MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017456	TCTGC	2	10	324	333	0 %	40 %	20 %	40 %	385800987
2	NC_017456	GAAAA	2	10	4644	4653	80 %	0 %	20 %	0 %	385800989
3	NC_017456	TGCAA	2	10	8735	8744	40 %	20 %	20 %	20 %	385800991
4	NC_017456	GGTAA	2	10	9795	9804	40 %	20 %	40 %	0 %	385800991
5	NC_017456	TACTT	2	10	12827	12836	20 %	60 %	0 %	20 %	385800996
6	NC_017456	CTTCT	2	10	16751	16760	0 %	60 %	0 %	40 %	385800999
7	NC_017456	AACTT	2	10	21299	21308	40 %	40 %	0 %	20 %	385801002
8	NC_017456	CCCAA	2	10	22223	22232	40 %	0 %	0 %	60 %	385801003
9	NC_017456	ACTTG	2	10	23451	23460	20 %	40 %	20 %	20 %	385801005
10	NC_017456	TAGTG	2	10	24395	24404	20 %	40 %	40 %	0 %	385801005
11	NC_017456	GTTTT	2	10	24544	24553	0 %	80 %	20 %	0 %	385801005
12	NC_017456	CATAG	2	10	26893	26902	40 %	20 %	20 %	20 %	385801008
13	NC_017456	GTGGC	2	10	27559	27568	0 %	20 %	60 %	20 %	385801008
14	NC_017456	GCCTT	2	10	27869	27878	0 %	40 %	20 %	40 %	385801008
15	NC_017456	CAAAT	2	10	27976	27985	60 %	20 %	0 %	20 %	385801008
16	NC_017456	TCATG	2	10	28518	28527	20 %	40 %	20 %	20 %	385801008
17	NC_017456	GAAAT	2	10	30066	30075	60 %	20 %	20 %	0 %	385801011
18	NC_017456	AAATC	2	10	30131	30140	60 %	20 %	0 %	20 %	385801011
19	NC_017456	GCAAA	2	10	30558	30567	60 %	0 %	20 %	20 %	385801011
20	NC_017456	TGGTT	2	10	30877	30886	0 %	60 %	40 %	0 %	385801011
21	NC_017456	ACAGA	2	10	31651	31660	60 %	0 %	20 %	20 %	385801012
22	NC_017456	TTGGA	2	10	34085	34094	20 %	40 %	40 %	0 %	385801013
23	NC_017456	TTGGC	2	10	37601	37610	0 %	40 %	40 %	20 %	385801015
24	NC_017456	TTTTG	2	10	38125	38134	0 %	80 %	20 %	0 %	385801016
25	NC_017456	GGATC	2	10	42597	42606	20 %	20 %	40 %	20 %	385801020
26	NC_017456	GAAAG	2	10	43577	43586	60 %	0 %	40 %	0 %	385801020
27	NC_017456	ATGAG	2	10	46249	46258	40 %	20 %	40 %	0 %	385801022
28	NC_017456	ATTCT	2	10	52090	52099	20 %	60 %	0 %	20 %	385801029
29	NC_017456	CGTTA	2	10	52809	52818	20 %	40 %	20 %	20 %	385801029
30	NC_017456	ATGCG	2	10	53297	53306	20 %	20 %	40 %	20 %	385801029
31	NC_017456	GCAAG	2	10	57524	57533	40 %	0 %	40 %	20 %	385801033
32	NC_017456	AAAGC	2	10	61387	61396	60 %	0 %	20 %	20 %	385801036
33	NC_017456	CGTAA	2	10	68840	68849	40 %	20 %	20 %	20 %	385801042
34	NC_017456	TTTAT	2	10	70195	70204	20 %	80 %	0 %	0 %	385801044
35	NC_017456	GCGTG	2	10	70980	70989	0 %	20 %	60 %	20 %	385801044
36	NC_017456	TCTGC	2	10	73847	73856	0 %	40 %	20 %	40 %	385801046
37	NC_017456	TGCAA	2	10	77033	77042	40 %	20 %	20 %	20 %	385801048
38	NC_017456	AGAGC	2	10	77507	77516	40 %	0 %	40 %	20 %	385801048
39	NC_017456	AAGCA	2	10	78840	78849	60 %	0 %	20 %	20 %	385801049
40	NC_017456	TGATT	2	10	82239	82248	20 %	60 %	20 %	0 %	385801051
41	NC_017456	TTTGC	2	10	85221	85230	0 %	60 %	20 %	20 %	385801053
42	NC_017456	CAAGG	2	10	88223	88232	40 %	0 %	40 %	20 %	385801056
43	NC_017456	CAATC	2	10	91136	91145	40 %	20 %	0 %	40 %	385801058
44	NC_017456	CGTAT	2	10	96579	96588	20 %	40 %	20 %	20 %	385801062
45	NC_017456	TGGTG	2	10	97863	97872	0 %	40 %	60 %	0 %	385801065
46	NC_017456	ATGAT	2	10	109522	109531	40 %	40 %	20 %	0 %	385801070
47	NC_017456	AATTG	2	10	110333	110342	40 %	40 %	20 %	0 %	385801071
48	NC_017456	GGAGG	2	10	116166	116175	20 %	0 %	80 %	0 %	385801076
49	NC_017456	AGAAA	2	10	117935	117944	80 %	0 %	20 %	0 %	385801078
50	NC_017456	TTGCG	2	10	120656	120665	0 %	40 %	40 %	20 %	385801080
51	NC_017456	TTATG	2	10	126049	126058	20 %	60 %	20 %	0 %	385801083
52	NC_017456	CTCAG	2	10	130254	130263	20 %	20 %	20 %	40 %	385801089
53	NC_017456	AGTTT	2	10	131946	131955	20 %	60 %	20 %	0 %	385801090
54	NC_017456	GGAAT	2	10	134302	134311	40 %	20 %	40 %	0 %	385801093
55	NC_017456	GTTGT	2	10	137795	137804	0 %	60 %	40 %	0 %	385801095
56	NC_017456	TTTGC	2	10	138588	138597	0 %	60 %	20 %	20 %	385801095
57	NC_017456	TTATT	2	10	139221	139230	20 %	80 %	0 %	0 %	385801095
58	NC_017456	TTTCT	2	10	139339	139348	0 %	80 %	0 %	20 %	385801095
59	NC_017456	CTCTT	2	10	139790	139799	0 %	60 %	0 %	40 %	385801095
60	NC_017456	TTTCT	2	10	139885	139894	0 %	80 %	0 %	20 %	385801095
61	NC_017456	CTTGT	2	10	143968	143977	0 %	60 %	20 %	20 %	385801098
62	NC_017456	TCTTG	2	10	144012	144021	0 %	60 %	20 %	20 %	385801098
63	NC_017456	CGTAG	2	10	146711	146720	20 %	20 %	40 %	20 %	385801100
64	NC_017456	TCCTT	2	10	146846	146855	0 %	60 %	0 %	40 %	385801100
65	NC_017456	ACAGT	2	10	147104	147113	40 %	20 %	20 %	20 %	385801100
66	NC_017456	TACCG	2	10	150463	150472	20 %	20 %	20 %	40 %	385801103
67	NC_017456	GTCTG	2	10	150653	150662	0 %	40 %	40 %	20 %	385801103
68	NC_017456	AATCA	2	10	152845	152854	60 %	20 %	0 %	20 %	385801103
69	NC_017456	GCTGT	2	10	154265	154274	0 %	40 %	40 %	20 %	385801104
70	NC_017456	TTGGC	2	10	157699	157708	0 %	40 %	40 %	20 %	385801107
71	NC_017456	GCTCA	2	10	160298	160307	20 %	20 %	20 %	40 %	385801110
72	NC_017456	TGGTG	2	10	163716	163725	0 %	40 %	60 %	0 %	385801114
73	NC_017456	AAAGC	2	10	164423	164432	60 %	0 %	20 %	20 %	385801115
74	NC_017456	TGCAT	2	10	165593	165602	20 %	40 %	20 %	20 %	385801116
75	NC_017456	TTTCA	2	10	166445	166454	20 %	60 %	0 %	20 %	385801116
76	NC_017456	TCCAA	2	10	169710	169719	40 %	20 %	0 %	40 %	385801122
77	NC_017456	AAATC	2	10	170575	170584	60 %	20 %	0 %	20 %	385801122
78	NC_017456	GAATG	2	10	171362	171371	40 %	20 %	40 %	0 %	385801123
79	NC_017456	TGACA	2	10	171640	171649	40 %	20 %	20 %	20 %	385801123
80	NC_017456	CTGTT	2	10	173618	173627	0 %	60 %	20 %	20 %	385801125
81	NC_017456	TAATT	2	10	176329	176338	40 %	60 %	0 %	0 %	385801127
82	NC_017456	ATATT	2	10	177398	177407	40 %	60 %	0 %	0 %	385801129
83	NC_017456	TTATA	2	10	178914	178923	40 %	60 %	0 %	0 %	385801130
84	NC_017456	GGCAT	2	10	180469	180478	20 %	20 %	40 %	20 %	385801132
85	NC_017456	TATTT	2	10	180990	180999	20 %	80 %	0 %	0 %	385801133
86	NC_017456	GAGAT	2	10	181418	181427	40 %	20 %	40 %	0 %	385801133
87	NC_017456	AAACG	2	10	182194	182203	60 %	0 %	20 %	20 %	385801135
88	NC_017456	AAGAA	2	10	182637	182646	80 %	0 %	20 %	0 %	385801135
89	NC_017456	AGTAA	2	10	184441	184450	60 %	20 %	20 %	0 %	385801136
90	NC_017456	AACTC	2	10	186404	186413	40 %	20 %	0 %	40 %	385801138
91	NC_017456	GAGAA	2	10	188268	188277	60 %	0 %	40 %	0 %	385801138
92	NC_017456	ATTCC	2	10	193044	193053	20 %	40 %	0 %	40 %	385801141
93	NC_017456	CGCTA	2	10	194625	194634	20 %	20 %	20 %	40 %	385801143
94	NC_017456	TTGCG	2	10	196337	196346	0 %	40 %	40 %	20 %	385801144
95	NC_017456	TTCAA	2	10	197358	197367	40 %	40 %	0 %	20 %	385801145
96	NC_017456	GTCTT	2	10	198226	198235	0 %	60 %	20 %	20 %	385801146
97	NC_017456	TTTCT	2	10	198411	198420	0 %	80 %	0 %	20 %	385801146
98	NC_017456	AGAGT	2	10	200017	200026	40 %	20 %	40 %	0 %	385801146
99	NC_017456	TTTTG	2	10	201233	201242	0 %	80 %	20 %	0 %	385801147
100	NC_017456	TGAAT	2	10	201401	201410	40 %	40 %	20 %	0 %	385801147
101	NC_017456	TTGCA	2	10	204897	204906	20 %	40 %	20 %	20 %	385801152
102	NC_017456	ACAAT	2	10	206306	206315	60 %	20 %	0 %	20 %	385801153
103	NC_017456	CACTT	2	10	210165	210174	20 %	40 %	0 %	40 %	385801158
104	NC_017456	TCAGC	2	10	210945	210954	20 %	20 %	20 %	40 %	385801159
105	NC_017456	AGACG	2	10	211620	211629	40 %	0 %	40 %	20 %	385801160
106	NC_017456	CCAGC	2	10	220615	220624	20 %	0 %	20 %	60 %	385801168
107	NC_017456	GTTTT	2	10	222475	222484	0 %	80 %	20 %	0 %	385801169
108	NC_017456	GCGTT	2	10	224197	224206	0 %	40 %	40 %	20 %	385801169
109	NC_017456	GTATT	2	10	225378	225387	20 %	60 %	20 %	0 %	385801171
110	NC_017456	TGCAT	2	10	225969	225978	20 %	40 %	20 %	20 %	385801171
111	NC_017456	AACTT	2	10	230867	230876	40 %	40 %	0 %	20 %	385801175
112	NC_017456	GCTTG	2	10	231468	231477	0 %	40 %	40 %	20 %	385801175
113	NC_017456	TAACA	2	10	232790	232799	60 %	20 %	0 %	20 %	385801176
114	NC_017456	CACAA	2	10	234529	234538	60 %	0 %	0 %	40 %	385801177
115	NC_017456	TTGGA	2	10	234891	234900	20 %	40 %	40 %	0 %	385801177
116	NC_017456	AAATA	2	10	242879	242888	80 %	20 %	0 %	0 %	385801183
117	NC_017456	TAATG	2	10	243870	243879	40 %	40 %	20 %	0 %	385801183
118	NC_017456	AAAAG	2	10	247016	247025	80 %	0 %	20 %	0 %	385801185
119	NC_017456	GTGGC	2	10	248216	248225	0 %	20 %	60 %	20 %	385801186
120	NC_017456	CTTGG	2	10	251706	251715	0 %	40 %	40 %	20 %	385801187
121	NC_017456	GGAGC	2	10	252508	252517	20 %	0 %	60 %	20 %	385801187
122	NC_017456	TATGC	2	10	252629	252638	20 %	40 %	20 %	20 %	385801187
123	NC_017456	TGTTT	2	10	252978	252987	0 %	80 %	20 %	0 %	385801187
124	NC_017456	AAGAT	2	10	256056	256065	60 %	20 %	20 %	0 %	385801192
125	NC_017456	TGTTC	2	10	260301	260310	0 %	60 %	20 %	20 %	385801196
126	NC_017456	CTTCG	2	10	262736	262745	0 %	40 %	20 %	40 %	385801198
127	NC_017456	GTGCT	2	10	263165	263174	0 %	40 %	40 %	20 %	385801198
128	NC_017456	TTTAC	2	10	265934	265943	20 %	60 %	0 %	20 %	385801200
129	NC_017456	TGCTT	2	10	274994	275003	0 %	60 %	20 %	20 %	385801207
130	NC_017456	GCGCG	2	10	275531	275540	0 %	0 %	60 %	40 %	385801207
131	NC_017456	TCGCA	2	10	279251	279260	20 %	20 %	20 %	40 %	385801211
132	NC_017456	GTCGC	2	10	285154	285163	0 %	20 %	40 %	40 %	385801220
133	NC_017456	TTGGT	2	10	286946	286955	0 %	60 %	40 %	0 %	385801224
134	NC_017456	TTGGC	2	10	287138	287147	0 %	40 %	40 %	20 %	385801224
135	NC_017456	CGCAG	2	10	291081	291090	20 %	0 %	40 %	40 %	385801230
136	NC_017456	TTTGA	2	10	292338	292347	20 %	60 %	20 %	0 %	385801232
137	NC_017456	ACTTA	2	10	295111	295120	40 %	40 %	0 %	20 %	385801234
138	NC_017456	ATGTA	2	10	296237	296246	40 %	40 %	20 %	0 %	385801235
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141	NC_017456	TTGCG	2	10	303333	303342	0 %	40 %	40 %	20 %	385801241
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145	NC_017456	ATGGT	2	10	308164	308173	20 %	40 %	40 %	0 %	385801244
146	NC_017456	TTGGG	2	10	308683	308692	0 %	40 %	60 %	0 %	385801244
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152	NC_017456	ATGGA	2	10	319074	319083	40 %	20 %	40 %	0 %	385801253
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154	NC_017456	TTTTC	2	10	320731	320740	0 %	80 %	0 %	20 %	385801254
155	NC_017456	TTATA	2	10	321379	321388	40 %	60 %	0 %	0 %	385801255
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165	NC_017456	ATTTA	2	10	335408	335417	40 %	60 %	0 %	0 %	385801266
166	NC_017456	AAGCG	2	10	337311	337320	40 %	0 %	40 %	20 %	385801269
167	NC_017456	AGCGG	2	10	337393	337402	20 %	0 %	60 %	20 %	385801269
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172	NC_017456	CGAGC	2	10	347722	347731	20 %	0 %	40 %	40 %	385801271
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250	NC_017456	GCCAG	2	10	540414	540423	20 %	0 %	40 %	40 %	385801394
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254	NC_017456	ATGAG	2	10	552227	552236	40 %	20 %	40 %	0 %	385801405
255	NC_017456	CTTGA	2	10	553834	553843	20 %	40 %	20 %	20 %	385801406
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260	NC_017456	CTTGG	2	10	562547	562556	0 %	40 %	40 %	20 %	385801412
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