MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 2163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017456	AT	3	6	893	898	50 %	50 %	0 %	0 %	385800987
2	NC_017456	CT	3	6	2303	2308	0 %	50 %	0 %	50 %	385800988
3	NC_017456	TA	3	6	4839	4844	50 %	50 %	0 %	0 %	385800989
4	NC_017456	GC	3	6	6716	6721	0 %	0 %	50 %	50 %	385800990
5	NC_017456	GC	3	6	7544	7549	0 %	0 %	50 %	50 %	385800991
6	NC_017456	TC	3	6	10322	10327	0 %	50 %	0 %	50 %	385800992
7	NC_017456	TA	3	6	10412	10417	50 %	50 %	0 %	0 %	385800992
8	NC_017456	TC	3	6	10680	10685	0 %	50 %	0 %	50 %	385800993
9	NC_017456	GA	3	6	11977	11982	50 %	0 %	50 %	0 %	385800995
10	NC_017456	TA	3	6	13166	13171	50 %	50 %	0 %	0 %	385800997
11	NC_017456	AT	3	6	14897	14902	50 %	50 %	0 %	0 %	385800998
12	NC_017456	AT	3	6	16007	16012	50 %	50 %	0 %	0 %	385800998
13	NC_017456	GA	4	8	16164	16171	50 %	0 %	50 %	0 %	385800998
14	NC_017456	AT	3	6	18206	18211	50 %	50 %	0 %	0 %	385801000
15	NC_017456	AT	3	6	18258	18263	50 %	50 %	0 %	0 %	385801000
16	NC_017456	TC	3	6	18264	18269	0 %	50 %	0 %	50 %	385801000
17	NC_017456	AG	3	6	18818	18823	50 %	0 %	50 %	0 %	385801001
18	NC_017456	GA	3	6	21071	21076	50 %	0 %	50 %	0 %	385801002
19	NC_017456	GC	3	6	21231	21236	0 %	0 %	50 %	50 %	385801002
20	NC_017456	GA	3	6	21267	21272	50 %	0 %	50 %	0 %	385801002
21	NC_017456	AT	3	6	24509	24514	50 %	50 %	0 %	0 %	385801005
22	NC_017456	AT	3	6	24995	25000	50 %	50 %	0 %	0 %	385801006
23	NC_017456	GA	3	6	25370	25375	50 %	0 %	50 %	0 %	385801006
24	NC_017456	CA	3	6	25556	25561	50 %	0 %	0 %	50 %	385801006
25	NC_017456	CA	3	6	29244	29249	50 %	0 %	0 %	50 %	385801009
26	NC_017456	AC	3	6	30383	30388	50 %	0 %	0 %	50 %	385801011
27	NC_017456	CA	3	6	30597	30602	50 %	0 %	0 %	50 %	385801011
28	NC_017456	GA	3	6	30638	30643	50 %	0 %	50 %	0 %	385801011
29	NC_017456	GC	3	6	32721	32726	0 %	0 %	50 %	50 %	385801012
30	NC_017456	CG	3	6	34192	34197	0 %	0 %	50 %	50 %	385801013
31	NC_017456	CG	3	6	34573	34578	0 %	0 %	50 %	50 %	385801013
32	NC_017456	CG	3	6	34662	34667	0 %	0 %	50 %	50 %	385801013
33	NC_017456	TG	3	6	37167	37172	0 %	50 %	50 %	0 %	385801015
34	NC_017456	GC	3	6	37719	37724	0 %	0 %	50 %	50 %	385801015
35	NC_017456	CG	3	6	38085	38090	0 %	0 %	50 %	50 %	385801016
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38	NC_017456	AT	3	6	39243	39248	50 %	50 %	0 %	0 %	385801017
39	NC_017456	GT	3	6	41679	41684	0 %	50 %	50 %	0 %	385801020
40	NC_017456	CG	3	6	42013	42018	0 %	0 %	50 %	50 %	385801020
41	NC_017456	GC	3	6	43354	43359	0 %	0 %	50 %	50 %	385801020
42	NC_017456	AC	3	6	43418	43423	50 %	0 %	0 %	50 %	385801020
43	NC_017456	CG	3	6	43587	43592	0 %	0 %	50 %	50 %	385801020
44	NC_017456	GC	3	6	44329	44334	0 %	0 %	50 %	50 %	385801021
45	NC_017456	AC	3	6	44367	44372	50 %	0 %	0 %	50 %	385801021
46	NC_017456	AG	3	6	45130	45135	50 %	0 %	50 %	0 %	385801021
47	NC_017456	GT	3	6	45634	45639	0 %	50 %	50 %	0 %	385801022
48	NC_017456	GA	3	6	47360	47365	50 %	0 %	50 %	0 %	385801023
49	NC_017456	GA	3	6	47546	47551	50 %	0 %	50 %	0 %	385801023
50	NC_017456	TG	3	6	48289	48294	0 %	50 %	50 %	0 %	385801024
51	NC_017456	TA	3	6	48589	48594	50 %	50 %	0 %	0 %	385801024
52	NC_017456	AG	3	6	48631	48636	50 %	0 %	50 %	0 %	385801024
53	NC_017456	AT	3	6	48779	48784	50 %	50 %	0 %	0 %	385801024
54	NC_017456	GT	3	6	49633	49638	0 %	50 %	50 %	0 %	385801025
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57	NC_017456	TA	3	6	52558	52563	50 %	50 %	0 %	0 %	385801029
58	NC_017456	AT	3	6	55168	55173	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
59	NC_017456	AT	3	6	55515	55520	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
60	NC_017456	GT	3	6	55533	55538	0 %	50 %	50 %	0 %	385801032
61	NC_017456	TA	3	6	55850	55855	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
62	NC_017456	GT	3	6	56178	56183	0 %	50 %	50 %	0 %	385801032
63	NC_017456	AT	3	6	57240	57245	50 %	50 %	0 %	0 %	385801033
64	NC_017456	AC	3	6	57259	57264	50 %	0 %	0 %	50 %	385801033
65	NC_017456	AT	3	6	57370	57375	50 %	50 %	0 %	0 %	385801033
66	NC_017456	GC	3	6	59288	59293	0 %	0 %	50 %	50 %	385801035
67	NC_017456	TA	3	6	60253	60258	50 %	50 %	0 %	0 %	385801036
68	NC_017456	CT	3	6	61019	61024	0 %	50 %	0 %	50 %	385801036
69	NC_017456	AG	3	6	61829	61834	50 %	0 %	50 %	0 %	385801037
70	NC_017456	CG	3	6	62647	62652	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
71	NC_017456	CG	3	6	62754	62759	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
72	NC_017456	GC	3	6	63019	63024	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
73	NC_017456	CG	3	6	64272	64277	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
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81	NC_017456	CG	3	6	68698	68703	0 %	0 %	50 %	50 %	385801042
82	NC_017456	CG	3	6	69566	69571	0 %	0 %	50 %	50 %	385801043
83	NC_017456	TA	3	6	70305	70310	50 %	50 %	0 %	0 %	385801044
84	NC_017456	CT	3	6	70323	70328	0 %	50 %	0 %	50 %	385801044
85	NC_017456	TA	3	6	71028	71033	50 %	50 %	0 %	0 %	385801044
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102	NC_017456	GC	3	6	79226	79231	0 %	0 %	50 %	50 %	385801049
103	NC_017456	CG	3	6	79995	80000	0 %	0 %	50 %	50 %	385801050
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108	NC_017456	GC	3	6	81853	81858	0 %	0 %	50 %	50 %	385801051
109	NC_017456	CT	3	6	82099	82104	0 %	50 %	0 %	50 %	385801051
110	NC_017456	CG	3	6	83145	83150	0 %	0 %	50 %	50 %	385801051
111	NC_017456	TA	3	6	83302	83307	50 %	50 %	0 %	0 %	385801051
112	NC_017456	GC	3	6	83848	83853	0 %	0 %	50 %	50 %	385801052
113	NC_017456	GC	3	6	84752	84757	0 %	0 %	50 %	50 %	385801053
114	NC_017456	GC	4	8	85263	85270	0 %	0 %	50 %	50 %	385801054
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119	NC_017456	TG	3	6	89263	89268	0 %	50 %	50 %	0 %	385801057
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121	NC_017456	GC	3	6	95179	95184	0 %	0 %	50 %	50 %	385801062
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123	NC_017456	GC	3	6	96934	96939	0 %	0 %	50 %	50 %	385801063
124	NC_017456	GC	4	8	97033	97040	0 %	0 %	50 %	50 %	385801063
125	NC_017456	TG	3	6	97252	97257	0 %	50 %	50 %	0 %	385801063
126	NC_017456	TG	3	6	97462	97467	0 %	50 %	50 %	0 %	385801063
127	NC_017456	TA	4	8	97507	97514	50 %	50 %	0 %	0 %	385801063
128	NC_017456	AT	3	6	97551	97556	50 %	50 %	0 %	0 %	385801063
129	NC_017456	CA	3	6	104021	104026	50 %	0 %	0 %	50 %	385801066
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141	NC_017456	TG	3	6	114592	114597	0 %	50 %	50 %	0 %	385801075
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