MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 36568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017459	ATA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802383
2	NC_017459	AAC	2	6	744	749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802383
3	NC_017459	ATC	2	6	770	775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
4	NC_017459	TGA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
5	NC_017459	ACA	2	6	856	861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802383
6	NC_017459	GAT	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
7	NC_017459	AGA	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802383
8	NC_017459	CAT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
9	NC_017459	ATG	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
10	NC_017459	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
11	NC_017459	TCA	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
12	NC_017459	TGA	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
13	NC_017459	TGA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
14	NC_017459	TGA	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
15	NC_017459	GAA	2	6	1533	1538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802383
16	NC_017459	TGA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
17	NC_017459	TTG	2	6	1654	1659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802383
18	NC_017459	TGA	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
19	NC_017459	ATG	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
20	NC_017459	TTC	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802383
21	NC_017459	TGC	2	6	1916	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802383
22	NC_017459	GCT	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802383
23	NC_017459	ATC	2	6	2118	2123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
24	NC_017459	TTG	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802383
25	NC_017459	TGC	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802384
26	NC_017459	TCA	2	6	2675	2680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802384
27	NC_017459	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802384
28	NC_017459	CCA	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802384
29	NC_017459	GAC	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802384
30	NC_017459	GTT	2	6	2903	2908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802384
31	NC_017459	CAC	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802384
32	NC_017459	GGC	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802384
33	NC_017459	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802384
34	NC_017459	GAT	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
35	NC_017459	CTG	3	9	3714	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
36	NC_017459	ATA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
37	NC_017459	AAT	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
38	NC_017459	TCA	2	6	3896	3901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802385
39	NC_017459	TCA	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802385
40	NC_017459	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802385
41	NC_017459	TTG	2	6	4203	4208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
42	NC_017459	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802385
43	NC_017459	TGT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
44	NC_017459	TGA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
45	NC_017459	CTG	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
46	NC_017459	GCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802385
47	NC_017459	ATG	2	6	4461	4466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
48	NC_017459	TGC	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
49	NC_017459	GAT	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
50	NC_017459	TTG	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
51	NC_017459	TTC	2	6	4659	4664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802385
52	NC_017459	ACG	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802385
53	NC_017459	TGA	3	9	4717	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
54	NC_017459	ATG	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
55	NC_017459	TGA	2	6	4828	4833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
56	NC_017459	ATG	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
57	NC_017459	CTC	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802385
58	NC_017459	TAA	2	6	4971	4976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
59	NC_017459	ATG	2	6	5040	5045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
60	NC_017459	GTT	3	9	5355	5363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
61	NC_017459	GCA	3	9	5415	5423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802386
62	NC_017459	ACA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802386
63	NC_017459	CGC	2	6	5477	5482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802386
64	NC_017459	TTG	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
65	NC_017459	TTC	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802386
66	NC_017459	GTT	2	6	5661	5666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
67	NC_017459	TCA	2	6	5679	5684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802386
68	NC_017459	TGT	2	6	5711	5716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
69	NC_017459	TGG	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
70	NC_017459	CGG	2	6	6300	6305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802387
71	NC_017459	TGT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
72	NC_017459	TGA	2	6	6373	6378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
73	NC_017459	CGC	2	6	6391	6396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802387
74	NC_017459	GTG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
75	NC_017459	TGA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
76	NC_017459	ATT	2	6	6521	6526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802387
77	NC_017459	GTG	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
78	NC_017459	TGT	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
79	NC_017459	ATG	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
80	NC_017459	ACA	2	6	6647	6652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802387
81	NC_017459	CGG	2	6	6667	6672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802387
82	NC_017459	GTT	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
83	NC_017459	TGA	2	6	6750	6755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
84	NC_017459	GTT	2	6	6770	6775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
85	NC_017459	TGA	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
86	NC_017459	GTG	2	6	6834	6839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
87	NC_017459	GAC	2	6	6878	6883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802387
88	NC_017459	CGA	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802387
89	NC_017459	TGA	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
90	NC_017459	TCG	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802387
91	NC_017459	GCA	3	9	8716	8724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802388
92	NC_017459	TTC	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802388
93	NC_017459	TGT	2	6	8802	8807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802388
94	NC_017459	CAT	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802388
95	NC_017459	TAA	3	9	8858	8866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802388
96	NC_017459	GAT	2	6	8880	8885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802388
97	NC_017459	GAG	2	6	8896	8901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802388
98	NC_017459	TAT	2	6	8930	8935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802388
99	NC_017459	ATC	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802388
100	NC_017459	TCT	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802388
101	NC_017459	TCT	2	6	9053	9058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802388
102	NC_017459	ATT	2	6	9096	9101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802388
103	NC_017459	GCT	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802388
104	NC_017459	ACG	2	6	9127	9132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802388
105	NC_017459	TGA	2	6	9180	9185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802388
106	NC_017459	AAT	2	6	9213	9218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802388
107	NC_017459	ACA	2	6	9700	9705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802389
108	NC_017459	ACC	2	6	9831	9836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802389
109	NC_017459	AAC	2	6	9922	9927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802389
110	NC_017459	ATT	3	9	9954	9962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802389
111	NC_017459	TTG	2	6	10046	10051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802389
112	NC_017459	TCA	2	6	10278	10283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802390
113	NC_017459	CTG	2	6	10561	10566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802390
114	NC_017459	GAG	2	6	10571	10576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802390
115	NC_017459	TCG	2	6	10722	10727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802390
116	NC_017459	TCA	2	6	10887	10892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802390
117	NC_017459	AAT	2	6	11030	11035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802390
118	NC_017459	GCA	2	6	11040	11045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802390
119	NC_017459	ATG	2	6	11118	11123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802390
120	NC_017459	TTG	2	6	11263	11268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802390
121	NC_017459	TCA	2	6	11355	11360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802390
122	NC_017459	CAT	2	6	11432	11437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802390
123	NC_017459	TGA	2	6	11439	11444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802390
124	NC_017459	CGC	2	6	11493	11498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802390
125	NC_017459	CGA	2	6	11517	11522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802390
126	NC_017459	GCA	2	6	11541	11546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802390
127	NC_017459	GCA	2	6	11559	11564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802390
128	NC_017459	CTG	2	6	11617	11622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802390
129	NC_017459	ATG	2	6	11728	11733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802390
130	NC_017459	TCG	2	6	11801	11806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802390
131	NC_017459	CAA	2	6	11869	11874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802390
132	NC_017459	CAT	2	6	11926	11931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802390
133	NC_017459	TCA	2	6	12150	12155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802390
134	NC_017459	CAA	2	6	12157	12162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802390
135	NC_017459	CAT	2	6	12190	12195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802390
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239	NC_017459	ATA	2	6	20714	20719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802399
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241	NC_017459	AAT	2	6	20726	20731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802399
242	NC_017459	CCA	2	6	20753	20758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802399
243	NC_017459	TGC	2	6	20781	20786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802399
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247	NC_017459	TGC	2	6	21011	21016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802399
248	NC_017459	ATA	2	6	21039	21044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802399
249	NC_017459	CTG	2	6	21053	21058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802399
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251	NC_017459	CCG	2	6	22039	22044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802400
252	NC_017459	CGT	2	6	22075	22080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802400
253	NC_017459	GCG	2	6	22125	22130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802400
254	NC_017459	TGG	2	6	22133	22138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802400
255	NC_017459	TTC	2	6	22203	22208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802400
256	NC_017459	TCG	2	6	22279	22284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802400
257	NC_017459	TAT	2	6	22324	22329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802400
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259	NC_017459	TGG	2	6	22420	22425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802400
260	NC_017459	CGA	2	6	22439	22444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802400
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268	NC_017459	TGG	2	6	22993	22998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802401
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274	NC_017459	ATC	2	6	23495	23500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802401
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280	NC_017459	TCG	2	6	23964	23969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802402
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283	NC_017459	GAT	2	6	24228	24233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802402
284	NC_017459	AGC	2	6	24236	24241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802402
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370	NC_017459	ATG	2	6	30941	30946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802406
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372	NC_017459	GCC	2	6	31258	31263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802406
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496	NC_017459	ATG	2	6	41826	41831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802418
497	NC_017459	TCA	2	6	42386	42391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802419
498	NC_017459	CTT	2	6	42450	42455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802419
499	NC_017459	CAA	2	6	42468	42473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802419
500	NC_017459	ATA	2	6	42499	42504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802419

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