MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacter sulfurreducens KN400 chromosome

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017454	CATAAC	2	12	1554	1565	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017454	CCTTGT	2	12	38507	38518	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017454	TGAAAA	2	12	101192	101203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017454	CCGGTC	2	12	190024	190035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017454	GCTGAA	2	12	209218	209229	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017454	AAATAA	2	12	384833	384844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017454	GTTCAA	2	12	445026	445037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017454	TCAGGC	2	12	480422	480433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017454	CCGGCT	2	12	522278	522289	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017454	CCTGAA	2	12	562654	562665	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017454	TCAAAT	2	12	711335	711346	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017454	CGGTGC	2	12	716722	716733	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017454	GTACGG	2	12	729638	729649	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017454	CATCCG	2	12	743895	743906	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017454	TTCTTG	2	12	751664	751675	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017454	TTCCTC	2	12	794657	794668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017454	TTTTTC	2	12	795369	795380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017454	AACTCA	2	12	796627	796638	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017454	CCGGCC	2	12	805249	805260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017454	GCCCTG	2	12	858171	858182	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017454	CCGGAC	2	12	873066	873077	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017454	ATACCG	2	12	888225	888236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017454	CCCGGG	2	12	892823	892834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017454	AACGGG	2	12	925616	925627	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017454	CTTCGG	2	12	963020	963031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017454	TTTCTT	2	12	963060	963071	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017454	GTCTTG	2	12	964138	964149	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017454	GTAGCC	2	12	964173	964184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017454	TGACCG	2	12	1107089	1107100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017454	AAAATT	2	12	1118040	1118051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017454	TCGGTT	2	12	1129176	1129187	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017454	TACTCA	2	12	1172292	1172303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017454	CTTTGC	2	12	1184630	1184641	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017454	GTCACG	2	12	1190525	1190536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017454	GATGCA	2	12	1200566	1200577	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017454	GAAGGG	2	12	1232489	1232500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017454	GCCACC	2	12	1252409	1252420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017454	GGCGAA	2	12	1263292	1263303	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017454	CGGTGC	2	12	1431106	1431117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017454	GGGAAG	2	12	1467782	1467793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017454	TTAATA	2	12	1483073	1483084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017454	CGGTGG	2	12	1486351	1486362	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017454	GACAGT	2	12	1488679	1488690	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017454	ACCCTG	3	18	1489402	1489419	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017454	AACCGA	2	12	1498294	1498305	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017454	CATTCC	2	12	1498550	1498561	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017454	GGGAAA	2	12	1622898	1622909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017454	GTTGTG	2	12	1644273	1644284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017454	AAGGGA	2	12	1696491	1696502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017454	GCGCAG	2	12	1704525	1704536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017454	CCGCGT	2	12	1725652	1725663	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017454	TAAAAA	2	12	1916082	1916093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017454	ATTTTA	2	12	1944629	1944640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017454	ATCGGG	2	12	2073943	2073954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017454	TTTCAG	2	12	2214875	2214886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017454	GTCCCG	2	12	2227225	2227236	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017454	GGCTCC	2	12	2278945	2278956	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017454	CTTCGG	2	12	2279118	2279129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017454	CTGACC	2	12	2280431	2280442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017454	TATCAA	2	12	2291924	2291935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017454	CCCCGG	2	12	2300808	2300819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017454	AAGCTC	2	12	2312419	2312430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017454	CCGGAA	2	12	2379242	2379253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017454	CACGGC	2	12	2431892	2431903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017454	TAACAG	2	12	2457946	2457957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017454	TTTCCC	2	12	2464304	2464315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017454	CCCGCA	2	12	2515588	2515599	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017454	AGCCTC	2	12	2531688	2531699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017454	TGCCCT	2	12	2535713	2535724	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017454	ATCTAT	2	12	2608521	2608532	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017454	TAGATG	2	12	2608549	2608560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017454	CGCCGG	2	12	2614839	2614850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017454	GAAGCG	2	12	2667245	2667256	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017454	GGAGGG	2	12	2749009	2749020	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017454	ATTTAC	2	12	2749043	2749054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017454	CGGCAA	2	12	2793679	2793690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017454	GGCGGG	2	12	2816433	2816444	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017454	GTTCCT	2	12	2846647	2846658	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017454	TTGCAG	2	12	2940219	2940230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017454	GTCCGC	2	12	2949012	2949023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017454	AACAGA	2	12	2970449	2970460	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017454	CATGTT	2	12	2981709	2981720	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017454	CTTTCC	2	12	3054443	3054454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017454	AATACA	2	12	3067543	3067554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017454	GCCGCA	2	12	3076856	3076867	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017454	TGCCGG	2	12	3101058	3101069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017454	GCCGAA	2	12	3111311	3111322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017454	TCGGCC	2	12	3221290	3221301	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017454	ACGGAC	2	12	3253594	3253605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017454	AAAAGA	2	12	3284986	3284997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017454	AACTTT	2	12	3285183	3285194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017454	GTAGAA	2	12	3344856	3344867	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017454	CCGGCC	2	12	3354762	3354773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017454	TGCGGC	2	12	3398058	3398069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017454	CAATAT	2	12	3440494	3440505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017454	CCGGCT	2	12	3475878	3475889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017454	TGCGCC	2	12	3536121	3536132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017454	CCCGTT	2	12	3544188	3544199	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017454	GCACAT	2	12	3657213	3657224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.