MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	TCT	2	6	1063	1068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802305
2	NC_017457	CGA	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802305
3	NC_017457	TAG	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802305
4	NC_017457	AGG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802305
5	NC_017457	GAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802306
6	NC_017457	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802306
7	NC_017457	GAT	3	9	1311	1319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802306
8	NC_017457	GCA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802306
9	NC_017457	CGA	2	6	1771	1776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802307
10	NC_017457	TCA	2	6	1819	1824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
11	NC_017457	TCA	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
12	NC_017457	AAG	2	6	1937	1942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802307
13	NC_017457	GTG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802307
14	NC_017457	ATC	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
15	NC_017457	GAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802307
16	NC_017457	ACT	2	6	2129	2134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802307
17	NC_017457	CAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802308
18	NC_017457	GGA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802308
19	NC_017457	TGG	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802308
20	NC_017457	CAT	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802308
21	NC_017457	CGG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802309
22	NC_017457	TAA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802309
23	NC_017457	GTG	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802309
24	NC_017457	GTT	2	6	3451	3456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802309
25	NC_017457	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802309
26	NC_017457	GTC	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802310
27	NC_017457	AGA	2	6	3763	3768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802310
28	NC_017457	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802310
29	NC_017457	TCC	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802310
30	NC_017457	AGC	2	6	3960	3965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802310
31	NC_017457	TGA	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802310
32	NC_017457	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802310
33	NC_017457	CCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802310
34	NC_017457	CGT	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802310
35	NC_017457	TAC	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802310
36	NC_017457	TGA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802311
37	NC_017457	GAC	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802311
38	NC_017457	TGG	2	6	4527	4532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802311
39	NC_017457	CTG	2	6	4537	4542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802311
40	NC_017457	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802312
41	NC_017457	CTG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802312
42	NC_017457	GTT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802312
43	NC_017457	AGC	2	6	5254	5259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802312
44	NC_017457	AGA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802312
45	NC_017457	GAG	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802312
46	NC_017457	CTT	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802312
47	NC_017457	GAC	2	6	6557	6562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
48	NC_017457	AGA	2	6	6563	6568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802313
49	NC_017457	TCC	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802313
50	NC_017457	TGA	2	6	6602	6607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
51	NC_017457	GAC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
52	NC_017457	TAT	2	6	6731	6736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802313
53	NC_017457	GAG	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802313
54	NC_017457	ATC	2	6	6893	6898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802313
55	NC_017457	CGA	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
56	NC_017457	CAA	2	6	6975	6980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802313
57	NC_017457	TCG	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
58	NC_017457	CGA	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
59	NC_017457	TGA	2	6	7163	7168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
60	NC_017457	GGT	2	6	7200	7205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802313
61	NC_017457	ATG	3	9	7279	7287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
62	NC_017457	TGG	2	6	7292	7297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802313
63	NC_017457	TGA	3	9	7475	7483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
64	NC_017457	TGA	2	6	7526	7531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
65	NC_017457	CTG	2	6	7609	7614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
66	NC_017457	CGT	2	6	7719	7724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
67	NC_017457	GTC	2	6	8019	8024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
68	NC_017457	TCA	2	6	8161	8166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802313
69	NC_017457	ACG	2	6	8254	8259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
70	NC_017457	TGA	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802313
71	NC_017457	CTG	2	6	8329	8334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802313
72	NC_017457	AAC	2	6	8455	8460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802313
73	NC_017457	CTT	2	6	8553	8558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802313
74	NC_017457	GAC	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
75	NC_017457	TCT	2	6	8639	8644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802313
76	NC_017457	ACG	2	6	8964	8969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802313
77	NC_017457	GTG	2	6	9310	9315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802314
78	NC_017457	ACA	2	6	9403	9408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802314
79	NC_017457	GTC	2	6	9409	9414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
80	NC_017457	TCG	2	6	9548	9553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
81	NC_017457	ACC	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802314
82	NC_017457	CTT	2	6	9670	9675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802314
83	NC_017457	AGT	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802314
84	NC_017457	GCT	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
85	NC_017457	ATT	2	6	9814	9819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802314
86	NC_017457	CAG	2	6	9865	9870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802314
87	NC_017457	TCG	2	6	9923	9928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802314
88	NC_017457	TGT	2	6	9939	9944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802314
89	NC_017457	ATT	2	6	9964	9969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802314
90	NC_017457	CTT	2	6	10026	10031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802314
91	NC_017457	GTG	2	6	10034	10039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802314
92	NC_017457	TTC	2	6	10155	10160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802315
93	NC_017457	CTC	2	6	10182	10187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802315
94	NC_017457	GAT	2	6	10211	10216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802315
95	NC_017457	TCC	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802315
96	NC_017457	CTG	2	6	10461	10466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802315
97	NC_017457	CTT	2	6	10538	10543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802315
98	NC_017457	TGG	2	6	10592	10597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802316
99	NC_017457	TCG	2	6	10679	10684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802316
100	NC_017457	CAG	2	6	10734	10739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802316
101	NC_017457	TGC	2	6	10844	10849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802316
102	NC_017457	CAT	2	6	11026	11031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802316
103	NC_017457	ATG	2	6	11169	11174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802316
104	NC_017457	ACG	2	6	11222	11227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802316
105	NC_017457	GAC	2	6	11321	11326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802316
106	NC_017457	GCC	2	6	11370	11375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802316
107	NC_017457	GGA	2	6	12617	12622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802317
108	NC_017457	CCA	2	6	12724	12729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802317
109	NC_017457	TAC	2	6	12750	12755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802317
110	NC_017457	GCT	2	6	12838	12843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802317
111	NC_017457	CAG	2	6	12890	12895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802317
112	NC_017457	TCG	2	6	12957	12962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802317
113	NC_017457	GAA	2	6	13042	13047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802317
114	NC_017457	CGG	2	6	13146	13151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802317
115	NC_017457	AGA	2	6	13326	13331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802317
116	NC_017457	GAT	2	6	13465	13470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802317
117	NC_017457	ATA	2	6	13976	13981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802317
118	NC_017457	TAT	2	6	14227	14232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802317
119	NC_017457	TGA	2	6	14439	14444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802317
120	NC_017457	CTG	2	6	14524	14529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802317
121	NC_017457	CGA	2	6	14628	14633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802317
122	NC_017457	TTG	2	6	14735	14740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802317
123	NC_017457	AGC	2	6	14854	14859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802317
124	NC_017457	TCG	2	6	14861	14866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802317
125	NC_017457	GGT	2	6	15190	15195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802317
126	NC_017457	AAC	2	6	15247	15252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802317
127	NC_017457	CAG	2	6	15302	15307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802317
128	NC_017457	AAT	2	6	15343	15348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802317
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249	NC_017457	GCG	2	6	26891	26896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802324
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251	NC_017457	GAT	2	6	27098	27103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
252	NC_017457	GTA	2	6	27191	27196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
253	NC_017457	GAT	2	6	27313	27318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
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255	NC_017457	TGA	2	6	27406	27411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
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257	NC_017457	GAA	2	6	27866	27871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802324
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260	NC_017457	GTA	2	6	28079	28084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802324
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280	NC_017457	GCG	2	6	31523	31528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802328
281	NC_017457	AGC	2	6	31531	31536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802328
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498	NC_017457	ATC	2	6	61042	61047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802353
499	NC_017457	CTG	2	6	61082	61087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802353
500	NC_017457	ATA	2	6	61154	61159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802353

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