MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halanaerobium praevalens DSM 2228 chromosome

Total Repeats: 6079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017455	ACTG	2	8	518	525	25 %	25 %	25 %	25 %	385798918
2	NC_017455	TTAT	2	8	799	806	25 %	75 %	0 %	0 %	385798918
3	NC_017455	AATT	3	12	919	930	50 %	50 %	0 %	0 %	385798918
4	NC_017455	AAAG	2	8	1020	1027	75 %	0 %	25 %	0 %	385798918
5	NC_017455	AACT	2	8	1549	1556	50 %	25 %	0 %	25 %	385798918
6	NC_017455	CTGC	2	8	2206	2213	0 %	25 %	25 %	50 %	385798919
7	NC_017455	TAAA	2	8	2270	2277	75 %	25 %	0 %	0 %	385798919
8	NC_017455	TTTA	2	8	2313	2320	25 %	75 %	0 %	0 %	385798919
9	NC_017455	ATTT	2	8	3075	3082	25 %	75 %	0 %	0 %	385798919
10	NC_017455	CAGG	2	8	3307	3314	25 %	0 %	50 %	25 %	385798920
11	NC_017455	AAGT	2	8	3410	3417	50 %	25 %	25 %	0 %	385798920
12	NC_017455	ATTT	2	8	3556	3563	25 %	75 %	0 %	0 %	385798921
13	NC_017455	AAAT	2	8	3624	3631	75 %	25 %	0 %	0 %	385798921
14	NC_017455	TAAA	2	8	4028	4035	75 %	25 %	0 %	0 %	385798921
15	NC_017455	ATTA	2	8	4419	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	385798921
16	NC_017455	TGGA	2	8	5212	5219	25 %	25 %	50 %	0 %	385798923
17	NC_017455	ACTT	2	8	5741	5748	25 %	50 %	0 %	25 %	385798923
18	NC_017455	TAAA	2	8	6212	6219	75 %	25 %	0 %	0 %	385798923
19	NC_017455	CTTT	2	8	6371	6378	0 %	75 %	0 %	25 %	385798923
20	NC_017455	ATTC	2	8	6696	6703	25 %	50 %	0 %	25 %	385798923
21	NC_017455	GTAG	2	8	6861	6868	25 %	25 %	50 %	0 %	385798924
22	NC_017455	AATT	2	8	7360	7367	50 %	50 %	0 %	0 %	385798924
23	NC_017455	TAAA	2	8	7573	7580	75 %	25 %	0 %	0 %	385798924
24	NC_017455	TAGA	2	8	7891	7898	50 %	25 %	25 %	0 %	385798924
25	NC_017455	AATT	2	8	7991	7998	50 %	50 %	0 %	0 %	385798924
26	NC_017455	TTAA	2	8	8628	8635	50 %	50 %	0 %	0 %	385798924
27	NC_017455	TAAT	2	8	9136	9143	50 %	50 %	0 %	0 %	385798924
28	NC_017455	TTAT	2	8	16304	16311	25 %	75 %	0 %	0 %	385798925
29	NC_017455	TTAT	2	8	17499	17506	25 %	75 %	0 %	0 %	385798927
30	NC_017455	AATG	2	8	18169	18176	50 %	25 %	25 %	0 %	385798927
31	NC_017455	TTTA	2	8	19259	19266	25 %	75 %	0 %	0 %	385798928
32	NC_017455	AAAC	2	8	21331	21338	75 %	0 %	0 %	25 %	385798930
33	NC_017455	ATTA	2	8	21879	21886	50 %	50 %	0 %	0 %	385798931
34	NC_017455	TTAA	2	8	22032	22039	50 %	50 %	0 %	0 %	385798931
35	NC_017455	AAAT	2	8	22378	22385	75 %	25 %	0 %	0 %	385798931
36	NC_017455	AATG	2	8	22631	22638	50 %	25 %	25 %	0 %	385798931
37	NC_017455	AACA	2	8	22711	22718	75 %	0 %	0 %	25 %	385798931
38	NC_017455	GGTT	2	8	23067	23074	0 %	50 %	50 %	0 %	385798931
39	NC_017455	TAAA	2	8	23572	23579	75 %	25 %	0 %	0 %	385798931
40	NC_017455	TTTA	2	8	23738	23745	25 %	75 %	0 %	0 %	385798932
41	NC_017455	TTAA	2	8	23757	23764	50 %	50 %	0 %	0 %	385798932
42	NC_017455	GATA	2	8	24287	24294	50 %	25 %	25 %	0 %	385798932
43	NC_017455	AGAA	2	8	24416	24423	75 %	0 %	25 %	0 %	385798932
44	NC_017455	TAAA	2	8	24782	24789	75 %	25 %	0 %	0 %	385798933
45	NC_017455	AATC	2	8	25748	25755	50 %	25 %	0 %	25 %	385798934
46	NC_017455	ACAA	2	8	26286	26293	75 %	0 %	0 %	25 %	385798935
47	NC_017455	TTAA	2	8	26953	26960	50 %	50 %	0 %	0 %	385798935
48	NC_017455	AGTT	2	8	27445	27452	25 %	50 %	25 %	0 %	385798936
49	NC_017455	TAAA	2	8	27628	27635	75 %	25 %	0 %	0 %	385798936
50	NC_017455	TAAA	2	8	27853	27860	75 %	25 %	0 %	0 %	385798936
51	NC_017455	GCTT	2	8	28340	28347	0 %	50 %	25 %	25 %	385798936
52	NC_017455	ATTT	2	8	28398	28405	25 %	75 %	0 %	0 %	385798936
53	NC_017455	TAGC	2	8	28584	28591	25 %	25 %	25 %	25 %	385798937
54	NC_017455	TAAT	2	8	30129	30136	50 %	50 %	0 %	0 %	385798938
55	NC_017455	TAAA	2	8	30869	30876	75 %	25 %	0 %	0 %	385798938
56	NC_017455	ATTT	2	8	31468	31475	25 %	75 %	0 %	0 %	385798939
57	NC_017455	TACT	2	8	31751	31758	25 %	50 %	0 %	25 %	385798939
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60	NC_017455	CAAG	2	8	33746	33753	50 %	0 %	25 %	25 %	385798940
61	NC_017455	ATAA	2	8	33865	33872	75 %	25 %	0 %	0 %	385798940
62	NC_017455	TAGT	2	8	34306	34313	25 %	50 %	25 %	0 %	385798941
63	NC_017455	AATT	2	8	34325	34332	50 %	50 %	0 %	0 %	385798941
64	NC_017455	CTAT	2	8	34407	34414	25 %	50 %	0 %	25 %	385798941
65	NC_017455	TCAG	2	8	34502	34509	25 %	25 %	25 %	25 %	385798941
66	NC_017455	ACTA	2	8	34649	34656	50 %	25 %	0 %	25 %	385798941
67	NC_017455	AGAA	2	8	34960	34967	75 %	0 %	25 %	0 %	385798942
68	NC_017455	CAAA	2	8	35179	35186	75 %	0 %	0 %	25 %	385798942
69	NC_017455	ACTA	2	8	35398	35405	50 %	25 %	0 %	25 %	385798942
70	NC_017455	TTAG	2	8	35408	35415	25 %	50 %	25 %	0 %	385798942
71	NC_017455	AATA	2	8	36031	36038	75 %	25 %	0 %	0 %	385798942
72	NC_017455	TAGG	2	8	36796	36803	25 %	25 %	50 %	0 %	385798943
73	NC_017455	GAAA	2	8	37190	37197	75 %	0 %	25 %	0 %	385798943
74	NC_017455	AATT	2	8	37402	37409	50 %	50 %	0 %	0 %	385798943
75	NC_017455	AATG	2	8	38371	38378	50 %	25 %	25 %	0 %	385798944
76	NC_017455	AATG	2	8	38677	38684	50 %	25 %	25 %	0 %	385798944
77	NC_017455	TTCT	2	8	38967	38974	0 %	75 %	0 %	25 %	385798945
78	NC_017455	TGTT	2	8	39195	39202	0 %	75 %	25 %	0 %	385798945
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80	NC_017455	AATT	2	8	40003	40010	50 %	50 %	0 %	0 %	385798946
81	NC_017455	TACT	2	8	40300	40307	25 %	50 %	0 %	25 %	385798946
82	NC_017455	TTAT	2	8	40431	40438	25 %	75 %	0 %	0 %	385798946
83	NC_017455	GTTA	2	8	40454	40461	25 %	50 %	25 %	0 %	385798946
84	NC_017455	TTTA	2	8	40619	40626	25 %	75 %	0 %	0 %	385798946
85	NC_017455	AGAA	2	8	40821	40828	75 %	0 %	25 %	0 %	385798946
86	NC_017455	TAGT	2	8	41074	41081	25 %	50 %	25 %	0 %	385798947
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90	NC_017455	ATTT	2	8	41878	41885	25 %	75 %	0 %	0 %	385798948
91	NC_017455	TAAG	2	8	42742	42749	50 %	25 %	25 %	0 %	385798949
92	NC_017455	TTAT	2	8	43842	43849	25 %	75 %	0 %	0 %	385798950
93	NC_017455	ATAA	2	8	44314	44321	75 %	25 %	0 %	0 %	385798950
94	NC_017455	TATT	2	8	44504	44511	25 %	75 %	0 %	0 %	385798951
95	NC_017455	TAAT	2	8	44691	44698	50 %	50 %	0 %	0 %	385798951
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99	NC_017455	AAAT	2	8	46699	46706	75 %	25 %	0 %	0 %	385798953
100	NC_017455	AAAC	2	8	46903	46910	75 %	0 %	0 %	25 %	385798953
101	NC_017455	AAAT	2	8	47462	47469	75 %	25 %	0 %	0 %	385798954
102	NC_017455	TCTT	2	8	48063	48070	0 %	75 %	0 %	25 %	385798954
103	NC_017455	AGTT	2	8	48299	48306	25 %	50 %	25 %	0 %	385798954
104	NC_017455	AGGC	2	8	48399	48406	25 %	0 %	50 %	25 %	385798954
105	NC_017455	AGAT	2	8	49240	49247	50 %	25 %	25 %	0 %	385798955
106	NC_017455	TAAT	2	8	49261	49268	50 %	50 %	0 %	0 %	385798955
107	NC_017455	TTAA	2	8	49284	49291	50 %	50 %	0 %	0 %	385798955
108	NC_017455	AACT	2	8	49820	49827	50 %	25 %	0 %	25 %	385798956
109	NC_017455	CTTT	2	8	49895	49902	0 %	75 %	0 %	25 %	385798956
110	NC_017455	TTTA	2	8	50115	50122	25 %	75 %	0 %	0 %	385798956
111	NC_017455	TTAT	2	8	50244	50251	25 %	75 %	0 %	0 %	385798956
112	NC_017455	ATGG	2	8	50349	50356	25 %	25 %	50 %	0 %	385798957
113	NC_017455	TAAT	2	8	51351	51358	50 %	50 %	0 %	0 %	385798958
114	NC_017455	TTTA	2	8	52252	52259	25 %	75 %	0 %	0 %	385798959
115	NC_017455	TCTG	2	8	52632	52639	0 %	50 %	25 %	25 %	385798959
116	NC_017455	CATA	2	8	52654	52661	50 %	25 %	0 %	25 %	385798959
117	NC_017455	TCTA	2	8	52814	52821	25 %	50 %	0 %	25 %	385798959
118	NC_017455	GTTT	2	8	53572	53579	0 %	75 %	25 %	0 %	385798960
119	NC_017455	ATTA	2	8	53853	53860	50 %	50 %	0 %	0 %	385798961
120	NC_017455	CTAT	2	8	54099	54106	25 %	50 %	0 %	25 %	385798961
121	NC_017455	TTTA	2	8	54242	54249	25 %	75 %	0 %	0 %	385798961
122	NC_017455	TTTC	2	8	54822	54829	0 %	75 %	0 %	25 %	385798962
123	NC_017455	AGTT	2	8	55495	55502	25 %	50 %	25 %	0 %	385798962
124	NC_017455	CCTG	2	8	58581	58588	0 %	25 %	25 %	50 %	385798963
125	NC_017455	ATAG	2	8	60352	60359	50 %	25 %	25 %	0 %	385798965
126	NC_017455	AAAG	2	8	60406	60413	75 %	0 %	25 %	0 %	385798965
127	NC_017455	AAGG	2	8	60433	60440	50 %	0 %	50 %	0 %	385798965
128	NC_017455	AGAC	2	8	60562	60569	50 %	0 %	25 %	25 %	385798965
129	NC_017455	CCAG	2	8	60764	60771	25 %	0 %	25 %	50 %	385798965
130	NC_017455	TTTA	2	8	61606	61613	25 %	75 %	0 %	0 %	385798966
131	NC_017455	AACC	2	8	61742	61749	50 %	0 %	0 %	50 %	385798966
132	NC_017455	GGTA	2	8	61792	61799	25 %	25 %	50 %	0 %	385798966
133	NC_017455	TTGG	2	8	61804	61811	0 %	50 %	50 %	0 %	385798966
134	NC_017455	AGAT	2	8	61867	61874	50 %	25 %	25 %	0 %	385798966
135	NC_017455	AATA	2	8	62476	62483	75 %	25 %	0 %	0 %	385798966
136	NC_017455	CAAG	2	8	62793	62800	50 %	0 %	25 %	25 %	385798967
137	NC_017455	GCAA	2	8	62906	62913	50 %	0 %	25 %	25 %	385798967
138	NC_017455	GGTT	2	8	62999	63006	0 %	50 %	50 %	0 %	385798967
139	NC_017455	ATTT	2	8	63294	63301	25 %	75 %	0 %	0 %	385798967
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