MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis NE061598 chromosome

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017453	ATGATA	2	12	24697	24708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017453	ATGATA	2	12	30387	30398	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017453	TCCATG	2	12	47034	47045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017453	ATTTTT	2	12	136254	136265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017453	TCCACA	2	12	164822	164833	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017453	ATAAAC	2	12	174049	174060	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017453	TGTTTT	2	12	182365	182376	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017453	ATTTCC	2	12	200260	200271	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017453	TAAAGA	2	12	210975	210986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017453	TTTCAT	2	12	220473	220484	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017453	ATCGCT	2	12	225166	225177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017453	TATAAA	2	12	225366	225377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017453	TAGTAT	2	12	230260	230271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017453	TTTAAA	2	12	254869	254880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017453	TTATAA	2	12	271875	271886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017453	ATAAAT	2	12	278791	278802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017453	ACTTTT	2	12	287350	287361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017453	ATTTTT	2	12	319473	319484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017453	TTTTGT	2	12	319990	320001	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017453	AAACTT	2	12	368953	368964	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017453	AAGCCC	2	12	374622	374633	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017453	ATGTAT	2	12	376707	376718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017453	TAAAAT	2	12	385006	385017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017453	ATTTTT	2	12	385585	385596	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017453	AAGTTA	2	12	404537	404548	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017453	AAATAT	2	12	441107	441118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017453	AAAAGT	2	12	447751	447762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017453	TAGAAT	2	12	460750	460761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017453	AAAATC	2	12	501194	501205	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017453	AAAAAT	2	12	518996	519007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017453	ATTAGA	2	12	536849	536860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017453	TAGCTA	2	12	540953	540964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017453	ACAGCC	2	12	549255	549266	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017453	ATTTAG	2	12	551928	551939	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017453	GATATT	2	12	552476	552487	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017453	TATAAT	2	12	557829	557840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017453	AGTTAT	2	12	579487	579498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017453	TATTTT	2	12	592333	592344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017453	GATTTA	2	12	593060	593071	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017453	TTTGAT	2	12	601063	601074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017453	TAAATA	2	12	611212	611223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017453	CTTATA	2	12	611232	611243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017453	GATGTT	2	12	662345	662356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017453	ATATTT	2	12	662996	663007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017453	TTATAT	2	12	679717	679728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017453	CATTAG	2	12	680758	680769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017453	TTTACT	2	12	687342	687353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017453	TTAGTT	2	12	702416	702427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017453	TTTAAA	2	12	710474	710485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017453	AAATAA	2	12	724683	724694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017453	GCTTTA	2	12	734023	734034	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017453	CATAAA	2	12	738163	738174	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017453	TTTGAT	2	12	799215	799226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017453	TGTATA	2	12	822924	822935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017453	TAGTTT	2	12	865998	866009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017453	TTAGAT	2	12	873913	873924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017453	ATTGAT	2	12	891724	891735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017453	TTATAG	2	12	896463	896474	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017453	GTCTTG	2	12	896762	896773	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017453	AGTAAC	2	12	930912	930923	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017453	AGTAAT	2	12	942781	942792	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017453	TTAAAT	2	12	951962	951973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017453	TAATTA	2	12	978228	978239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017453	TATTAA	2	12	979030	979041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017453	AGATTT	2	12	996620	996631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017453	TAATCT	2	12	998966	998977	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017453	ATTTTT	2	12	1006746	1006757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017453	TATTTA	3	18	1010474	1010491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017453	AAATGG	2	12	1010727	1010738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017453	ATTTGG	2	12	1041679	1041690	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017453	TAATAC	2	12	1042821	1042832	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017453	AATTTT	2	12	1057886	1057897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017453	AATCAA	2	12	1062386	1062397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017453	TTTAAC	2	12	1073078	1073089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017453	CTCTCA	2	12	1074873	1074884	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017453	CAAAGT	2	12	1076032	1076043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017453	AAATTA	2	12	1084744	1084755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017453	TCCATC	2	12	1089618	1089629	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017453	TGATAT	2	12	1099045	1099056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017453	AATTTG	2	12	1109072	1109083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017453	TCTAAA	2	12	1109256	1109267	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017453	ACAAGT	2	12	1114261	1114272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017453	TAATGT	2	12	1114529	1114540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017453	ATTAAT	2	12	1114707	1114718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017453	TATCAA	2	12	1115495	1115506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017453	ATTATA	2	12	1123786	1123797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017453	AACTAA	2	12	1131810	1131821	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017453	AAATTA	2	12	1150275	1150286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017453	AAATAT	2	12	1166194	1166205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017453	TTTTTG	2	12	1175743	1175754	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017453	CTGCAA	2	12	1189959	1189970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017453	TACCTG	2	12	1191746	1191757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017453	ATTTTA	2	12	1204280	1204291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017453	CAAAAT	2	12	1205656	1205667	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017453	ATTTCA	2	12	1308498	1308509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017453	CTTATT	2	12	1310802	1310813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017453	TTTATT	2	12	1338181	1338192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017453	TTTATC	2	12	1338580	1338591	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017453	TGGATA	2	12	1338949	1338960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017453	AAAGCT	2	12	1339232	1339243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017453	TTTGCT	2	12	1339244	1339255	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017453	TAACTA	2	12	1341040	1341051	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017453	TCTTAG	2	12	1357998	1358009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017453	AAGTTT	2	12	1358068	1358079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017453	GCTATG	2	12	1359634	1359645	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017453	TAACAT	2	12	1387064	1387075	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017453	AATCAA	2	12	1394018	1394029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017453	ATAAAA	2	12	1395348	1395359	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017453	ATTTTT	2	12	1395854	1395865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017453	CATTAA	4	24	1415909	1415932	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017453	AATCCA	2	12	1420040	1420051	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017453	ATACAA	2	12	1422608	1422619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017453	TGTTAT	2	12	1503470	1503481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017453	CTTAAT	2	12	1539497	1539508	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017453	TTCCCA	2	12	1590873	1590884	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017453	GTTTTA	2	12	1611315	1611326	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017453	TTATAA	2	12	1612235	1612246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017453	GTTTTT	2	12	1615340	1615351	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017453	ACTTAT	2	12	1655858	1655869	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017453	ATCACC	2	12	1661076	1661087	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017453	AACCTT	2	12	1669080	1669091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017453	ATTTCA	2	12	1701845	1701856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017453	CTTATT	2	12	1704149	1704160	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017453	TTTAAA	2	12	1717200	1717211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017453	ATACAA	2	12	1725235	1725246	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017453	ATCAAA	2	12	1728341	1728352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017453	TTTTGT	2	12	1747174	1747185	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017453	TATAAA	2	12	1750479	1750490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017453	TTATTT	2	12	1753402	1753413	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.