MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 21490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017456	GCC	2	6	153	158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385800987
2	NC_017456	AAC	2	6	260	265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800987
3	NC_017456	CTT	2	6	337	342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800987
4	NC_017456	ATA	2	6	463	468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800987
5	NC_017456	ATA	2	6	475	480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800987
6	NC_017456	TTC	2	6	506	511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800987
7	NC_017456	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800987
8	NC_017456	TTC	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800987
9	NC_017456	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800987
10	NC_017456	CTA	2	6	1005	1010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800987
11	NC_017456	GAT	2	6	1014	1019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800987
12	NC_017456	GGT	2	6	1032	1037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800987
13	NC_017456	AAG	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800987
14	NC_017456	TAA	2	6	1091	1096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800987
15	NC_017456	ATG	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800987
16	NC_017456	CGG	2	6	1342	1347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385800987
17	NC_017456	ATC	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800987
18	NC_017456	TGA	2	6	1481	1486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800987
19	NC_017456	TGG	2	6	1595	1600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800987
20	NC_017456	CTT	2	6	2175	2180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800988
21	NC_017456	TTC	2	6	2274	2279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800988
22	NC_017456	CAT	2	6	2315	2320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800988
23	NC_017456	ACT	2	6	2429	2434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800988
24	NC_017456	TCT	2	6	2444	2449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800988
25	NC_017456	AGT	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800988
26	NC_017456	AGA	3	9	2587	2595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800988
27	NC_017456	GAT	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800988
28	NC_017456	TGA	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800988
29	NC_017456	ATT	2	6	2924	2929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800988
30	NC_017456	TTA	2	6	2943	2948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800988
31	NC_017456	TTG	2	6	2970	2975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800988
32	NC_017456	ATT	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800988
33	NC_017456	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800988
34	NC_017456	TTG	2	6	3249	3254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800988
35	NC_017456	AAT	2	6	4556	4561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800989
36	NC_017456	TTA	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800989
37	NC_017456	TAA	2	6	4748	4753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800989
38	NC_017456	TGG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800989
39	NC_017456	TAA	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800989
40	NC_017456	GAA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800990
41	NC_017456	TGA	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
42	NC_017456	ATG	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
43	NC_017456	ACC	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385800990
44	NC_017456	TGA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
45	NC_017456	GAT	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
46	NC_017456	TGG	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800990
47	NC_017456	GGC	2	6	5595	5600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385800990
48	NC_017456	TGG	2	6	5615	5620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800990
49	NC_017456	GTT	2	6	5643	5648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800990
50	NC_017456	TCG	2	6	5681	5686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800990
51	NC_017456	GAA	2	6	5760	5765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800990
52	NC_017456	AAC	2	6	5819	5824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800990
53	NC_017456	CAG	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800990
54	NC_017456	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
55	NC_017456	GAA	2	6	5964	5969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800990
56	NC_017456	ACT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800990
57	NC_017456	ACT	2	6	6177	6182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800990
58	NC_017456	GGT	2	6	6186	6191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800990
59	NC_017456	GAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800990
60	NC_017456	CAG	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800990
61	NC_017456	ATT	2	6	6465	6470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800990
62	NC_017456	CTG	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800990
63	NC_017456	TAA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800990
64	NC_017456	AGA	2	6	6599	6604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800990
65	NC_017456	ATG	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
66	NC_017456	TAA	2	6	6763	6768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800990
67	NC_017456	CTG	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800990
68	NC_017456	ATT	2	6	6831	6836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800990
69	NC_017456	TTC	2	6	6891	6896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800990
70	NC_017456	CAG	2	6	6919	6924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800990
71	NC_017456	GCC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385800990
72	NC_017456	AAC	2	6	7118	7123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800990
73	NC_017456	TGC	2	6	7169	7174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800990
74	NC_017456	TGA	2	6	7181	7186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
75	NC_017456	ATG	2	6	7252	7257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800990
76	NC_017456	CGC	2	6	7364	7369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385800991
77	NC_017456	ATG	2	6	7372	7377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
78	NC_017456	ATA	2	6	7438	7443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800991
79	NC_017456	GCA	2	6	7490	7495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800991
80	NC_017456	TTG	2	6	7537	7542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
81	NC_017456	TCG	2	6	7586	7591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800991
82	NC_017456	GGC	2	6	7614	7619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385800991
83	NC_017456	ACA	2	6	7639	7644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800991
84	NC_017456	GTT	2	6	7656	7661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
85	NC_017456	ATC	2	6	7681	7686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800991
86	NC_017456	TTG	2	6	7756	7761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
87	NC_017456	TGA	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
88	NC_017456	GCA	3	9	7800	7808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800991
89	NC_017456	CTG	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800991
90	NC_017456	CAA	2	6	7987	7992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800991
91	NC_017456	ATA	2	6	8005	8010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385800991
92	NC_017456	ACC	2	6	8047	8052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385800991
93	NC_017456	AGT	2	6	8195	8200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
94	NC_017456	GCT	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800991
95	NC_017456	GTT	2	6	8403	8408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
96	NC_017456	AAC	2	6	8412	8417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800991
97	NC_017456	TCA	2	6	8528	8533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800991
98	NC_017456	AGA	2	6	8579	8584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800991
99	NC_017456	TCT	2	6	8655	8660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800991
100	NC_017456	TGA	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
101	NC_017456	GAA	2	6	8793	8798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800991
102	NC_017456	TTG	2	6	8860	8865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
103	NC_017456	TGA	2	6	8876	8881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
104	NC_017456	TTG	2	6	8884	8889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
105	NC_017456	TGA	2	6	8900	8905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
106	NC_017456	TTC	2	6	8920	8925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800991
107	NC_017456	GAA	2	6	8964	8969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800991
108	NC_017456	GTT	3	9	8973	8981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
109	NC_017456	GAT	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
110	NC_017456	CTT	2	6	9098	9103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800991
111	NC_017456	GTT	3	9	9125	9133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
112	NC_017456	ATG	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
113	NC_017456	GGT	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385800991
114	NC_017456	GAA	2	6	9396	9401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800991
115	NC_017456	CTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385800991
116	NC_017456	AGA	2	6	9449	9454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800991
117	NC_017456	ATT	2	6	9459	9464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385800991
118	NC_017456	GAT	2	6	9504	9509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
119	NC_017456	GCC	2	6	9529	9534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385800991
120	NC_017456	CGA	2	6	9572	9577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385800991
121	NC_017456	TGT	2	6	9593	9598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
122	NC_017456	TCT	2	6	9620	9625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385800991
123	NC_017456	GTT	2	6	9627	9632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385800991
124	NC_017456	GAA	2	6	9685	9690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800991
125	NC_017456	GAA	2	6	9759	9764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800991
126	NC_017456	AAC	2	6	9842	9847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385800991
127	NC_017456	ATC	2	6	9888	9893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385800991
128	NC_017456	GAT	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385800991
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130	NC_017456	AGA	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385800991
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