MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis NE061598 chromosome

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017453	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793752
2	NC_017453	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385793754
3	NC_017453	GTTTTA	2	12	8759	8770	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793761
4	NC_017453	TATATC	2	12	12139	12150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385793766
5	NC_017453	CTGCTT	2	12	14995	15006	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385793769
6	NC_017453	TACTGA	2	12	15161	15172	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793769
7	NC_017453	AGATGG	2	12	17260	17271	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385793771
8	NC_017453	TTATAT	2	12	17605	17616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385793771
9	NC_017453	TCAAGA	2	12	18174	18185	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793772
10	NC_017453	GAAGCA	2	12	18399	18410	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385793773
11	NC_017453	GAGTAT	2	12	20396	20407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385793774
12	NC_017453	CCAGAT	2	12	20534	20545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385793774
13	NC_017453	GTAAAG	2	12	21078	21089	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793774
14	NC_017453	ATGATA	2	12	24697	24708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017453	CAAATC	2	12	26693	26704	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385793780
16	NC_017453	AGCTAA	2	12	28183	28194	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793781
17	NC_017453	ATGATA	2	12	30387	30398	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017453	TACTCG	2	12	31972	31983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793785
19	NC_017453	TGGTGC	2	12	35042	35053	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385793789
20	NC_017453	TGCAAA	2	12	36102	36113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793790
21	NC_017453	ATATTG	2	12	37563	37574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793790
22	NC_017453	TAACAT	2	12	40197	40208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385793793
23	NC_017453	TCAGTC	2	12	40335	40346	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793794
24	NC_017453	TGCAAA	2	12	42368	42379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793795
25	NC_017453	TTGGTA	2	12	43151	43162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385793796
26	NC_017453	TATTGG	2	12	43839	43850	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385793796
27	NC_017453	TCCATG	2	12	47034	47045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017453	TTTTGA	2	12	49219	49230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793800
29	NC_017453	TGAAGA	2	12	49485	49496	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793801
30	NC_017453	GGCAAA	2	12	59218	59229	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385793808
31	NC_017453	ATTATG	2	12	59877	59888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793809
32	NC_017453	ATAAAT	2	12	61351	61362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385793812
33	NC_017453	AGGCTA	2	12	61599	61610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385793813
34	NC_017453	AGCAAG	2	12	66574	66585	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385793818
35	NC_017453	GTTAGA	2	12	76306	76317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385793827
36	NC_017453	AAAGCT	2	12	77556	77567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793829
37	NC_017453	TAAAGC	2	12	77756	77767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793829
38	NC_017453	ATTATA	2	12	78925	78936	50 %	50 %	0 %	0 %	385793829
39	NC_017453	AAATGC	2	12	79003	79014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793829
40	NC_017453	AGATAC	2	12	81228	81239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793830
41	NC_017453	GGAGCA	2	12	84354	84365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385793834
42	NC_017453	TTTATA	2	12	85342	85353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385793835
43	NC_017453	TGGTGT	2	12	89522	89533	0 %	50 %	50 %	0 %	385793841
44	NC_017453	ATCCGT	2	12	91047	91058	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793841
45	NC_017453	TGATGT	2	12	91487	91498	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385793841
46	NC_017453	AGCTTG	2	12	94444	94455	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385793844
47	NC_017453	GTTGAG	2	12	100031	100042	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385793849
48	NC_017453	AAAAAC	2	12	100248	100259	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385793849
49	NC_017453	GCAAAT	2	12	109838	109849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793862
50	NC_017453	CAAATA	2	12	110349	110360	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385793862
51	NC_017453	CAACAT	2	12	111462	111473	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385793862
52	NC_017453	CAATAG	2	12	113573	113584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793863
53	NC_017453	TAAATA	2	12	114260	114271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385793865
54	NC_017453	TGCAGC	2	12	116473	116484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385793867
55	NC_017453	TTATAG	2	12	117938	117949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793868
56	NC_017453	AGATAA	2	12	117960	117971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385793868
57	NC_017453	GAAAGT	2	12	119567	119578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793869
58	NC_017453	CTGGTA	2	12	119755	119766	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385793869
59	NC_017453	GCAAAT	2	12	127996	128007	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793876
60	NC_017453	TAGGTG	2	12	130909	130920	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385793878
61	NC_017453	TAGTGC	2	12	135596	135607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385793882
62	NC_017453	ATTTTT	2	12	136254	136265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017453	TTAATA	2	12	142639	142650	50 %	50 %	0 %	0 %	385793889
64	NC_017453	ACTTTG	2	12	144938	144949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385793892
65	NC_017453	ATTGTT	2	12	147519	147530	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793894
66	NC_017453	AGCAAC	2	12	148512	148523	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385793896
67	NC_017453	TAGATC	2	12	149475	149486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793896
68	NC_017453	GCTGTT	2	12	154599	154610	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385793903
69	NC_017453	AGAAAA	2	12	155616	155627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385793905
70	NC_017453	TTGATT	2	12	155884	155895	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793905
71	NC_017453	GGTAAA	2	12	156339	156350	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793905
72	NC_017453	TATATG	2	12	158739	158750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793905
73	NC_017453	GTTGAG	2	12	159418	159429	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385793906
74	NC_017453	TCCACA	2	12	164822	164833	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017453	TGCCTA	2	12	169586	169597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793913
76	NC_017453	TGATTT	2	12	172620	172631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793918
77	NC_017453	ATAAAC	2	12	174049	174060	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017453	ATTAAA	2	12	175595	175606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385793920
79	NC_017453	TTTCAT	2	12	177309	177320	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385793923
80	NC_017453	TGTTTT	2	12	182365	182376	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017453	GTTTTA	2	12	186400	186411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793931
82	NC_017453	TCCTTG	2	12	192030	192041	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385793938
83	NC_017453	AGCTAT	2	12	192957	192968	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793939
84	NC_017453	TAAAAG	2	12	196739	196750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385793942
85	NC_017453	AAATAA	2	12	197326	197337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385793943
86	NC_017453	ATTTCC	2	12	200260	200271	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017453	TTATGA	2	12	201465	201476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793947
88	NC_017453	ATCAAA	2	12	203990	204001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385793950
89	NC_017453	GTACAG	2	12	204163	204174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385793950
90	NC_017453	TATTGA	2	12	208365	208376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793953
91	NC_017453	CAAAGT	2	12	208495	208506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793953
92	NC_017453	TAAAGA	2	12	210975	210986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017453	AAATGC	2	12	211848	211859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793956
94	NC_017453	ATAGCT	2	12	212994	213005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793957
95	NC_017453	TTTCAT	2	12	220473	220484	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017453	CAGATA	2	12	222548	222559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793964
97	NC_017453	ATCGTA	2	12	222770	222781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793965
98	NC_017453	AAGGTA	2	12	222801	222812	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793965
99	NC_017453	ATCGCT	2	12	225166	225177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017453	TATAAA	2	12	225366	225377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017453	TTGTGT	2	12	226515	226526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385793968
102	NC_017453	GTTGCT	2	12	230180	230191	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385793971
103	NC_017453	TAGTAT	2	12	230260	230271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017453	TCATTA	2	12	231007	231018	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385793972
105	NC_017453	GACAAG	2	12	233970	233981	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385793974
106	NC_017453	GTTTTA	2	12	234666	234677	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793975
107	NC_017453	ACCTTA	2	12	235492	235503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385793978
108	NC_017453	GCCATT	2	12	236158	236169	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793979
109	NC_017453	ACTGTT	2	12	237561	237572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385793980
110	NC_017453	AATTAT	2	12	239184	239195	50 %	50 %	0 %	0 %	385793981
111	NC_017453	ATCAAT	2	12	240822	240833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385793983
112	NC_017453	TTTGTC	2	12	246963	246974	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385793993
113	NC_017453	AGCTGG	2	12	247494	247505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385793994
114	NC_017453	AGCCAA	2	12	250838	250849	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385793999
115	NC_017453	TTTAAA	2	12	254869	254880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017453	ATAATT	2	12	255081	255092	50 %	50 %	0 %	0 %	385794005
117	NC_017453	ATTGAT	2	12	255344	255355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385794005
118	NC_017453	GTTTTA	2	12	259977	259988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385794009
119	NC_017453	TATCAG	2	12	261268	261279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385794012
120	NC_017453	GGTATT	2	12	261534	261545	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385794012
121	NC_017453	TTATAA	2	12	271875	271886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017453	TTGAGA	2	12	273357	273368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385794021
123	NC_017453	TTAGGC	2	12	274214	274225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385794021
124	NC_017453	TATTTT	2	12	277453	277464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385794025
125	NC_017453	TAAGTA	2	12	278377	278388	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385794026
126	NC_017453	ATAAAT	2	12	278791	278802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017453	AAATAT	2	12	284839	284850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385794031
128	NC_017453	ACAGGT	2	12	287007	287018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385794034
129	NC_017453	ACTTTT	2	12	287350	287361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017453	GTTTTA	2	12	287975	287986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385794036
131	NC_017453	CAAATT	2	12	293355	293366	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385794040
132	NC_017453	TTTTAT	2	12	294040	294051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385794041
133	NC_017453	TTAAGT	2	12	294781	294792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385794041
134	NC_017453	ATTATA	2	12	300053	300064	50 %	50 %	0 %	0 %	385794046
135	NC_017453	GCTTTA	2	12	300200	300211	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385794046
136	NC_017453	CACCAA	2	12	301820	301831	50 %	0 %	0 %	50 %	385794048
137	NC_017453	ACTAGT	2	12	309262	309273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385794057
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139	NC_017453	TACTGC	2	12	314415	314426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385794061
140	NC_017453	TTTAGC	2	12	314613	314624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385794061
141	NC_017453	ATTAGT	2	12	315216	315227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385794061
142	NC_017453	ATAAGT	2	12	316302	316313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385794063
143	NC_017453	TAGCTT	2	12	319220	319231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385794066
144	NC_017453	ATTTTT	2	12	319473	319484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017453	TTTTGT	2	12	319990	320001	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017453	AATTTC	2	12	322078	322089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385794069
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149	NC_017453	TTATGG	2	12	325548	325559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385794072
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151	NC_017453	TGAAGC	2	12	328798	328809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385794075
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173	NC_017453	AAGCCC	2	12	374622	374633	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
174	NC_017453	GTTTTA	2	12	376132	376143	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385794140
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180	NC_017453	ATTTTT	2	12	385585	385596	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017453	TTTGGC	2	12	387835	387846	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385794153
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231	NC_017453	TTTGGG	2	12	489933	489944	0 %	50 %	50 %	0 %	385794235
232	NC_017453	GGTGGC	2	12	491033	491044	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385794237
233	NC_017453	TGGTGA	2	12	491194	491205	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385794237
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235	NC_017453	TTTATC	2	12	496436	496447	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385794242
236	NC_017453	AAAATC	2	12	501194	501205	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
237	NC_017453	ATTTTT	2	12	503098	503109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385794247
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271	NC_017453	GTTCTT	2	12	560687	560698	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385794300
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