MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 4363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017459	AT	3	6	1448	1453	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
2	NC_017459	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
3	NC_017459	CA	3	6	4493	4498	50 %	0 %	0 %	50 %	385802385
4	NC_017459	TG	3	6	5538	5543	0 %	50 %	50 %	0 %	385802386
5	NC_017459	CT	3	6	6464	6469	0 %	50 %	0 %	50 %	385802387
6	NC_017459	TG	3	6	6992	6997	0 %	50 %	50 %	0 %	385802387
7	NC_017459	TC	3	6	7045	7050	0 %	50 %	0 %	50 %	385802387
8	NC_017459	GA	3	6	9149	9154	50 %	0 %	50 %	0 %	385802388
9	NC_017459	AT	3	6	10021	10026	50 %	50 %	0 %	0 %	385802389
10	NC_017459	AT	3	6	11337	11342	50 %	50 %	0 %	0 %	385802390
11	NC_017459	GT	3	6	11860	11865	0 %	50 %	50 %	0 %	385802390
12	NC_017459	AG	3	6	12050	12055	50 %	0 %	50 %	0 %	385802390
13	NC_017459	AT	3	6	12366	12371	50 %	50 %	0 %	0 %	385802390
14	NC_017459	AT	3	6	14311	14316	50 %	50 %	0 %	0 %	385802393
15	NC_017459	AC	3	6	14406	14411	50 %	0 %	0 %	50 %	385802393
16	NC_017459	CT	3	6	15106	15111	0 %	50 %	0 %	50 %	385802393
17	NC_017459	GA	3	6	15297	15302	50 %	0 %	50 %	0 %	385802393
18	NC_017459	AG	3	6	15877	15882	50 %	0 %	50 %	0 %	385802393
19	NC_017459	TC	3	6	16629	16634	0 %	50 %	0 %	50 %	385802394
20	NC_017459	GT	3	6	16971	16976	0 %	50 %	50 %	0 %	385802394
21	NC_017459	TC	3	6	17010	17015	0 %	50 %	0 %	50 %	385802394
22	NC_017459	AT	3	6	18252	18257	50 %	50 %	0 %	0 %	385802396
23	NC_017459	TC	3	6	19260	19265	0 %	50 %	0 %	50 %	385802397
24	NC_017459	CG	4	8	19266	19273	0 %	0 %	50 %	50 %	385802397
25	NC_017459	AT	3	6	22152	22157	50 %	50 %	0 %	0 %	385802400
26	NC_017459	TA	3	6	23606	23611	50 %	50 %	0 %	0 %	385802401
27	NC_017459	CG	3	6	24357	24362	0 %	0 %	50 %	50 %	385802402
28	NC_017459	TC	3	6	25085	25090	0 %	50 %	0 %	50 %	385802402
29	NC_017459	AT	3	6	25597	25602	50 %	50 %	0 %	0 %	385802402
30	NC_017459	AG	5	10	25712	25721	50 %	0 %	50 %	0 %	385802402
31	NC_017459	GA	3	6	26269	26274	50 %	0 %	50 %	0 %	385802402
32	NC_017459	AT	3	6	26901	26906	50 %	50 %	0 %	0 %	385802403
33	NC_017459	AC	3	6	27457	27462	50 %	0 %	0 %	50 %	385802403
34	NC_017459	TC	3	6	27470	27475	0 %	50 %	0 %	50 %	385802403
35	NC_017459	AT	3	6	27605	27610	50 %	50 %	0 %	0 %	385802403
36	NC_017459	GA	3	6	28488	28493	50 %	0 %	50 %	0 %	385802404
37	NC_017459	AT	3	6	28857	28862	50 %	50 %	0 %	0 %	385802405
38	NC_017459	AT	3	6	30307	30312	50 %	50 %	0 %	0 %	385802406
39	NC_017459	AT	3	6	30889	30894	50 %	50 %	0 %	0 %	385802406
40	NC_017459	GT	3	6	32301	32306	0 %	50 %	50 %	0 %	385802407
41	NC_017459	CG	3	6	33037	33042	0 %	0 %	50 %	50 %	385802408
42	NC_017459	TA	3	6	33731	33736	50 %	50 %	0 %	0 %	385802409
43	NC_017459	AT	3	6	34824	34829	50 %	50 %	0 %	0 %	385802410
44	NC_017459	AT	3	6	35527	35532	50 %	50 %	0 %	0 %	385802411
45	NC_017459	CA	3	6	35693	35698	50 %	0 %	0 %	50 %	385802411
46	NC_017459	CG	4	8	35853	35860	0 %	0 %	50 %	50 %	385802411
47	NC_017459	TG	3	6	36118	36123	0 %	50 %	50 %	0 %	385802411
48	NC_017459	AG	3	6	36420	36425	50 %	0 %	50 %	0 %	385802412
49	NC_017459	CA	3	6	37415	37420	50 %	0 %	0 %	50 %	385802415
50	NC_017459	GT	3	6	37917	37922	0 %	50 %	50 %	0 %	385802415
51	NC_017459	AT	3	6	38815	38820	50 %	50 %	0 %	0 %	385802416
52	NC_017459	CA	3	6	38896	38901	50 %	0 %	0 %	50 %	385802416
53	NC_017459	CA	3	6	39245	39250	50 %	0 %	0 %	50 %	385802417
54	NC_017459	GA	3	6	39803	39808	50 %	0 %	50 %	0 %	385802417
55	NC_017459	AT	3	6	40549	40554	50 %	50 %	0 %	0 %	385802418
56	NC_017459	AT	4	8	40697	40704	50 %	50 %	0 %	0 %	385802418
57	NC_017459	CT	3	6	42557	42562	0 %	50 %	0 %	50 %	385802419
58	NC_017459	CT	3	6	43324	43329	0 %	50 %	0 %	50 %	385802420
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61	NC_017459	CG	3	6	47210	47215	0 %	0 %	50 %	50 %	385802425
62	NC_017459	AT	3	6	47597	47602	50 %	50 %	0 %	0 %	385802425
63	NC_017459	AC	3	6	47619	47624	50 %	0 %	0 %	50 %	385802425
64	NC_017459	GC	3	6	47996	48001	0 %	0 %	50 %	50 %	385802425
65	NC_017459	AT	3	6	48062	48067	50 %	50 %	0 %	0 %	385802425
66	NC_017459	CT	3	6	48801	48806	0 %	50 %	0 %	50 %	385802426
67	NC_017459	GC	3	6	51191	51196	0 %	0 %	50 %	50 %	385802428
68	NC_017459	AG	3	6	51742	51747	50 %	0 %	50 %	0 %	385802428
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70	NC_017459	CA	3	6	52689	52694	50 %	0 %	0 %	50 %	385802428
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72	NC_017459	TC	3	6	54621	54626	0 %	50 %	0 %	50 %	385802429
73	NC_017459	GT	3	6	54954	54959	0 %	50 %	50 %	0 %	385802429
74	NC_017459	AT	3	6	55103	55108	50 %	50 %	0 %	0 %	385802429
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83	NC_017459	AC	3	6	60540	60545	50 %	0 %	0 %	50 %	385802432
84	NC_017459	AC	3	6	61081	61086	50 %	0 %	0 %	50 %	385802433
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91	NC_017459	TA	3	6	63997	64002	50 %	50 %	0 %	0 %	385802434
92	NC_017459	AT	3	6	64237	64242	50 %	50 %	0 %	0 %	385802434
93	NC_017459	GA	3	6	64274	64279	50 %	0 %	50 %	0 %	385802434
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104	NC_017459	AT	4	8	80331	80338	50 %	50 %	0 %	0 %	385802442
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106	NC_017459	AT	3	6	81752	81757	50 %	50 %	0 %	0 %	385802443
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110	NC_017459	CA	3	6	85045	85050	50 %	0 %	0 %	50 %	385802448
111	NC_017459	AC	3	6	87195	87200	50 %	0 %	0 %	50 %	385802450
112	NC_017459	CG	3	6	88820	88825	0 %	0 %	50 %	50 %	385802452
113	NC_017459	CG	3	6	91602	91607	0 %	0 %	50 %	50 %	385802454
114	NC_017459	TC	3	6	92240	92245	0 %	50 %	0 %	50 %	385802454
115	NC_017459	TA	3	6	92549	92554	50 %	50 %	0 %	0 %	385802454
116	NC_017459	AC	3	6	93914	93919	50 %	0 %	0 %	50 %	385802455
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118	NC_017459	CG	3	6	95276	95281	0 %	0 %	50 %	50 %	385802456
119	NC_017459	GC	3	6	95550	95555	0 %	0 %	50 %	50 %	385802457
120	NC_017459	CG	3	6	98661	98666	0 %	0 %	50 %	50 %	385802461
121	NC_017459	GA	3	6	99297	99302	50 %	0 %	50 %	0 %	385802462
122	NC_017459	TA	3	6	99365	99370	50 %	50 %	0 %	0 %	385802462
123	NC_017459	GA	3	6	106085	106090	50 %	0 %	50 %	0 %	385802469
124	NC_017459	TG	3	6	106743	106748	0 %	50 %	50 %	0 %	385802469
125	NC_017459	TA	3	6	106794	106799	50 %	50 %	0 %	0 %	385802470
126	NC_017459	GC	3	6	107592	107597	0 %	0 %	50 %	50 %	385802470
127	NC_017459	TG	3	6	108125	108130	0 %	50 %	50 %	0 %	385802470
128	NC_017459	AT	3	6	109464	109469	50 %	50 %	0 %	0 %	385802470
129	NC_017459	TG	3	6	110558	110563	0 %	50 %	50 %	0 %	385802470
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131	NC_017459	GA	3	6	112176	112181	50 %	0 %	50 %	0 %	385802470
132	NC_017459	GA	3	6	113183	113188	50 %	0 %	50 %	0 %	385802470
133	NC_017459	AG	3	6	114850	114855	50 %	0 %	50 %	0 %	385802470
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138	NC_017459	GA	3	6	119339	119344	50 %	0 %	50 %	0 %	385802470
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