MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017456	GTTT	2	8	1751	1758	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017456	TAAA	2	8	1766	1773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017456	TAGT	2	8	1784	1791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017456	TTAC	2	8	2063	2070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017456	AACT	2	8	2073	2080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017456	ATAA	2	8	3274	3281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017456	ATGT	2	8	3282	3289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017456	TTTC	2	8	3637	3644	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017456	TCTA	2	8	3794	3801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017456	TTTA	2	8	4217	4224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017456	ATAA	2	8	7327	7334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017456	TTTA	2	8	10972	10979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017456	TTTA	3	12	11720	11731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017456	GATG	2	8	11744	11751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017456	ATTA	2	8	20772	20779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017456	TTAA	2	8	20790	20797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017456	TAGT	2	8	20823	20830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017456	TACT	2	8	20931	20938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017456	GATT	2	8	22933	22940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017456	ATTT	2	8	26124	26131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017456	TAAA	2	8	26145	26152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017456	GTTG	2	8	28773	28780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017456	CAAT	2	8	29903	29910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017456	CTTG	2	8	31166	31173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017456	ATTA	2	8	45419	45426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017456	TTCA	2	8	45440	45447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017456	GATT	2	8	46581	46588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017456	CGAA	2	8	47184	47191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017456	TTAA	2	8	50414	50421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017456	TGTT	2	8	50436	50443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017456	TTAA	2	8	50761	50768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017456	TGTT	2	8	53576	53583	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017456	TTAT	2	8	54994	55001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017456	ATTT	2	8	56319	56326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017456	AAGA	2	8	57835	57842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017456	AAAT	2	8	59606	59613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017456	ACGC	2	8	59763	59770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017456	ATAA	2	8	65533	65540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017456	TAAA	2	8	66588	66595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017456	TGAA	2	8	67577	67584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017456	CTTA	2	8	69002	69009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017456	GTTT	2	8	69118	69125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017456	CACT	2	8	73043	73050	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017456	CGTT	2	8	74718	74725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017456	GCTA	2	8	74761	74768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017456	GTTT	2	8	83523	83530	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017456	TATC	2	8	87255	87262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017456	AAAC	2	8	87400	87407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017456	GAAG	2	8	87459	87466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017456	AATA	2	8	88971	88978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017456	AATA	2	8	88981	88988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017456	TAAA	2	8	90348	90355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017456	TTAT	2	8	90373	90380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017456	AGCA	2	8	91673	91680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017456	ATGT	2	8	93503	93510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017456	AATG	2	8	94551	94558	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017456	TAAA	3	12	94664	94675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017456	TGGT	2	8	98157	98164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017456	CGGG	2	8	98695	98702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017456	GCGA	2	8	100199	100206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017456	TTGC	2	8	100882	100889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017456	GTAG	2	8	101572	101579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017456	ATAA	2	8	103593	103600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017456	TAGT	2	8	103679	103686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017456	GCAA	2	8	103757	103764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017456	CAAT	2	8	105264	105271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017456	ATCA	2	8	105401	105408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017456	CAAG	2	8	105804	105811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017456	CTCG	2	8	105977	105984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017456	TTGC	2	8	106087	106094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017456	ACTT	2	8	106615	106622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017456	TTAT	2	8	107038	107045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017456	CAAG	2	8	107962	107969	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017456	ATAA	2	8	108015	108022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017456	AAAT	2	8	110666	110673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017456	ATAA	2	8	110741	110748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017456	TTTA	2	8	110865	110872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017456	AATC	2	8	112077	112084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017456	AAGC	2	8	112222	112229	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017456	AAGA	2	8	113766	113773	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017456	CTTT	2	8	115628	115635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017456	GTTT	2	8	116011	116018	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017456	GTTT	2	8	116314	116321	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017456	TTCC	2	8	122012	122019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017456	TCTT	2	8	123668	123675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017456	AATA	2	8	123881	123888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017456	ATTT	2	8	123901	123908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017456	TAAT	2	8	126863	126870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017456	AGCG	2	8	128454	128461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017456	GTAA	2	8	128484	128491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017456	TTTG	2	8	130988	130995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017456	GGGA	2	8	135086	135093	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017456	TTTA	2	8	135146	135153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017456	CTTT	2	8	135168	135175	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017456	AAGG	2	8	142327	142334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017456	CGAC	2	8	142952	142959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017456	GCAC	2	8	143330	143337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017456	GTCG	2	8	144925	144932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017456	TCAT	2	8	145085	145092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017456	TTCT	2	8	145155	145162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017456	TCGT	2	8	145241	145248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017456	CTTT	2	8	145465	145472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017456	TCGT	2	8	145802	145809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017456	GTAT	2	8	148973	148980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017456	ATGG	2	8	149056	149063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017456	TTCT	2	8	149560	149567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017456	TCAA	2	8	149601	149608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017456	CTTG	2	8	149651	149658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017456	TGGT	2	8	153598	153605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017456	ACCA	2	8	153623	153630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017456	TCTA	2	8	154738	154745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017456	TTTC	2	8	154808	154815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017456	TAAC	2	8	155863	155870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017456	GAAA	2	8	155901	155908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017456	ATGA	2	8	155910	155917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017456	TCTA	2	8	156217	156224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017456	GAAT	2	8	156481	156488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017456	CAAA	2	8	157460	157467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017456	AAAG	2	8	157515	157522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017456	CGAA	2	8	157766	157773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017456	ATGA	2	8	158424	158431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017456	GTTT	2	8	163630	163637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017456	TGTT	2	8	163966	163973	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017456	GCTG	2	8	164030	164037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017456	TGGT	2	8	165076	165083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017456	TCGC	2	8	166913	166920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017456	GCAA	2	8	167895	167902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017456	GCAA	2	8	167909	167916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017456	TGTT	2	8	169230	169237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017456	AAGT	2	8	174896	174903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017456	GTTG	2	8	175016	175023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017456	GCAT	2	8	175275	175282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017456	AGCT	2	8	176641	176648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017456	AAAT	2	8	176734	176741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017456	GCAA	2	8	181736	181743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017456	AGTA	2	8	185716	185723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017456	AGAA	2	8	185724	185731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017456	TAAC	2	8	191087	191094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017456	AATA	2	8	191792	191799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017456	ATAA	3	12	191811	191822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017456	TAAT	2	8	197453	197460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017456	TGTT	2	8	197503	197510	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017456	TAAT	2	8	201091	201098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017456	TCGT	2	8	202368	202375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017456	AAAT	2	8	203463	203470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017456	ATCA	2	8	205590	205597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017456	ATTG	2	8	205708	205715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017456	GTAG	2	8	207042	207049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017456	AGAT	2	8	210904	210911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017456	AGTA	2	8	211767	211774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017456	TAAA	2	8	211822	211829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017456	TAAT	2	8	211861	211868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017456	ATGA	2	8	216486	216493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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