MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL6B

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017458	CGA	2	6	432	437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802376
2	NC_017458	GTC	2	6	584	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802376
3	NC_017458	CGA	2	6	639	644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802376
4	NC_017458	GTC	2	6	680	685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802376
5	NC_017458	CAC	2	6	845	850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802376
6	NC_017458	CCG	2	6	885	890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802376
7	NC_017458	ACG	2	6	974	979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802376
8	NC_017458	TCG	2	6	1003	1008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802376
9	NC_017458	GTT	2	6	1174	1179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802376
10	NC_017458	AGA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802376
11	NC_017458	CGA	3	9	1222	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802376
12	NC_017458	CGA	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
13	NC_017458	TCA	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802377
14	NC_017458	ACG	2	6	1409	1414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
15	NC_017458	ACG	2	6	1507	1512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
16	NC_017458	CGT	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802377
17	NC_017458	ACG	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
18	NC_017458	CAC	2	6	1795	1800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802377
19	NC_017458	CGC	2	6	1842	1847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802377
20	NC_017458	TTA	2	6	2001	2006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802377
21	NC_017458	ACT	2	6	2081	2086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802377
22	NC_017458	GAC	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
23	NC_017458	CGA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
24	NC_017458	CGA	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
25	NC_017458	ACG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
26	NC_017458	GGT	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802377
27	NC_017458	GAC	2	6	2495	2500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
28	NC_017458	CAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802377
29	NC_017458	CGC	2	6	2640	2645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802377
30	NC_017458	TTG	2	6	2708	2713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802377
31	NC_017458	ATC	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802377
32	NC_017458	AAG	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802377
33	NC_017458	GAC	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802377
34	NC_017458	CTC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802377
35	NC_017458	TCG	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802378
36	NC_017458	TCG	2	6	3849	3854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802378
37	NC_017458	CGT	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802378
38	NC_017458	TCT	2	6	3918	3923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802378
39	NC_017458	TCG	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802378
40	NC_017458	GGT	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802379
41	NC_017458	GTC	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802379
42	NC_017458	GTT	2	6	4124	4129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802379
43	NC_017458	TCG	2	6	4294	4299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802379
44	NC_017458	ATC	2	6	4326	4331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802379
45	NC_017458	GTC	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802379
46	NC_017458	GTC	2	6	4410	4415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802379
47	NC_017458	TTA	2	6	4624	4629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802379
48	NC_017458	CGT	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802379
49	NC_017458	TCG	2	6	4672	4677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802379
50	NC_017458	GTC	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802379
51	NC_017458	GTC	2	6	4819	4824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802379
52	NC_017458	CAC	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802379
53	NC_017458	AAT	2	6	4957	4962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802380
54	NC_017458	TCA	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802380
55	NC_017458	TCG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802380
56	NC_017458	ACC	2	6	5246	5251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802380
57	NC_017458	TTG	2	6	5263	5268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802380
58	NC_017458	CGT	2	6	5271	5276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802380
59	NC_017458	GTC	3	9	5513	5521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802380
60	NC_017458	CGT	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802380
61	NC_017458	ATG	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802381
62	NC_017458	CAC	2	6	5657	5662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802381
63	NC_017458	CGT	2	6	5765	5770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802381
64	NC_017458	TCG	3	9	5827	5835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802381
65	NC_017458	TCG	2	6	5853	5858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802381
66	NC_017458	GTC	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802381
67	NC_017458	TGT	2	6	5956	5961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.