MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	AATCGT	2	12	6349	6360	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017457	TGTAAT	2	12	8568	8579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385802313
3	NC_017457	GAGCAA	2	12	14077	14088	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385802317
4	NC_017457	ACTGAG	2	12	23478	23489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385802322
5	NC_017457	ATTCAT	2	12	28638	28649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017457	ACCCCC	2	12	32896	32907	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7	NC_017457	ATTGGT	2	12	33991	34002	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017457	TAAATA	2	12	35712	35723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017457	GGGAAG	4	24	38687	38710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802333
10	NC_017457	GACCCC	2	12	41473	41484	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385802336
11	NC_017457	AGTGAG	2	12	42736	42747	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385802338
12	NC_017457	ACCAAT	2	12	44533	44544	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017457	GACCAC	2	12	45220	45231	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385802339
14	NC_017457	ATGTTG	2	12	52118	52129	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017457	ATCAGT	2	12	56233	56244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802347
16	NC_017457	ATATTT	2	12	57584	57595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802349
17	NC_017457	GAAAAA	2	12	61486	61497	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385802353
18	NC_017457	GATGTC	2	12	61567	61578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385802353
19	NC_017457	GTCTGA	2	12	65347	65358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385802357
20	NC_017457	AATCAG	2	12	67549	67560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385802358
21	NC_017457	CGAGGT	2	12	72388	72399	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385802361
22	NC_017457	AGTCCG	2	12	74563	74574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385802363
23	NC_017457	TCTGAT	2	12	76535	76546	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017457	TCTTAT	2	12	77266	77277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017457	ATAGTC	2	12	80235	80246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802366
26	NC_017457	AGTAGA	2	12	81013	81024	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385802367
27	NC_017457	AATTCA	2	12	94547	94558	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.