MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 3138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017456	GTAA	2	8	429	436	50 %	25 %	25 %	0 %	385800987
2	NC_017456	AACC	2	8	1362	1369	50 %	0 %	0 %	50 %	385800987
3	NC_017456	ATGC	2	8	1620	1627	25 %	25 %	25 %	25 %	385800987
4	NC_017456	ACAG	2	8	2657	2664	50 %	0 %	25 %	25 %	385800988
5	NC_017456	AGTA	2	8	2845	2852	50 %	25 %	25 %	0 %	385800988
6	NC_017456	TAAA	2	8	4573	4580	75 %	25 %	0 %	0 %	385800989
7	NC_017456	AATA	2	8	5018	5025	75 %	25 %	0 %	0 %	385800989
8	NC_017456	TAAG	2	8	6805	6812	50 %	25 %	25 %	0 %	385800990
9	NC_017456	GCAG	2	8	7038	7045	25 %	0 %	50 %	25 %	385800990
10	NC_017456	TATG	2	8	7604	7611	25 %	50 %	25 %	0 %	385800991
11	NC_017456	CTAT	2	8	7702	7709	25 %	50 %	0 %	25 %	385800991
12	NC_017456	ATTA	2	8	8177	8184	50 %	50 %	0 %	0 %	385800991
13	NC_017456	TGCT	2	8	8461	8468	0 %	50 %	25 %	25 %	385800991
14	NC_017456	AATG	2	8	8939	8946	50 %	25 %	25 %	0 %	385800991
15	NC_017456	TGGT	2	8	9739	9746	0 %	50 %	50 %	0 %	385800991
16	NC_017456	TGAG	2	8	9980	9987	25 %	25 %	50 %	0 %	385800991
17	NC_017456	TTAG	2	8	10132	10139	25 %	50 %	25 %	0 %	385800992
18	NC_017456	TGGT	2	8	10241	10248	0 %	50 %	50 %	0 %	385800992
19	NC_017456	TTCT	2	8	10355	10362	0 %	75 %	0 %	25 %	385800992
20	NC_017456	CTCA	2	8	11538	11545	25 %	25 %	0 %	50 %	385800994
21	NC_017456	AATC	2	8	11988	11995	50 %	25 %	0 %	25 %	385800995
22	NC_017456	GAAT	2	8	12029	12036	50 %	25 %	25 %	0 %	385800995
23	NC_017456	GTTC	2	8	12669	12676	0 %	50 %	25 %	25 %	385800996
24	NC_017456	AATC	2	8	12972	12979	50 %	25 %	0 %	25 %	385800996
25	NC_017456	ATTG	2	8	14010	14017	25 %	50 %	25 %	0 %	385800997
26	NC_017456	GATG	2	8	14369	14376	25 %	25 %	50 %	0 %	385800997
27	NC_017456	GATA	2	8	15053	15060	50 %	25 %	25 %	0 %	385800998
28	NC_017456	TTTG	2	8	15338	15345	0 %	75 %	25 %	0 %	385800998
29	NC_017456	TGTT	2	8	15502	15509	0 %	75 %	25 %	0 %	385800998
30	NC_017456	TTTA	2	8	15783	15790	25 %	75 %	0 %	0 %	385800998
31	NC_017456	TGCT	2	8	16048	16055	0 %	50 %	25 %	25 %	385800998
32	NC_017456	AAGC	2	8	17104	17111	50 %	0 %	25 %	25 %	385800999
33	NC_017456	TGGG	2	8	17541	17548	0 %	25 %	75 %	0 %	385800999
34	NC_017456	AGTT	2	8	17695	17702	25 %	50 %	25 %	0 %	385801000
35	NC_017456	TAGA	2	8	17719	17726	50 %	25 %	25 %	0 %	385801000
36	NC_017456	AGAC	2	8	18434	18441	50 %	0 %	25 %	25 %	385801000
37	NC_017456	AGAA	2	8	18482	18489	75 %	0 %	25 %	0 %	385801000
38	NC_017456	AATT	2	8	18690	18697	50 %	50 %	0 %	0 %	385801001
39	NC_017456	AATG	2	8	18976	18983	50 %	25 %	25 %	0 %	385801001
40	NC_017456	AAAC	2	8	21012	21019	75 %	0 %	0 %	25 %	385801002
41	NC_017456	GAAA	2	8	21967	21974	75 %	0 %	25 %	0 %	385801002
42	NC_017456	ACAA	2	8	22372	22379	75 %	0 %	0 %	25 %	385801003
43	NC_017456	TTTC	2	8	22718	22725	0 %	75 %	0 %	25 %	385801003
44	NC_017456	TGGT	2	8	23188	23195	0 %	50 %	50 %	0 %	385801004
45	NC_017456	ATTT	2	8	23418	23425	25 %	75 %	0 %	0 %	385801005
46	NC_017456	TTGC	2	8	23712	23719	0 %	50 %	25 %	25 %	385801005
47	NC_017456	CATT	2	8	23985	23992	25 %	50 %	0 %	25 %	385801005
48	NC_017456	TTGC	2	8	24469	24476	0 %	50 %	25 %	25 %	385801005
49	NC_017456	ATAG	2	8	24963	24970	50 %	25 %	25 %	0 %	385801006
50	NC_017456	AACA	2	8	25424	25431	75 %	0 %	0 %	25 %	385801006
51	NC_017456	CAAA	2	8	25548	25555	75 %	0 %	0 %	25 %	385801006
52	NC_017456	TGTA	2	8	25889	25896	25 %	50 %	25 %	0 %	385801007
53	NC_017456	TAGA	2	8	26023	26030	50 %	25 %	25 %	0 %	385801007
54	NC_017456	GTAG	2	8	27406	27413	25 %	25 %	50 %	0 %	385801008
55	NC_017456	CTTG	2	8	27760	27767	0 %	50 %	25 %	25 %	385801008
56	NC_017456	GCGA	2	8	28298	28305	25 %	0 %	50 %	25 %	385801008
57	NC_017456	GACG	2	8	30716	30723	25 %	0 %	50 %	25 %	385801011
58	NC_017456	GCAA	2	8	31312	31319	50 %	0 %	25 %	25 %	385801012
59	NC_017456	AGCA	2	8	31523	31530	50 %	0 %	25 %	25 %	385801012
60	NC_017456	CCAG	2	8	31775	31782	25 %	0 %	25 %	50 %	385801012
61	NC_017456	AATC	2	8	31843	31850	50 %	25 %	0 %	25 %	385801012
62	NC_017456	ACAA	2	8	31896	31903	75 %	0 %	0 %	25 %	385801012
63	NC_017456	GCGT	2	8	33542	33549	0 %	25 %	50 %	25 %	385801013
64	NC_017456	TAAA	2	8	33724	33731	75 %	25 %	0 %	0 %	385801013
65	NC_017456	TCCA	2	8	33739	33746	25 %	25 %	0 %	50 %	385801013
66	NC_017456	GAGC	2	8	34283	34290	25 %	0 %	50 %	25 %	385801013
67	NC_017456	GTTG	2	8	36489	36496	0 %	50 %	50 %	0 %	385801014
68	NC_017456	CGAG	2	8	36599	36606	25 %	0 %	50 %	25 %	385801014
69	NC_017456	AGTT	2	8	37376	37383	25 %	50 %	25 %	0 %	385801015
70	NC_017456	GCAA	2	8	37965	37972	50 %	0 %	25 %	25 %	385801016
71	NC_017456	TTTG	2	8	38857	38864	0 %	75 %	25 %	0 %	385801017
72	NC_017456	TTTC	2	8	38987	38994	0 %	75 %	0 %	25 %	385801017
73	NC_017456	TTTC	2	8	39026	39033	0 %	75 %	0 %	25 %	385801017
74	NC_017456	TTGG	2	8	39800	39807	0 %	50 %	50 %	0 %	385801017
75	NC_017456	TGAT	2	8	41452	41459	25 %	50 %	25 %	0 %	385801020
76	NC_017456	CTTG	2	8	41489	41496	0 %	50 %	25 %	25 %	385801020
77	NC_017456	TTGC	2	8	41508	41515	0 %	50 %	25 %	25 %	385801020
78	NC_017456	ATCT	2	8	41617	41624	25 %	50 %	0 %	25 %	385801020
79	NC_017456	GCTA	2	8	42275	42282	25 %	25 %	25 %	25 %	385801020
80	NC_017456	CATC	2	8	42621	42628	25 %	25 %	0 %	50 %	385801020
81	NC_017456	GCGT	2	8	42649	42656	0 %	25 %	50 %	25 %	385801020
82	NC_017456	TGGA	2	8	42715	42722	25 %	25 %	50 %	0 %	385801020
83	NC_017456	GCGA	2	8	43831	43838	25 %	0 %	50 %	25 %	385801021
84	NC_017456	ATTT	2	8	43955	43962	25 %	75 %	0 %	0 %	385801021
85	NC_017456	CTGG	2	8	44966	44973	0 %	25 %	50 %	25 %	385801021
86	NC_017456	TAAA	2	8	46219	46226	75 %	25 %	0 %	0 %	385801022
87	NC_017456	CTGT	2	8	47555	47562	0 %	50 %	25 %	25 %	385801023
88	NC_017456	TCAT	2	8	47663	47670	25 %	50 %	0 %	25 %	385801023
89	NC_017456	TGAT	2	8	47831	47838	25 %	50 %	25 %	0 %	385801023
90	NC_017456	TTTA	2	8	48570	48577	25 %	75 %	0 %	0 %	385801024
91	NC_017456	TATG	2	8	48691	48698	25 %	50 %	25 %	0 %	385801024
92	NC_017456	TTTC	2	8	49294	49301	0 %	75 %	0 %	25 %	385801024
93	NC_017456	TTGG	2	8	49331	49338	0 %	50 %	50 %	0 %	385801024
94	NC_017456	TTTG	2	8	49385	49392	0 %	75 %	25 %	0 %	385801024
95	NC_017456	AGGA	2	8	49484	49491	50 %	0 %	50 %	0 %	385801024
96	NC_017456	GAAA	2	8	49780	49787	75 %	0 %	25 %	0 %	385801025
97	NC_017456	TGAT	2	8	49911	49918	25 %	50 %	25 %	0 %	385801026
98	NC_017456	GATA	2	8	49925	49932	50 %	25 %	25 %	0 %	385801026
99	NC_017456	ATTG	2	8	50293	50300	25 %	50 %	25 %	0 %	385801027
100	NC_017456	ATGT	2	8	51198	51205	25 %	50 %	25 %	0 %	385801028
101	NC_017456	TGTA	2	8	51389	51396	25 %	50 %	25 %	0 %	385801028
102	NC_017456	CTTC	2	8	51562	51569	0 %	50 %	0 %	50 %	385801028
103	NC_017456	TCAA	2	8	52100	52107	50 %	25 %	0 %	25 %	385801029
104	NC_017456	GCTT	2	8	52226	52233	0 %	50 %	25 %	25 %	385801029
105	NC_017456	TGGT	2	8	52247	52254	0 %	50 %	50 %	0 %	385801029
106	NC_017456	TATG	2	8	52976	52983	25 %	50 %	25 %	0 %	385801029
107	NC_017456	TGCT	2	8	54365	54372	0 %	50 %	25 %	25 %	385801031
108	NC_017456	TCCA	2	8	55146	55153	25 %	25 %	0 %	50 %	385801032
109	NC_017456	TCAT	2	8	55965	55972	25 %	50 %	0 %	25 %	385801032
110	NC_017456	CGAT	2	8	57364	57371	25 %	25 %	25 %	25 %	385801033
111	NC_017456	ATGA	2	8	57858	57865	50 %	25 %	25 %	0 %	385801034
112	NC_017456	TGGC	2	8	59329	59336	0 %	25 %	50 %	25 %	385801035
113	NC_017456	CTTC	2	8	60218	60225	0 %	50 %	0 %	50 %	385801036
114	NC_017456	AAAG	2	8	60321	60328	75 %	0 %	25 %	0 %	385801036
115	NC_017456	AGAC	2	8	60572	60579	50 %	0 %	25 %	25 %	385801036
116	NC_017456	CCAA	2	8	60758	60765	50 %	0 %	0 %	50 %	385801036
117	NC_017456	GCTT	2	8	60869	60876	0 %	50 %	25 %	25 %	385801036
118	NC_017456	ACCG	2	8	61036	61043	25 %	0 %	25 %	50 %	385801036
119	NC_017456	TAGG	2	8	61577	61584	25 %	25 %	50 %	0 %	385801037
120	NC_017456	CAAC	2	8	62394	62401	50 %	0 %	0 %	50 %	385801037
121	NC_017456	TGAT	2	8	62889	62896	25 %	50 %	25 %	0 %	385801038
122	NC_017456	TTCT	2	8	63336	63343	0 %	75 %	0 %	25 %	385801038
123	NC_017456	TTGG	2	8	63662	63669	0 %	50 %	50 %	0 %	385801038
124	NC_017456	GCTT	2	8	64278	64285	0 %	50 %	25 %	25 %	385801038
125	NC_017456	AAAC	2	8	64553	64560	75 %	0 %	0 %	25 %	385801039
126	NC_017456	TTGA	2	8	64924	64931	25 %	50 %	25 %	0 %	385801039
127	NC_017456	TGGT	2	8	65000	65007	0 %	50 %	50 %	0 %	385801039
128	NC_017456	GTTG	2	8	65793	65800	0 %	50 %	50 %	0 %	385801040
129	NC_017456	AAAC	2	8	65816	65823	75 %	0 %	0 %	25 %	385801040
130	NC_017456	TGGC	2	8	66173	66180	0 %	25 %	50 %	25 %	385801040
131	NC_017456	AGGC	2	8	66731	66738	25 %	0 %	50 %	25 %	385801041
132	NC_017456	GCAA	2	8	67438	67445	50 %	0 %	25 %	25 %	385801041
133	NC_017456	TTAT	2	8	69765	69772	25 %	75 %	0 %	0 %	385801043
134	NC_017456	AAGA	2	8	70068	70075	75 %	0 %	25 %	0 %	385801043
135	NC_017456	CTTC	2	8	70159	70166	0 %	50 %	0 %	50 %	385801044
136	NC_017456	GGCT	2	8	70546	70553	0 %	25 %	50 %	25 %	385801044
137	NC_017456	GCTC	2	8	70586	70593	0 %	25 %	25 %	50 %	385801044
138	NC_017456	CTGC	2	8	72275	72282	0 %	25 %	25 %	50 %	385801044
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