MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 1833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017455	CAAAAA	2	12	613	624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385798918
2	NC_017455	AATAAA	2	12	3216	3227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385798920
3	NC_017455	GATTTT	2	12	5374	5385	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385798923
4	NC_017455	TATAAA	2	12	5433	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798923
5	NC_017455	CTGATG	2	12	6326	6337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385798923
6	NC_017455	ATTCTT	2	12	8435	8446	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385798924
7	NC_017455	TAAAAA	2	12	9373	9384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017455	CAAATT	2	12	10348	10359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017455	TTATAT	2	12	13694	13705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017455	CATTAG	2	12	14244	14255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017455	GTTTTT	2	12	16183	16194	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385798925
12	NC_017455	TTGCTG	2	12	16352	16363	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385798925
13	NC_017455	AAAGAT	2	12	19754	19765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385798928
14	NC_017455	AGCTGG	2	12	19876	19887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385798928
15	NC_017455	ATTAAA	2	12	20044	20055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798928
16	NC_017455	AGCTGC	2	12	20094	20105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385798929
17	NC_017455	TTAAAG	2	12	20668	20679	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385798929
18	NC_017455	GCAGCT	2	12	22110	22121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385798931
19	NC_017455	GGAATT	2	12	24387	24398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798932
20	NC_017455	TGATTT	2	12	25041	25052	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385798933
21	NC_017455	CTACTT	2	12	25325	25336	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385798933
22	NC_017455	AATCAA	2	12	25465	25476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385798934
23	NC_017455	ATTTAA	2	12	25895	25906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017455	ATTTAG	2	12	27937	27948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385798936
25	NC_017455	TTGATC	2	12	28960	28971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385798937
26	NC_017455	GGTGCT	2	12	30101	30112	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385798938
27	NC_017455	GATTTT	2	12	32303	32314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385798940
28	NC_017455	AACTCA	2	12	33307	33318	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385798940
29	NC_017455	TATTTA	2	12	35346	35357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798942
30	NC_017455	TCTAAT	2	12	35663	35674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385798942
31	NC_017455	TTAAAA	2	12	36537	36548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798943
32	NC_017455	TGCAGC	2	12	37837	37848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385798944
33	NC_017455	TTTAAA	2	12	38728	38739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017455	GGAGAA	2	12	40224	40235	50 %	0 %	50 %	0 %	385798946
35	NC_017455	TTTGGT	2	12	40596	40607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798946
36	NC_017455	AAGTGA	2	12	41411	41422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385798947
37	NC_017455	ATTTTA	2	12	41790	41801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385798948
38	NC_017455	ACTTTA	2	12	43314	43325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385798950
39	NC_017455	CTTAAA	2	12	44337	44348	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017455	TTGCTT	2	12	44802	44813	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385798951
41	NC_017455	TTGCTT	2	12	44955	44966	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385798952
42	NC_017455	ATGCTG	2	12	45234	45245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385798952
43	NC_017455	AGAATT	2	12	45676	45687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385798952
44	NC_017455	AGTACA	2	12	45725	45736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385798952
45	NC_017455	ATTTTT	2	12	46614	46625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385798953
46	NC_017455	AAGTGA	2	12	46828	46839	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385798953
47	NC_017455	TTAAAA	2	12	47886	47897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798954
48	NC_017455	GAATTG	2	12	48274	48285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798954
49	NC_017455	TTAGTT	2	12	48566	48577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385798954
50	NC_017455	AAAGAA	2	12	50824	50835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385798957
51	NC_017455	AATGAA	2	12	51154	51165	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385798958
52	NC_017455	GATTAA	2	12	53591	53602	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385798960
53	NC_017455	AATTAA	2	12	53786	53797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798960
54	NC_017455	ATTTAA	2	12	54500	54511	50 %	50 %	0 %	0 %	385798962
55	NC_017455	TTATTT	2	12	55896	55907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385798962
56	NC_017455	TAATAT	2	12	56626	56637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017455	ATCAAA	2	12	65078	65089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385798969
58	NC_017455	TATCAA	2	12	68220	68231	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385798971
59	NC_017455	TTAAAA	2	12	68232	68243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798971
60	NC_017455	TACAGC	2	12	69550	69561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385798972
61	NC_017455	AAAATT	2	12	71794	71805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798974
62	NC_017455	TGGAAT	2	12	72511	72522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798974
63	NC_017455	GAAAAA	2	12	73178	73189	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385798974
64	NC_017455	AAATTA	2	12	73629	73640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017455	AAAGAA	2	12	74711	74722	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017455	AATTAA	2	12	83088	83099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017455	TAGAAT	2	12	84499	84510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385798982
68	NC_017455	TGCAAT	2	12	90058	90069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385798986
69	NC_017455	TGTAGT	2	12	93142	93153	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385798990
70	NC_017455	ATTAAT	2	12	94152	94163	50 %	50 %	0 %	0 %	385798992
71	NC_017455	ATAGAT	2	12	94960	94971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385798992
72	NC_017455	GAATTG	2	12	96156	96167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385798994
73	NC_017455	GGTGAT	2	12	97186	97197	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385798994
74	NC_017455	TTAGAA	2	12	97784	97795	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385798995
75	NC_017455	AGCTAC	2	12	97903	97914	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385798995
76	NC_017455	AGAATT	2	12	98065	98076	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385798995
77	NC_017455	TAAAAT	2	12	99470	99481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385798996
78	NC_017455	TGGTTT	2	12	101068	101079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385798997
79	NC_017455	GAAAAA	2	12	101830	101841	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385798998
80	NC_017455	ATATAA	2	12	103267	103278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017455	AGAAGT	2	12	104352	104363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385799000
82	NC_017455	GATATC	2	12	105779	105790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385799002
83	NC_017455	TTATGG	2	12	106884	106895	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385799002
84	NC_017455	GAAAAA	2	12	107871	107882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385799003
85	NC_017455	TTTAGA	2	12	109639	109650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385799005
86	NC_017455	TGAAGT	2	12	112194	112205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385799006
87	NC_017455	AGCTGA	2	12	113364	113375	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385799006
88	NC_017455	ACAGAA	2	12	114560	114571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385799007
89	NC_017455	CTTATT	2	12	115836	115847	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385799008
90	NC_017455	TTAAAT	2	12	116333	116344	50 %	50 %	0 %	0 %	385799009
91	NC_017455	TTGGTT	2	12	116748	116759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385799009
92	NC_017455	ATTTTT	2	12	117702	117713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017455	TACTTT	2	12	119285	119296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385799010
94	NC_017455	TAGCCA	2	12	122420	122431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385799014
95	NC_017455	TATTAA	2	12	122457	122468	50 %	50 %	0 %	0 %	385799014
96	NC_017455	ATAGAT	2	12	123499	123510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385799014
97	NC_017455	CTGAAA	2	12	123665	123676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385799014
98	NC_017455	ATCCAT	2	12	124042	124053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385799015
99	NC_017455	ATTTCA	2	12	124392	124403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385799015
100	NC_017455	TTTTAA	2	12	126014	126025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017455	GAAAAA	2	12	128557	128568	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385799017
102	NC_017455	TTAATT	2	12	128765	128776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385799018
103	NC_017455	GAAATG	2	12	131972	131983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385799019
104	NC_017455	GATGTA	2	12	132376	132387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385799020
105	NC_017455	TCTGAT	2	12	132694	132705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385799020
106	NC_017455	AGAAAT	2	12	133606	133617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385799021
107	NC_017455	TTATAA	2	12	134810	134821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017455	CTTTAG	2	12	136375	136386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385799024
109	NC_017455	GTAGAA	2	12	137176	137187	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385799025
110	NC_017455	TAGAAG	2	12	139111	139122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385799027
111	NC_017455	GAAAAA	2	12	139404	139415	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385799027
112	NC_017455	GATATT	2	12	140305	140316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385799028
113	NC_017455	GTAAAT	2	12	142103	142114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385799029
114	NC_017455	TTTACA	2	12	144365	144376	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385799031
115	NC_017455	AAAAGA	2	12	146422	146433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385799032
116	NC_017455	GAAAAA	2	12	148039	148050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385799033
117	NC_017455	TTTATA	2	12	148190	148201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385799033
118	NC_017455	GGAAAA	2	12	148276	148287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385799033
119	NC_017455	TAAGTT	2	12	149659	149670	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017455	AAAAAG	2	12	149935	149946	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385799034
121	NC_017455	AGTTTA	2	12	150279	150290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385799034
122	NC_017455	TTTTTG	2	12	152721	152732	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385799036
123	NC_017455	TAAATC	2	12	153680	153691	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385799037
124	NC_017455	GTCTGA	2	12	154333	154344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385799038
125	NC_017455	CAGGTA	2	12	154827	154838	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385799039
126	NC_017455	GAATTG	2	12	155160	155171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385799039
127	NC_017455	TGAAGT	2	12	155686	155697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385799040
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131	NC_017455	AGAAAT	2	12	157192	157203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385799042
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139	NC_017455	AATTTA	2	12	166678	166689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_017455	CAGAAG	2	12	178125	178136	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385799064
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159	NC_017455	TTTAAA	2	12	201327	201338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_017455	AATAAA	2	12	284260	284271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385799151
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235	NC_017455	AACTTA	2	12	293427	293438	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385799160
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237	NC_017455	CTTAGA	2	12	296012	296023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385799162
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476	NC_017455	ATTTTT	2	12	601819	601830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385799435
477	NC_017455	ATTTTT	2	12	603791	603802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385799438
478	NC_017455	AATTTA	2	12	604001	604012	50 %	50 %	0 %	0 %	385799438
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