MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 424

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	GTA	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017457	TTG	2	6	192	197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017457	AGC	2	6	209	214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017457	TCT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017457	TGA	2	6	313	318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017457	CTT	2	6	397	402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017457	TTC	2	6	491	496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017457	ATT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017457	ATT	2	6	618	623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017457	TTC	2	6	679	684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017457	ACT	2	6	725	730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017457	GAT	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017457	TTA	2	6	1182	1187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017457	CAC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017457	TTC	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017457	GAT	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017457	GAT	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017457	GAT	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017457	CAT	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017457	GGT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017457	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017457	GTC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017457	TAT	3	9	4185	4193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017457	GGT	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017457	CTG	2	6	4310	4315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017457	CAT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017457	ATC	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017457	TCA	3	9	4715	4723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017457	AGG	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017457	ATC	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017457	TCA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017457	GTT	2	6	5710	5715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017457	CAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017457	CAA	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017457	AAT	2	6	5979	5984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017457	TCC	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017457	CAG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017457	CAC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017457	TAA	2	6	6466	6471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017457	ATG	2	6	6486	6491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017457	TAC	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017457	TGA	2	6	9130	9135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017457	GAG	2	6	9237	9242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017457	CAT	2	6	11538	11543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017457	AAC	2	6	11580	11585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017457	GTA	2	6	11607	11612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017457	ATC	2	6	11654	11659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017457	ATA	2	6	11757	11762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017457	GAC	2	6	11833	11838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017457	AAT	2	6	11879	11884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017457	ATT	2	6	11935	11940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017457	ATC	2	6	11980	11985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017457	ATC	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017457	CTA	2	6	12055	12060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017457	AAC	2	6	12135	12140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017457	CGG	2	6	12352	12357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017457	GTT	2	6	16326	16331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017457	ATA	2	6	16366	16371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017457	TTC	2	6	16412	16417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017457	GAT	2	6	16441	16446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017457	GAG	2	6	16512	16517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017457	TCG	2	6	16591	16596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017457	AAG	2	6	16651	16656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017457	TCT	2	6	16683	16688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017457	ATT	2	6	16739	16744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017457	TGA	2	6	16889	16894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017457	CCG	2	6	16951	16956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017457	ATT	2	6	18137	18142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017457	ATA	2	6	18146	18151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017457	TGT	2	6	18247	18252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017457	GAT	2	6	18255	18260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017457	AAT	2	6	18283	18288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017457	ACC	2	6	18453	18458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017457	GCT	2	6	18488	18493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017457	ATT	2	6	18547	18552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017457	AAT	2	6	18613	18618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017457	TAT	2	6	18643	18648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017457	TAT	2	6	18739	18744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017457	CGA	2	6	18841	18846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017457	TGA	2	6	18876	18881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017457	AGT	2	6	18944	18949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017457	GAT	2	6	19415	19420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017457	GTA	2	6	19632	19637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017457	TAA	2	6	19638	19643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017457	TAT	2	6	19651	19656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017457	TCA	2	6	21521	21526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017457	CGA	2	6	22172	22177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017457	GAT	2	6	22200	22205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017457	TAA	2	6	22236	22241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017457	GAT	2	6	22312	22317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017457	GGA	2	6	28707	28712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017457	GTT	2	6	28746	28751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017457	ATC	2	6	28790	28795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017457	TGA	3	9	28851	28859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017457	TTG	2	6	28976	28981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017457	CAT	2	6	29024	29029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017457	ATC	2	6	29053	29058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017457	GTA	2	6	29197	29202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017457	CAA	2	6	29319	29324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017457	ATT	2	6	29549	29554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017457	AAG	2	6	29581	29586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017457	AGG	2	6	29931	29936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017457	CCT	2	6	30069	30074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017457	CTG	2	6	30143	30148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017457	CGA	2	6	30178	30183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017457	CTC	2	6	30196	30201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017457	GCT	2	6	30206	30211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017457	TAT	2	6	30619	30624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017457	TAG	2	6	30650	30655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017457	CAT	2	6	30864	30869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017457	TCA	2	6	30894	30899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017457	CAG	2	6	32351	32356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017457	ATC	2	6	32555	32560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017457	TTA	2	6	32591	32596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017457	ATT	2	6	32615	32620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017457	CAT	2	6	32622	32627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017457	TAA	2	6	32770	32775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017457	GAC	2	6	33018	33023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017457	ATA	2	6	33044	33049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017457	GTA	2	6	33068	33073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017457	TTA	2	6	33598	33603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017457	ATG	2	6	33677	33682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017457	GAA	2	6	33686	33691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017457	TAA	2	6	33737	33742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017457	GTT	2	6	33763	33768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017457	AGC	2	6	33797	33802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017457	TGA	2	6	33896	33901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017457	TGT	2	6	33975	33980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017457	TAA	2	6	34081	34086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017457	GAT	2	6	34096	34101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017457	AAC	2	6	34163	34168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017457	TAT	2	6	34188	34193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017457	TAA	2	6	34204	34209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017457	ATT	2	6	34319	34324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017457	CAG	2	6	34396	34401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017457	TAA	2	6	34455	34460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017457	TCT	2	6	34484	34489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017457	TCG	2	6	34563	34568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017457	AAC	2	6	34574	34579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017457	TGA	2	6	34609	34614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017457	TAA	2	6	34715	34720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.