MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	GCTGT	2	10	708	717	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017457	TAGAA	2	10	1726	1735	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017457	TATAA	2	10	10141	10150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017457	AAATT	2	10	11847	11856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017457	ATGTC	2	10	11999	12008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017457	ATTAT	2	10	18781	18790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017457	ACCCC	2	10	29094	29103	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_017457	ACGGG	2	10	29594	29603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017457	AATAT	2	10	30627	30636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017457	GCTTG	2	10	32740	32749	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017457	AAAAT	2	10	32801	32810	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017457	AAAGT	2	10	34045	34054	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017457	CTACG	2	10	36658	36667	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017457	AAGAA	2	10	36846	36855	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017457	AAGAA	2	10	36888	36897	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017457	AAGAA	2	10	36930	36939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017457	AAGAA	2	10	36972	36981	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017457	ACCCC	2	10	37304	37313	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_017457	AAAGT	2	10	40406	40415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017457	ACTTT	2	10	44481	44490	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017457	TATAC	2	10	46383	46392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017457	TCTGA	2	10	47511	47520	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017457	AATTG	2	10	52405	52414	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017457	TCAAT	2	10	55123	55132	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017457	CGATC	2	10	63532	63541	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017457	ATGAT	2	10	63643	63652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017457	ATTTT	2	10	64369	64378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017457	ACGAG	2	10	69305	69314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017457	ATCGG	2	10	77185	77194	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017457	AAATA	2	10	77342	77351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017457	CCCTC	2	10	78310	78319	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_017457	CTGCC	2	10	83211	83220	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_017457	CATAT	2	10	83715	83724	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017457	AGTAC	2	10	84373	84382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.