MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 2706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017455	CTTGT	2	10	83	92	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017455	CTTTT	2	10	103	112	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017455	TTATT	2	10	2967	2976	20 %	80 %	0 %	0 %	385798919
4	NC_017455	AATTA	2	10	3237	3246	60 %	40 %	0 %	0 %	385798920
5	NC_017455	AATGA	2	10	4255	4264	60 %	20 %	20 %	0 %	385798921
6	NC_017455	ACTTT	2	10	6358	6367	20 %	60 %	0 %	20 %	385798923
7	NC_017455	AAAAT	2	10	9328	9337	80 %	20 %	0 %	0 %	385798924
8	NC_017455	TATAA	2	10	9522	9531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017455	TGATA	2	10	9924	9933	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017455	AGTTT	2	10	9967	9976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017455	TCAAG	2	10	10977	10986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017455	TAGTG	2	10	11065	11074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017455	TCGTG	2	10	11457	11466	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017455	GAATA	2	10	12017	12026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017455	TTTAA	2	10	12288	12297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017455	TTGAA	2	10	12376	12385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017455	ATACA	2	10	15453	15462	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017455	TATAG	2	10	15665	15674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017455	AAAAT	2	10	15931	15940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017455	TAATT	2	10	18561	18570	40 %	60 %	0 %	0 %	385798928
21	NC_017455	AGTAA	2	10	21740	21749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017455	TAATT	2	10	21824	21833	40 %	60 %	0 %	0 %	385798931
23	NC_017455	TTTAA	2	10	23427	23436	40 %	60 %	0 %	0 %	385798931
24	NC_017455	ATCTA	2	10	23721	23730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017455	TTTAG	2	10	24357	24366	20 %	60 %	20 %	0 %	385798932
26	NC_017455	TAATT	2	10	25791	25800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017455	TTTAT	2	10	26013	26022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017455	ATCTA	2	10	27135	27144	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017455	TTAGA	2	10	27147	27156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017455	GCTTG	2	10	27309	27318	0 %	40 %	40 %	20 %	385798936
31	NC_017455	TAAAT	2	10	27365	27374	60 %	40 %	0 %	0 %	385798936
32	NC_017455	TTTTA	2	10	28421	28430	20 %	80 %	0 %	0 %	385798937
33	NC_017455	TATAA	2	10	29261	29270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017455	CTGCA	2	10	32149	32158	20 %	20 %	20 %	40 %	385798940
35	NC_017455	AAAAG	2	10	32545	32554	80 %	0 %	20 %	0 %	385798940
36	NC_017455	AAGCC	2	10	32805	32814	40 %	0 %	20 %	40 %	385798940
37	NC_017455	GCAAT	2	10	34716	34725	40 %	20 %	20 %	20 %	385798941
38	NC_017455	TTTTA	2	10	35317	35326	20 %	80 %	0 %	0 %	385798942
39	NC_017455	ATTTA	2	10	35776	35785	40 %	60 %	0 %	0 %	385798942
40	NC_017455	AGTTA	2	10	37713	37722	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017455	TTTAG	2	10	38096	38105	20 %	60 %	20 %	0 %	385798944
42	NC_017455	AAGAA	2	10	38438	38447	80 %	0 %	20 %	0 %	385798944
43	NC_017455	TTAAT	2	10	38622	38631	40 %	60 %	0 %	0 %	385798944
44	NC_017455	GCTTA	2	10	38889	38898	20 %	40 %	20 %	20 %	385798945
45	NC_017455	AAATA	2	10	40508	40517	80 %	20 %	0 %	0 %	385798946
46	NC_017455	TTCAA	2	10	40559	40568	40 %	40 %	0 %	20 %	385798946
47	NC_017455	TAATT	2	10	41993	42002	40 %	60 %	0 %	0 %	385798948
48	NC_017455	CTAAA	2	10	42907	42916	60 %	20 %	0 %	20 %	385798949
49	NC_017455	ATCTT	2	10	43734	43743	20 %	60 %	0 %	20 %	385798950
50	NC_017455	TTGTT	2	10	44551	44560	0 %	80 %	20 %	0 %	385798951
51	NC_017455	TTTAT	2	10	44927	44936	20 %	80 %	0 %	0 %	385798952
52	NC_017455	GATTT	2	10	45020	45029	20 %	60 %	20 %	0 %	385798952
53	NC_017455	TTTTA	2	10	46099	46108	20 %	80 %	0 %	0 %	385798952
54	NC_017455	TTTAG	2	10	46204	46213	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017455	ATTTC	2	10	47370	47379	20 %	60 %	0 %	20 %	385798954
56	NC_017455	TTTTA	2	10	47852	47861	20 %	80 %	0 %	0 %	385798954
57	NC_017455	TTAAT	2	10	47995	48004	40 %	60 %	0 %	0 %	385798954
58	NC_017455	TGGTT	2	10	48465	48474	0 %	60 %	40 %	0 %	385798954
59	NC_017455	AAACA	2	10	49355	49364	80 %	0 %	0 %	20 %	385798955
60	NC_017455	TAAAA	2	10	52450	52459	80 %	20 %	0 %	0 %	385798959
61	NC_017455	TATTT	2	10	54396	54405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017455	ATTTA	2	10	54766	54775	40 %	60 %	0 %	0 %	385798962
63	NC_017455	AATTA	2	10	55738	55747	60 %	40 %	0 %	0 %	385798962
64	NC_017455	AATGT	2	10	57356	57365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017455	TAAAT	2	10	61065	61074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017455	AAAAT	2	10	61159	61168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017455	GGGTT	2	10	61495	61504	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017455	AGAGC	2	10	62353	62362	40 %	0 %	40 %	20 %	385798966
69	NC_017455	ATAAA	2	10	62626	62635	80 %	20 %	0 %	0 %	385798967
70	NC_017455	ATTAG	2	10	64956	64965	40 %	40 %	20 %	0 %	385798969
71	NC_017455	ATATT	2	10	65059	65068	40 %	60 %	0 %	0 %	385798969
72	NC_017455	TAATT	2	10	65277	65286	40 %	60 %	0 %	0 %	385798969
73	NC_017455	AAAAG	2	10	66062	66071	80 %	0 %	20 %	0 %	385798970
74	NC_017455	AAATA	2	10	66467	66476	80 %	20 %	0 %	0 %	385798970
75	NC_017455	TACTT	2	10	66581	66590	20 %	60 %	0 %	20 %	385798970
76	NC_017455	TTCAA	2	10	67589	67598	40 %	40 %	0 %	20 %	385798970
77	NC_017455	ATAGA	2	10	67849	67858	60 %	20 %	20 %	0 %	385798971
78	NC_017455	ATTAA	2	10	68187	68196	60 %	40 %	0 %	0 %	385798971
79	NC_017455	TAAGT	2	10	68681	68690	40 %	40 %	20 %	0 %	385798971
80	NC_017455	GATGG	2	10	69034	69043	20 %	20 %	60 %	0 %	385798971
81	NC_017455	GTTAA	2	10	69298	69307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017455	TTAAG	2	10	69834	69843	40 %	40 %	20 %	0 %	385798972
83	NC_017455	AGAAA	2	10	70016	70025	80 %	0 %	20 %	0 %	385798972
84	NC_017455	TAAGT	2	10	71119	71128	40 %	40 %	20 %	0 %	385798974
85	NC_017455	TGAGT	2	10	72112	72121	20 %	40 %	40 %	0 %	385798974
86	NC_017455	ATTTA	2	10	72244	72253	40 %	60 %	0 %	0 %	385798974
87	NC_017455	CAAAA	2	10	72531	72540	80 %	0 %	0 %	20 %	385798974
88	NC_017455	TTTTA	2	10	75331	75340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017455	TTTAA	2	10	75520	75529	40 %	60 %	0 %	0 %	385798975
90	NC_017455	GAAAA	2	10	75883	75892	80 %	0 %	20 %	0 %	385798975
91	NC_017455	TAATT	2	10	75978	75987	40 %	60 %	0 %	0 %	385798975
92	NC_017455	TTTAA	2	10	77127	77136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017455	TAAAA	2	10	77254	77263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017455	TAAAT	2	10	77367	77376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017455	TAAAT	2	10	77383	77392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017455	ATTAT	2	10	78634	78643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017455	ACTTT	2	10	80282	80291	20 %	60 %	0 %	20 %	385798978
98	NC_017455	TAAAA	2	10	80430	80439	80 %	20 %	0 %	0 %	385798978
99	NC_017455	AAAAT	2	10	81464	81473	80 %	20 %	0 %	0 %	385798979
100	NC_017455	ATTTT	2	10	81495	81504	20 %	80 %	0 %	0 %	385798979
101	NC_017455	AAAAG	2	10	82312	82321	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017455	GATAT	2	10	82372	82381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017455	ATTAA	2	10	82769	82778	60 %	40 %	0 %	0 %	385798980
104	NC_017455	ATGCA	2	10	83619	83628	40 %	20 %	20 %	20 %	385798981
105	NC_017455	GCTTG	2	10	83936	83945	0 %	40 %	40 %	20 %	385798981
106	NC_017455	AGATA	2	10	84836	84845	60 %	20 %	20 %	0 %	385798982
107	NC_017455	TTTTA	2	10	85509	85518	20 %	80 %	0 %	0 %	385798982
108	NC_017455	TTTAA	2	10	85648	85657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017455	TTTTA	2	10	87163	87172	20 %	80 %	0 %	0 %	385798984
110	NC_017455	AGCTT	2	10	87572	87581	20 %	40 %	20 %	20 %	385798984
111	NC_017455	AAATT	2	10	88740	88749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017455	CTTCA	2	10	89870	89879	20 %	40 %	0 %	40 %	385798986
113	NC_017455	TAAAT	2	10	90751	90760	60 %	40 %	0 %	0 %	385798987
114	NC_017455	TTTAA	2	10	90816	90825	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017455	AGAAA	2	10	91078	91087	80 %	0 %	20 %	0 %	385798988
116	NC_017455	ATTAA	2	10	92088	92097	60 %	40 %	0 %	0 %	385798988
117	NC_017455	TAATT	2	10	92814	92823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017455	CAGAT	2	10	92942	92951	40 %	20 %	20 %	20 %	385798990
119	NC_017455	TAATT	2	10	94244	94253	40 %	60 %	0 %	0 %	385798992
120	NC_017455	ATCAA	2	10	96306	96315	60 %	20 %	0 %	20 %	385798994
121	NC_017455	TATTT	2	10	97534	97543	20 %	80 %	0 %	0 %	385798995
122	NC_017455	TTATT	2	10	100366	100375	20 %	80 %	0 %	0 %	385798997
123	NC_017455	ATTAG	2	10	101803	101812	40 %	40 %	20 %	0 %	385798998
124	NC_017455	ACTAG	2	10	103360	103369	40 %	20 %	20 %	20 %	385799000
125	NC_017455	AGTTT	2	10	104191	104200	20 %	60 %	20 %	0 %	385799000
126	NC_017455	AATTG	2	10	105121	105130	40 %	40 %	20 %	0 %	385799001
127	NC_017455	TAATT	2	10	105339	105348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017455	ACTTA	2	10	105503	105512	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017455	AAATT	2	10	105578	105587	60 %	40 %	0 %	0 %	385799002
130	NC_017455	ACAGG	2	10	105934	105943	40 %	0 %	40 %	20 %	385799002
131	NC_017455	CAGAC	2	10	106393	106402	40 %	0 %	20 %	40 %	385799002
132	NC_017455	AAAAT	2	10	106541	106550	80 %	20 %	0 %	0 %	385799002
133	NC_017455	TCATG	2	10	106579	106588	20 %	40 %	20 %	20 %	385799002
134	NC_017455	GTAAT	2	10	107222	107231	40 %	40 %	20 %	0 %	385799002
135	NC_017455	CAGGT	2	10	107495	107504	20 %	20 %	40 %	20 %	385799002
136	NC_017455	AATGA	2	10	108174	108183	60 %	20 %	20 %	0 %	385799003
137	NC_017455	TAAAA	2	10	108230	108239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017455	TAAAA	2	10	109240	109249	80 %	20 %	0 %	0 %	385799005
139	NC_017455	TTATC	2	10	110357	110366	20 %	60 %	0 %	20 %	385799005
140	NC_017455	TAAAA	2	10	110475	110484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017455	TTTAT	2	10	110562	110571	20 %	80 %	0 %	0 %	385799006
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