MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 plasmid PL100

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017457	G	6	6	1301	1306	0 %	0 %	100 %	0 %	385802306
2	NC_017457	T	6	6	1858	1863	0 %	100 %	0 %	0 %	385802307
3	NC_017457	A	6	6	3438	3443	100 %	0 %	0 %	0 %	385802309
4	NC_017457	A	6	6	4466	4471	100 %	0 %	0 %	0 %	385802311
5	NC_017457	A	6	6	4500	4505	100 %	0 %	0 %	0 %	385802311
6	NC_017457	T	6	6	4595	4600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017457	A	7	7	6095	6101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017457	T	6	6	6222	6227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017457	T	6	6	6773	6778	0 %	100 %	0 %	0 %	385802313
10	NC_017457	A	7	7	7904	7910	100 %	0 %	0 %	0 %	385802313
11	NC_017457	T	6	6	9331	9336	0 %	100 %	0 %	0 %	385802314
12	NC_017457	T	7	7	9950	9956	0 %	100 %	0 %	0 %	385802314
13	NC_017457	A	6	6	11926	11931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017457	T	6	6	12030	12035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017457	A	6	6	12778	12783	100 %	0 %	0 %	0 %	385802317
16	NC_017457	G	6	6	15467	15472	0 %	0 %	100 %	0 %	385802317
17	NC_017457	T	6	6	16247	16252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017457	A	6	6	17870	17875	100 %	0 %	0 %	0 %	385802318
19	NC_017457	G	6	6	17877	17882	0 %	0 %	100 %	0 %	385802318
20	NC_017457	A	6	6	21129	21134	100 %	0 %	0 %	0 %	385802320
21	NC_017457	T	6	6	23825	23830	0 %	100 %	0 %	0 %	385802322
22	NC_017457	T	6	6	24199	24204	0 %	100 %	0 %	0 %	385802323
23	NC_017457	A	6	6	24860	24865	100 %	0 %	0 %	0 %	385802323
24	NC_017457	A	6	6	26302	26307	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
25	NC_017457	A	7	7	27140	27146	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
26	NC_017457	A	9	9	27834	27842	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
27	NC_017457	A	6	6	27926	27931	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
28	NC_017457	A	6	6	28196	28201	100 %	0 %	0 %	0 %	385802324
29	NC_017457	A	6	6	28453	28458	100 %	0 %	0 %	0 %	385802325
30	NC_017457	A	6	6	28809	28814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017457	C	6	6	29100	29105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_017457	A	7	7	30731	30737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017457	C	6	6	30940	30945	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_017457	A	7	7	31000	31006	100 %	0 %	0 %	0 %	385802328
35	NC_017457	C	6	6	32479	32484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_017457	C	6	6	32562	32567	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_017457	T	6	6	32825	32830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017457	G	6	6	33311	33316	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017457	A	6	6	34016	34021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017457	T	6	6	35983	35988	0 %	100 %	0 %	0 %	385802331
41	NC_017457	A	8	8	36500	36507	100 %	0 %	0 %	0 %	385802331
42	NC_017457	G	6	6	36874	36879	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017457	G	6	6	36916	36921	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017457	G	6	6	36958	36963	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017457	A	6	6	37111	37116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017457	C	6	6	37310	37315	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_017457	T	6	6	39385	39390	0 %	100 %	0 %	0 %	385802335
48	NC_017457	T	7	7	39708	39714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017457	A	6	6	40694	40699	100 %	0 %	0 %	0 %	385802336
50	NC_017457	T	6	6	42562	42567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017457	T	6	6	46893	46898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017457	A	6	6	46914	46919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017457	A	6	6	47244	47249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017457	T	8	8	47611	47618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017457	A	7	7	48000	48006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017457	A	8	8	48675	48682	100 %	0 %	0 %	0 %	385802342
57	NC_017457	A	6	6	49796	49801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017457	T	6	6	51062	51067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017457	C	6	6	51117	51122	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_017457	A	6	6	52135	52140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017457	A	6	6	53384	53389	100 %	0 %	0 %	0 %	385802346
62	NC_017457	A	6	6	54667	54672	100 %	0 %	0 %	0 %	385802346
63	NC_017457	A	7	7	55187	55193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017457	T	6	6	55461	55466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017457	T	6	6	56265	56270	0 %	100 %	0 %	0 %	385802347
66	NC_017457	C	6	6	56381	56386	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_017457	T	6	6	60210	60215	0 %	100 %	0 %	0 %	385802351
68	NC_017457	T	6	6	61213	61218	0 %	100 %	0 %	0 %	385802353
69	NC_017457	A	6	6	65785	65790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017457	T	6	6	68459	68464	0 %	100 %	0 %	0 %	385802359
71	NC_017457	A	6	6	68508	68513	100 %	0 %	0 %	0 %	385802359
72	NC_017457	A	6	6	68515	68520	100 %	0 %	0 %	0 %	385802359
73	NC_017457	A	6	6	68945	68950	100 %	0 %	0 %	0 %	385802359
74	NC_017457	A	7	7	68973	68979	100 %	0 %	0 %	0 %	385802359
75	NC_017457	T	7	7	69787	69793	0 %	100 %	0 %	0 %	385802360
76	NC_017457	A	6	6	76476	76481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017457	A	6	6	76816	76821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017457	T	6	6	77010	77015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017457	T	6	6	77461	77466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017457	T	6	6	77563	77568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017457	A	6	6	79747	79752	100 %	0 %	0 %	0 %	385802366
82	NC_017457	T	6	6	83498	83503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017457	A	6	6	83647	83652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017457	A	6	6	88435	88440	100 %	0 %	0 %	0 %	385802372
85	NC_017457	A	6	6	92252	92257	100 %	0 %	0 %	0 %	385802373
86	NC_017457	A	6	6	92672	92677	100 %	0 %	0 %	0 %	385802373
87	NC_017457	A	7	7	93213	93219	100 %	0 %	0 %	0 %	385802373
88	NC_017457	A	8	8	93479	93486	100 %	0 %	0 %	0 %	385802373
89	NC_017457	T	7	7	94206	94212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017457	A	6	6	94867	94872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017457	A	6	6	99679	99684	100 %	0 %	0 %	0 %	385802374
92	NC_017457	A	6	6	99989	99994	100 %	0 %	0 %	0 %	385802374

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.