MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	GGATG	2	10	1446	1455	20 %	20 %	60 %	0 %	385802306
2	NC_017457	GGTGA	2	10	2469	2478	20 %	20 %	60 %	0 %	385802308
3	NC_017457	CTCGC	2	10	6703	6712	0 %	20 %	20 %	60 %	385802313
4	NC_017457	TTGAG	2	10	7591	7600	20 %	40 %	40 %	0 %	385802313
5	NC_017457	CTACT	2	10	9536	9545	20 %	40 %	0 %	40 %	385802314
6	NC_017457	CGTCT	2	10	13490	13499	0 %	40 %	20 %	40 %	385802317
7	NC_017457	AGAGA	2	10	14110	14119	60 %	0 %	40 %	0 %	385802317
8	NC_017457	GTCCT	2	10	14122	14131	0 %	40 %	20 %	40 %	385802317
9	NC_017457	ATCGA	2	10	17298	17307	40 %	20 %	20 %	20 %	385802318
10	NC_017457	AGCCA	2	10	23283	23292	40 %	0 %	20 %	40 %	385802322
11	NC_017457	GATAT	2	10	25332	25341	40 %	40 %	20 %	0 %	385802323
12	NC_017457	ATGAT	2	10	27333	27342	40 %	40 %	20 %	0 %	385802324
13	NC_017457	AGATA	2	10	35914	35923	60 %	20 %	20 %	0 %	385802331
14	NC_017457	TGGAC	2	10	41020	41029	20 %	20 %	40 %	20 %	385802336
15	NC_017457	ATGGA	2	10	41237	41246	40 %	20 %	40 %	0 %	385802336
16	NC_017457	TCCTG	2	10	42236	42245	0 %	40 %	20 %	40 %	385802337
17	NC_017457	CCCTT	2	10	46186	46195	0 %	40 %	0 %	60 %	385802340
18	NC_017457	AACTG	2	10	50946	50955	40 %	20 %	20 %	20 %	385802344
19	NC_017457	TTCAG	2	10	51181	51190	20 %	40 %	20 %	20 %	385802345
20	NC_017457	TCAGC	2	10	54992	55001	20 %	20 %	20 %	40 %	385802346
21	NC_017457	TCCAC	2	10	55661	55670	20 %	20 %	0 %	60 %	385802347
22	NC_017457	ATATT	2	10	59764	59773	40 %	60 %	0 %	0 %	385802351
23	NC_017457	CTCTT	2	10	59880	59889	0 %	60 %	0 %	40 %	385802351
24	NC_017457	CATAT	2	10	61894	61903	40 %	40 %	0 %	20 %	385802354
25	NC_017457	GTCGG	2	10	65120	65129	0 %	20 %	60 %	20 %	385802357
26	NC_017457	TTATA	2	10	77757	77766	40 %	60 %	0 %	0 %	385802364
27	NC_017457	TCCAT	2	10	78694	78703	20 %	40 %	0 %	40 %	385802365
28	NC_017457	CAAGA	2	10	81161	81170	60 %	0 %	20 %	20 %	385802367
29	NC_017457	AAAGA	2	10	81508	81517	80 %	0 %	20 %	0 %	385802367
30	NC_017457	GCTTG	2	10	81976	81985	0 %	40 %	40 %	20 %	385802368
31	NC_017457	CATCT	2	10	85999	86008	20 %	40 %	0 %	40 %	385802370
32	NC_017457	GACGT	2	10	89552	89561	20 %	20 %	40 %	20 %	385802372
33	NC_017457	TGAGG	2	10	89707	89716	20 %	20 %	60 %	0 %	385802372
34	NC_017457	ATCGA	2	10	90154	90163	40 %	20 %	20 %	20 %	385802373
35	NC_017457	CGATC	2	10	90870	90879	20 %	20 %	20 %	40 %	385802373
36	NC_017457	TCCAA	2	10	90971	90980	40 %	20 %	0 %	40 %	385802373
37	NC_017457	AATTG	2	10	91524	91533	40 %	40 %	20 %	0 %	385802373
38	NC_017457	CAACT	2	10	92465	92474	40 %	20 %	0 %	40 %	385802373
39	NC_017457	GAGAG	2	10	92644	92653	40 %	0 %	60 %	0 %	385802373
40	NC_017457	GATCT	2	10	93884	93893	20 %	40 %	20 %	20 %	385802373
41	NC_017457	GCGAG	2	10	95310	95319	20 %	0 %	60 %	20 %	385802374
42	NC_017457	GTCTC	2	10	96320	96329	0 %	40 %	20 %	40 %	385802374
43	NC_017457	GATTC	2	10	97008	97017	20 %	40 %	20 %	20 %	385802374
44	NC_017457	TGCTA	2	10	99367	99376	20 %	40 %	20 %	20 %	385802374
45	NC_017457	ACCAC	2	10	99448	99457	40 %	0 %	0 %	60 %	385802374

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.