MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL6B

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017458	GAGT	2	8	346	353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017458	AACG	2	8	491	498	50 %	0 %	25 %	25 %	385802376
3	NC_017458	GTCT	2	8	1154	1161	0 %	50 %	25 %	25 %	385802376
4	NC_017458	GAAC	2	8	1689	1696	50 %	0 %	25 %	25 %	385802377
5	NC_017458	CGTG	2	8	1854	1861	0 %	25 %	50 %	25 %	385802377
6	NC_017458	CGAG	2	8	1977	1984	25 %	0 %	50 %	25 %	385802377
7	NC_017458	GTCG	2	8	2379	2386	0 %	25 %	50 %	25 %	385802377
8	NC_017458	ATTA	2	8	3410	3417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017458	AAAT	2	8	3715	3722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017458	CTTG	2	8	3820	3827	0 %	50 %	25 %	25 %	385802378
11	NC_017458	ATGT	2	8	3858	3865	25 %	50 %	25 %	0 %	385802378
12	NC_017458	CGTG	2	8	3889	3896	0 %	25 %	50 %	25 %	385802378
13	NC_017458	ACTC	2	8	3982	3989	25 %	25 %	0 %	50 %	385802378
14	NC_017458	GTAT	2	8	4079	4086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017458	TACT	2	8	4153	4160	25 %	50 %	0 %	25 %	385802379
16	NC_017458	CGAC	2	8	4602	4609	25 %	0 %	25 %	50 %	385802379
17	NC_017458	AATC	2	8	5065	5072	50 %	25 %	0 %	25 %	385802380
18	NC_017458	ATCC	2	8	5092	5099	25 %	25 %	0 %	50 %	385802380
19	NC_017458	CCGT	2	8	5132	5139	0 %	25 %	25 %	50 %	385802380
20	NC_017458	ACAA	2	8	6012	6019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017458	ACTG	2	8	6027	6034	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.