MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis NE061598 chromosome

Total Repeats: 1486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017453	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	385793752
2	NC_017453	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	385793755
3	NC_017453	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	385793756
4	NC_017453	AATCA	2	10	4523	4532	60 %	20 %	0 %	20 %	385793757
5	NC_017453	ATGGT	2	10	4557	4566	20 %	40 %	40 %	0 %	385793757
6	NC_017453	ATTAA	2	10	4709	4718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017453	TTTGC	2	10	4816	4825	0 %	60 %	20 %	20 %	385793758
8	NC_017453	CGTAC	2	10	4960	4969	20 %	20 %	20 %	40 %	385793758
9	NC_017453	TTCAA	2	10	5331	5340	40 %	40 %	0 %	20 %	385793758
10	NC_017453	TTGCG	2	10	5419	5428	0 %	40 %	40 %	20 %	385793758
11	NC_017453	TAGCT	2	10	5984	5993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017453	ATGCA	2	10	7466	7475	40 %	20 %	20 %	20 %	385793759
13	NC_017453	AAAGA	2	10	8794	8803	80 %	0 %	20 %	0 %	385793761
14	NC_017453	TTTCT	2	10	11745	11754	0 %	80 %	0 %	20 %	385793766
15	NC_017453	AAATA	2	10	11833	11842	80 %	20 %	0 %	0 %	385793766
16	NC_017453	ACAGT	2	10	13806	13815	40 %	20 %	20 %	20 %	385793768
17	NC_017453	CTTTT	2	10	14595	14604	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017453	TAATG	2	10	14711	14720	40 %	40 %	20 %	0 %	385793769
19	NC_017453	TAGGT	2	10	17024	17033	20 %	40 %	40 %	0 %	385793771
20	NC_017453	TTTGA	2	10	18022	18031	20 %	60 %	20 %	0 %	385793772
21	NC_017453	TAGAT	2	10	18296	18305	40 %	40 %	20 %	0 %	385793773
22	NC_017453	GATTA	2	10	20136	20145	40 %	40 %	20 %	0 %	385793774
23	NC_017453	GATGT	2	10	20292	20301	20 %	40 %	40 %	0 %	385793774
24	NC_017453	GATTT	2	10	21967	21976	20 %	60 %	20 %	0 %	385793776
25	NC_017453	ATTTT	2	10	22400	22409	20 %	80 %	0 %	0 %	385793776
26	NC_017453	ATTAA	2	10	24687	24696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017453	GTATG	2	10	26216	26225	20 %	40 %	40 %	0 %	385793780
28	NC_017453	GCTAA	2	10	27425	27434	40 %	20 %	20 %	20 %	385793781
29	NC_017453	ATTCT	2	10	30096	30105	20 %	60 %	0 %	20 %	385793782
30	NC_017453	GTTTT	2	10	30341	30350	0 %	80 %	20 %	0 %	385793782
31	NC_017453	CAAGG	2	10	33349	33358	40 %	0 %	40 %	20 %	385793787
32	NC_017453	ACCAA	2	10	35905	35914	60 %	0 %	0 %	40 %	385793790
33	NC_017453	TACAG	2	10	39327	39336	40 %	20 %	20 %	20 %	385793792
34	NC_017453	ATTTT	2	10	39740	39749	20 %	80 %	0 %	0 %	385793793
35	NC_017453	ATTTT	2	10	40164	40173	20 %	80 %	0 %	0 %	385793793
36	NC_017453	TATTC	2	10	43309	43318	20 %	60 %	0 %	20 %	385793796
37	NC_017453	TAGTT	2	10	44664	44673	20 %	60 %	20 %	0 %	385793797
38	NC_017453	AAGCT	2	10	45974	45983	40 %	20 %	20 %	20 %	385793798
39	NC_017453	GATTT	2	10	46235	46244	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017453	TTGGT	2	10	46436	46445	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017453	GATAG	2	10	47134	47143	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017453	TTAAT	2	10	47537	47546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017453	AAAAT	2	10	49688	49697	80 %	20 %	0 %	0 %	385793801
44	NC_017453	TAATT	2	10	50718	50727	40 %	60 %	0 %	0 %	385793801
45	NC_017453	TGAAA	2	10	53030	53039	60 %	20 %	20 %	0 %	385793802
46	NC_017453	TAAAT	2	10	54530	54539	60 %	40 %	0 %	0 %	385793804
47	NC_017453	CAAAC	2	10	55654	55663	60 %	0 %	0 %	40 %	385793805
48	NC_017453	GCAAA	2	10	56702	56711	60 %	0 %	20 %	20 %	385793806
49	NC_017453	TTTAG	2	10	57609	57618	20 %	60 %	20 %	0 %	385793807
50	NC_017453	AAACA	2	10	58272	58281	80 %	0 %	0 %	20 %	385793807
51	NC_017453	TAAGA	2	10	59262	59271	60 %	20 %	20 %	0 %	385793808
52	NC_017453	AATTT	2	10	59671	59680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017453	AATAA	2	10	60198	60207	80 %	20 %	0 %	0 %	385793810
54	NC_017453	TACTG	2	10	62697	62706	20 %	40 %	20 %	20 %	385793815
55	NC_017453	GTGAA	2	10	63376	63385	40 %	20 %	40 %	0 %	385793815
56	NC_017453	GTGCA	2	10	65964	65973	20 %	20 %	40 %	20 %	385793817
57	NC_017453	GCATA	2	10	66387	66396	40 %	20 %	20 %	20 %	385793818
58	NC_017453	ATAAA	2	10	68451	68460	80 %	20 %	0 %	0 %	385793819
59	NC_017453	TATCT	2	10	72072	72081	20 %	60 %	0 %	20 %	385793823
60	NC_017453	AAAAT	2	10	72385	72394	80 %	20 %	0 %	0 %	385793824
61	NC_017453	TCACT	2	10	74314	74323	20 %	40 %	0 %	40 %	385793825
62	NC_017453	TTATC	2	10	74461	74470	20 %	60 %	0 %	20 %	385793826
63	NC_017453	AAGAA	2	10	76144	76153	80 %	0 %	20 %	0 %	385793827
64	NC_017453	ATAGA	2	10	77839	77848	60 %	20 %	20 %	0 %	385793829
65	NC_017453	TAATG	2	10	78086	78095	40 %	40 %	20 %	0 %	385793829
66	NC_017453	ACTCT	2	10	79270	79279	20 %	40 %	0 %	40 %	385793829
67	NC_017453	TAAAT	2	10	80094	80103	60 %	40 %	0 %	0 %	385793829
68	NC_017453	GAACC	2	10	83397	83406	40 %	0 %	20 %	40 %	385793832
69	NC_017453	GTCTT	2	10	84446	84455	0 %	60 %	20 %	20 %	385793834
70	NC_017453	AAACT	2	10	85667	85676	60 %	20 %	0 %	20 %	385793836
71	NC_017453	TTTGA	2	10	86343	86352	20 %	60 %	20 %	0 %	385793838
72	NC_017453	GTATT	2	10	87517	87526	20 %	60 %	20 %	0 %	385793839
73	NC_017453	TTTAT	2	10	88781	88790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017453	TAGTA	2	10	89945	89954	40 %	40 %	20 %	0 %	385793841
75	NC_017453	TGATA	2	10	91770	91779	40 %	40 %	20 %	0 %	385793842
76	NC_017453	ATAGA	2	10	91853	91862	60 %	20 %	20 %	0 %	385793842
77	NC_017453	ATTAG	2	10	92407	92416	40 %	40 %	20 %	0 %	385793842
78	NC_017453	GTTTT	2	10	93013	93022	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017453	TATCA	2	10	93862	93871	40 %	40 %	0 %	20 %	385793843
80	NC_017453	AATGT	2	10	96820	96829	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017453	AATAT	2	10	96849	96858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017453	TTAAC	2	10	97545	97554	40 %	40 %	0 %	20 %	385793847
83	NC_017453	GTCAA	2	10	97687	97696	40 %	20 %	20 %	20 %	385793847
84	NC_017453	CAGAT	2	10	100588	100597	40 %	20 %	20 %	20 %	385793850
85	NC_017453	CATCT	2	10	102665	102674	20 %	40 %	0 %	40 %	385793852
86	NC_017453	TTCTT	2	10	102737	102746	0 %	80 %	0 %	20 %	385793853
87	NC_017453	TTTCT	2	10	103829	103838	0 %	80 %	0 %	20 %	385793854
88	NC_017453	ATTTA	2	10	104933	104942	40 %	60 %	0 %	0 %	385793856
89	NC_017453	CATAT	2	10	105179	105188	40 %	40 %	0 %	20 %	385793856
90	NC_017453	CATTT	2	10	105335	105344	20 %	60 %	0 %	20 %	385793856
91	NC_017453	ACAAT	2	10	105536	105545	60 %	20 %	0 %	20 %	385793856
92	NC_017453	TTGAT	2	10	105737	105746	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017453	AAACT	2	10	108673	108682	60 %	20 %	0 %	20 %	385793861
94	NC_017453	TTCAT	2	10	110105	110114	20 %	60 %	0 %	20 %	385793862
95	NC_017453	AGCAC	2	10	111005	111014	40 %	0 %	20 %	40 %	385793862
96	NC_017453	CTCTA	2	10	111631	111640	20 %	40 %	0 %	40 %	385793862
97	NC_017453	AAACT	2	10	111777	111786	60 %	20 %	0 %	20 %	385793862
98	NC_017453	TTTTC	2	10	115217	115226	0 %	80 %	0 %	20 %	385793866
99	NC_017453	GTTTG	2	10	115250	115259	0 %	60 %	40 %	0 %	385793866
100	NC_017453	TAAAA	2	10	117450	117459	80 %	20 %	0 %	0 %	385793868
101	NC_017453	CAAGC	2	10	119281	119290	40 %	0 %	20 %	40 %	385793869
102	NC_017453	GCTTT	2	10	119380	119389	0 %	60 %	20 %	20 %	385793869
103	NC_017453	CAAAA	2	10	122790	122799	80 %	0 %	0 %	20 %	385793871
104	NC_017453	TTTTA	2	10	125058	125067	20 %	80 %	0 %	0 %	385793873
105	NC_017453	TGTAT	2	10	125589	125598	20 %	60 %	20 %	0 %	385793874
106	NC_017453	TGCAA	2	10	126057	126066	40 %	20 %	20 %	20 %	385793874
107	NC_017453	GTATT	2	10	130861	130870	20 %	60 %	20 %	0 %	385793878
108	NC_017453	GTATG	2	10	135082	135091	20 %	40 %	40 %	0 %	385793881
109	NC_017453	GGTGT	2	10	136324	136333	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017453	ATTAC	2	10	140100	140109	40 %	40 %	0 %	20 %	385793886
111	NC_017453	CTGGT	2	10	142447	142456	0 %	40 %	40 %	20 %	385793889
112	NC_017453	CATCT	2	10	144017	144026	20 %	40 %	0 %	40 %	385793890
113	NC_017453	TTCTT	2	10	144089	144098	0 %	80 %	0 %	20 %	385793891
114	NC_017453	ATCTT	2	10	145020	145029	20 %	60 %	0 %	20 %	385793892
115	NC_017453	CTTAT	2	10	146347	146356	20 %	60 %	0 %	20 %	385793893
116	NC_017453	CTAGT	2	10	147918	147927	20 %	40 %	20 %	20 %	385793895
117	NC_017453	AAATC	2	10	148350	148359	60 %	20 %	0 %	20 %	385793896
118	NC_017453	GGTAA	2	10	153567	153576	40 %	20 %	40 %	0 %	385793901
119	NC_017453	AATGA	2	10	154012	154021	60 %	20 %	20 %	0 %	385793902
120	NC_017453	TTCCT	2	10	157030	157039	0 %	60 %	0 %	40 %	385793905
121	NC_017453	CTAAG	2	10	160298	160307	40 %	20 %	20 %	20 %	385793906
122	NC_017453	TACAT	2	10	160431	160440	40 %	40 %	0 %	20 %	385793906
123	NC_017453	CTATA	2	10	160678	160687	40 %	40 %	0 %	20 %	385793906
124	NC_017453	GTGAT	2	10	162185	162194	20 %	40 %	40 %	0 %	385793906
125	NC_017453	ATGGT	2	10	162596	162605	20 %	40 %	40 %	0 %	385793906
126	NC_017453	TTTAT	2	10	168824	168833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017453	ACTAC	2	10	169026	169035	40 %	20 %	0 %	40 %	385793913
128	NC_017453	TGCTA	2	10	169339	169348	20 %	40 %	20 %	20 %	385793913
129	NC_017453	AGAGA	2	10	169926	169935	60 %	0 %	40 %	0 %	385793914
130	NC_017453	AGCTA	2	10	170454	170463	40 %	20 %	20 %	20 %	385793915
131	NC_017453	TAAAA	2	10	173842	173851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017453	AGCTA	2	10	174678	174687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017453	AGTAA	2	10	174868	174877	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017453	GCATG	2	10	176749	176758	20 %	20 %	40 %	20 %	385793922
135	NC_017453	TACCT	2	10	177265	177274	20 %	40 %	0 %	40 %	385793923
136	NC_017453	GATGA	2	10	178834	178843	40 %	20 %	40 %	0 %	385793923
137	NC_017453	CAAAA	2	10	179565	179574	80 %	0 %	0 %	20 %	385793924
138	NC_017453	GTAAT	2	10	181033	181042	40 %	40 %	20 %	0 %	385793925
139	NC_017453	TTTTC	2	10	181436	181445	0 %	80 %	0 %	20 %	385793925
140	NC_017453	TTGCT	2	10	181801	181810	0 %	60 %	20 %	20 %	385793926
141	NC_017453	TTACT	2	10	181833	181842	20 %	60 %	0 %	20 %	385793926
142	NC_017453	AATGT	2	10	182333	182342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017453	TAGTT	2	10	198251	198260	20 %	60 %	20 %	0 %	385793944
152	NC_017453	CTTCT	2	10	198710	198719	0 %	60 %	0 %	40 %	385793945
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156	NC_017453	ATGTA	2	10	200341	200350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017453	TTTAT	2	10	202444	202453	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017453	TAATG	2	10	202478	202487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017453	TATTT	2	10	254831	254840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017453	TACAG	2	10	256487	256496	40 %	20 %	20 %	20 %	385794006
198	NC_017453	TCAAG	2	10	256977	256986	40 %	20 %	20 %	20 %	385794006
199	NC_017453	TTATC	2	10	257494	257503	20 %	60 %	0 %	20 %	385794006
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224	NC_017453	ATACG	2	10	289620	289629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_017453	TTAAG	2	10	330237	330246	40 %	40 %	20 %	0 %	385794077
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253	NC_017453	GGGTA	2	10	331325	331334	20 %	20 %	60 %	0 %	385794078
254	NC_017453	TCTGG	2	10	335431	335440	0 %	40 %	40 %	20 %	385794085
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257	NC_017453	TGAGA	2	10	339921	339930	40 %	20 %	40 %	0 %	385794090
258	NC_017453	GATCA	2	10	340578	340587	40 %	20 %	20 %	20 %	385794092
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260	NC_017453	ATTTT	2	10	342423	342432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017453	TTATT	2	10	347053	347062	20 %	80 %	0 %	0 %	385794107
262	NC_017453	ATCCT	2	10	350400	350409	20 %	40 %	0 %	40 %	385794112
263	NC_017453	ATTTC	2	10	351140	351149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_017453	TCAAT	2	10	352891	352900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017453	CATTA	2	10	353080	353089	40 %	40 %	0 %	20 %	385794117
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