420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017459	CTT	2	6	19559	19564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017459	CTT	2	6	19584	19589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017459	CTT	2	6	19623	19628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017459	ATC	2	6	19660	19665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017459	CGT	2	6	19725	19730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017459	CAC	2	6	19918	19923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017459	TAT	2	6	19926	19931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017459	TCG	2	6	19936	19941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017459	TGA	2	6	20246	20251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017459	TAT	2	6	20361	20366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017459	TGT	2	6	21179	21184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017459	TCA	2	6	21245	21250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017459	ACA	2	6	21299	21304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017459	ACT	2	6	21357	21362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017459	GAT	2	6	21590	21595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017459	ATA	2	6	21745	21750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017459	TAT	2	6	21835	21840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017459	CAC	2	6	23856	23861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017459	ACT	2	6	27613	27618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017459	AGC	2	6	27644	27649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017459	CAA	2	6	27669	27674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017459	TTC	2	6	27751	27756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017459	GTT	2	6	27860	27865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017459	CCG	2	6	28073	28078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017459	ATC	2	6	28228	28233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017459	TGT	2	6	29879	29884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017459	ATT	2	6	31401	31406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017459	ACC	2	6	31444	31449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017459	ATA	2	6	31518	31523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017459	GAT	2	6	32456	32461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017459	CTG	2	6	33217	33222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017459	ATT	2	6	33238	33243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017459	AAT	2	6	33310	33315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017459	GAG	2	6	33833	33838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017459	ATG	2	6	34171	34176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017459	TTC	2	6	34204	34209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017459	TAT	2	6	35091	35096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017459	AGT	2	6	35112	35117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017459	TAG	2	6	35162	35167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017459	CTC	2	6	35227	35232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017459	CAC	2	6	35409	35414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017459	CAT	2	6	35421	35426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017459	CAT	3	9	36180	36188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017459	ATA	2	6	37073	37078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017459	CAT	2	6	38751	38756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017459	ATC	2	6	40136	40141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017459	GCT	2	6	42049	42054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017459	ACT	2	6	42072	42077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017459	GTT	2	6	42105	42110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017459	CAT	2	6	42173	42178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017459	TAA	2	6	42248	42253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017459	CTG	2	6	43082	43087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017459	ATG	2	6	43180	43185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017459	ATA	2	6	43657	43662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017459	AAT	2	6	43694	43699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017459	ATA	2	6	43704	43709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017459	GTA	2	6	43982	43987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017459	TGT	2	6	45225	45230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017459	AAC	2	6	45316	45321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017459	CAC	2	6	45372	45377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017459	CAT	2	6	46681	46686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017459	GAG	2	6	46874	46879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017459	TTC	2	6	48612	48617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017459	CAA	2	6	49430	49435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017459	TAT	2	6	49478	49483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017459	ATT	2	6	49500	49505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017459	ACA	2	6	49624	49629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017459	CAG	2	6	49681	49686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017459	TGG	2	6	49763	49768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017459	CGG	2	6	49881	49886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017459	GAG	2	6	49936	49941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017459	TGA	2	6	49970	49975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017459	ACG	2	6	53250	53255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017459	TAT	2	6	53318	53323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017459	CAC	3	9	53332	53340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017459	TCT	2	6	53497	53502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017459	ACG	2	6	53582	53587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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