MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 7032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017459	TA	3	6	201	206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017459	TA	3	6	240	245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017459	AT	3	6	617	622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017459	AT	3	6	1448	1453	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
5	NC_017459	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
6	NC_017459	CA	3	6	4493	4498	50 %	0 %	0 %	50 %	385802385
7	NC_017459	TG	3	6	5538	5543	0 %	50 %	50 %	0 %	385802386
8	NC_017459	AC	3	6	5854	5859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017459	TC	3	6	6171	6176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017459	CT	3	6	6464	6469	0 %	50 %	0 %	50 %	385802387
11	NC_017459	TG	3	6	6992	6997	0 %	50 %	50 %	0 %	385802387
12	NC_017459	TC	3	6	7045	7050	0 %	50 %	0 %	50 %	385802387
13	NC_017459	CT	3	6	7454	7459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017459	CT	3	6	8060	8065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017459	TC	3	6	8537	8542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017459	GA	3	6	8624	8629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017459	GA	3	6	9149	9154	50 %	0 %	50 %	0 %	385802388
18	NC_017459	AT	3	6	9266	9271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017459	AT	3	6	10021	10026	50 %	50 %	0 %	0 %	385802389
20	NC_017459	AT	3	6	11337	11342	50 %	50 %	0 %	0 %	385802390
21	NC_017459	GT	3	6	11860	11865	0 %	50 %	50 %	0 %	385802390
22	NC_017459	AG	3	6	12050	12055	50 %	0 %	50 %	0 %	385802390
23	NC_017459	AT	3	6	12366	12371	50 %	50 %	0 %	0 %	385802390
24	NC_017459	AT	4	8	12589	12596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017459	AT	3	6	13039	13044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017459	AT	3	6	14311	14316	50 %	50 %	0 %	0 %	385802393
27	NC_017459	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	385802393
28	NC_017459	CT	3	6	15106	15111	0 %	50 %	0 %	50 %	385802393
29	NC_017459	GA	3	6	15297	15302	50 %	0 %	50 %	0 %	385802393
30	NC_017459	AG	3	6	15877	15882	50 %	0 %	50 %	0 %	385802393
31	NC_017459	TC	3	6	16629	16634	0 %	50 %	0 %	50 %	385802394
32	NC_017459	GT	3	6	16971	16976	0 %	50 %	50 %	0 %	385802394
33	NC_017459	TC	3	6	17010	17015	0 %	50 %	0 %	50 %	385802394
34	NC_017459	TC	3	6	17936	17941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017459	GT	3	6	17942	17947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017459	AT	3	6	18252	18257	50 %	50 %	0 %	0 %	385802396
37	NC_017459	TG	4	8	18970	18977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017459	TC	3	6	19260	19265	0 %	50 %	0 %	50 %	385802397
39	NC_017459	CG	4	8	19266	19273	0 %	0 %	50 %	50 %	385802397
40	NC_017459	TC	3	6	21491	21496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017459	AT	3	6	22152	22157	50 %	50 %	0 %	0 %	385802400
42	NC_017459	TA	3	6	23606	23611	50 %	50 %	0 %	0 %	385802401
43	NC_017459	CG	3	6	24357	24362	0 %	0 %	50 %	50 %	385802402
44	NC_017459	TC	3	6	25085	25090	0 %	50 %	0 %	50 %	385802402
45	NC_017459	AT	3	6	25597	25602	50 %	50 %	0 %	0 %	385802402
46	NC_017459	AG	5	10	25712	25721	50 %	0 %	50 %	0 %	385802402
47	NC_017459	GA	3	6	26269	26274	50 %	0 %	50 %	0 %	385802402
48	NC_017459	AT	3	6	26901	26906	50 %	50 %	0 %	0 %	385802403
49	NC_017459	AC	3	6	27457	27462	50 %	0 %	0 %	50 %	385802403
50	NC_017459	TC	3	6	27470	27475	0 %	50 %	0 %	50 %	385802403
51	NC_017459	AT	3	6	27605	27610	50 %	50 %	0 %	0 %	385802403
52	NC_017459	TC	3	6	27622	27627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017459	TG	3	6	27680	27685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017459	GA	3	6	27708	27713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017459	CT	3	6	27811	27816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017459	AT	3	6	27998	28003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017459	GA	3	6	28488	28493	50 %	0 %	50 %	0 %	385802404
58	NC_017459	AT	3	6	28857	28862	50 %	50 %	0 %	0 %	385802405
59	NC_017459	AT	3	6	29856	29861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017459	AT	3	6	29908	29913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017459	AT	3	6	30307	30312	50 %	50 %	0 %	0 %	385802406
62	NC_017459	AT	3	6	30889	30894	50 %	50 %	0 %	0 %	385802406
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64	NC_017459	TA	3	6	32364	32369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017459	CG	3	6	33037	33042	0 %	0 %	50 %	50 %	385802408
66	NC_017459	TA	3	6	33731	33736	50 %	50 %	0 %	0 %	385802409
67	NC_017459	AT	3	6	34146	34151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017459	AT	3	6	34329	34334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017459	AT	3	6	34824	34829	50 %	50 %	0 %	0 %	385802410
70	NC_017459	CT	3	6	35021	35026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017459	GA	3	6	35068	35073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017459	AT	3	6	35428	35433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017459	AT	3	6	35527	35532	50 %	50 %	0 %	0 %	385802411
74	NC_017459	CA	3	6	35693	35698	50 %	0 %	0 %	50 %	385802411
75	NC_017459	CG	4	8	35853	35860	0 %	0 %	50 %	50 %	385802411
76	NC_017459	TG	3	6	36118	36123	0 %	50 %	50 %	0 %	385802411
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80	NC_017459	AT	3	6	38673	38678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017459	AT	3	6	38815	38820	50 %	50 %	0 %	0 %	385802416
82	NC_017459	CA	3	6	38896	38901	50 %	0 %	0 %	50 %	385802416
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84	NC_017459	GA	3	6	39803	39808	50 %	0 %	50 %	0 %	385802417
85	NC_017459	AT	3	6	40549	40554	50 %	50 %	0 %	0 %	385802418
86	NC_017459	AT	4	8	40697	40704	50 %	50 %	0 %	0 %	385802418
87	NC_017459	AT	3	6	42185	42190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_017459	CT	3	6	42557	42562	0 %	50 %	0 %	50 %	385802419
90	NC_017459	AT	3	6	43033	43038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017459	AC	3	6	43049	43054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017459	TA	3	6	43197	43202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017459	CT	3	6	43324	43329	0 %	50 %	0 %	50 %	385802420
94	NC_017459	CG	3	6	44776	44781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017459	TA	3	6	45310	45315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017459	GC	3	6	45857	45862	0 %	0 %	50 %	50 %	385802424
97	NC_017459	TA	3	6	46164	46169	50 %	50 %	0 %	0 %	385802424
98	NC_017459	AG	3	6	46727	46732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017459	CG	3	6	47210	47215	0 %	0 %	50 %	50 %	385802425
100	NC_017459	AT	3	6	47597	47602	50 %	50 %	0 %	0 %	385802425
101	NC_017459	AC	3	6	47619	47624	50 %	0 %	0 %	50 %	385802425
102	NC_017459	GC	3	6	47996	48001	0 %	0 %	50 %	50 %	385802425
103	NC_017459	AT	3	6	48062	48067	50 %	50 %	0 %	0 %	385802425
104	NC_017459	TG	3	6	48657	48662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017459	CT	3	6	48801	48806	0 %	50 %	0 %	50 %	385802426
106	NC_017459	AT	3	6	49536	49541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017459	CA	3	6	49757	49762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017459	CG	3	6	50773	50778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017459	GC	3	6	51191	51196	0 %	0 %	50 %	50 %	385802428
110	NC_017459	AG	3	6	51742	51747	50 %	0 %	50 %	0 %	385802428
111	NC_017459	GT	3	6	52565	52570	0 %	50 %	50 %	0 %	385802428
112	NC_017459	CA	3	6	52689	52694	50 %	0 %	0 %	50 %	385802428
113	NC_017459	TG	3	6	53230	53235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017459	TC	3	6	53575	53580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017459	AG	3	6	53914	53919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017459	TC	3	6	54376	54381	0 %	50 %	0 %	50 %	385802429
117	NC_017459	TC	3	6	54621	54626	0 %	50 %	0 %	50 %	385802429
118	NC_017459	GT	3	6	54954	54959	0 %	50 %	50 %	0 %	385802429
119	NC_017459	AT	3	6	55103	55108	50 %	50 %	0 %	0 %	385802429
120	NC_017459	TC	3	6	55389	55394	0 %	50 %	0 %	50 %	385802430
121	NC_017459	CG	3	6	55800	55805	0 %	0 %	50 %	50 %	385802430
122	NC_017459	AT	3	6	55974	55979	50 %	50 %	0 %	0 %	385802430
123	NC_017459	CA	3	6	55992	55997	50 %	0 %	0 %	50 %	385802430
124	NC_017459	AC	3	6	56327	56332	50 %	0 %	0 %	50 %	385802430
125	NC_017459	CA	3	6	57054	57059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017459	AT	3	6	57165	57170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017459	CG	3	6	58290	58295	0 %	0 %	50 %	50 %	385802431
128	NC_017459	AC	3	6	58314	58319	50 %	0 %	0 %	50 %	385802431
129	NC_017459	TC	3	6	58982	58987	0 %	50 %	0 %	50 %	385802432
130	NC_017459	AC	3	6	60540	60545	50 %	0 %	0 %	50 %	385802432
131	NC_017459	AC	3	6	61081	61086	50 %	0 %	0 %	50 %	385802433
132	NC_017459	CG	3	6	61228	61233	0 %	0 %	50 %	50 %	385802433
133	NC_017459	GT	3	6	61379	61384	0 %	50 %	50 %	0 %	385802433
134	NC_017459	AG	3	6	62029	62034	50 %	0 %	50 %	0 %	385802433
135	NC_017459	CA	5	10	62062	62071	50 %	0 %	0 %	50 %	385802433
136	NC_017459	GA	3	6	62664	62669	50 %	0 %	50 %	0 %	385802433
137	NC_017459	TC	4	8	63867	63874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017459	TA	3	6	63882	63887	50 %	50 %	0 %	0 %	385802434
139	NC_017459	TA	3	6	63997	64002	50 %	50 %	0 %	0 %	385802434
140	NC_017459	AT	3	6	64237	64242	50 %	50 %	0 %	0 %	385802434
141	NC_017459	GA	3	6	64274	64279	50 %	0 %	50 %	0 %	385802434
142	NC_017459	CT	3	6	64425	64430	0 %	50 %	0 %	50 %	385802434
143	NC_017459	TA	3	6	65027	65032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017459	AT	3	6	65305	65310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017459	TA	4	8	65359	65366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017459	CA	3	6	65492	65497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017459	CA	3	6	66180	66185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017459	AT	3	6	66527	66532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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