MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis NE061598 chromosome

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017453	ATTAA	2	10	4709	4718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017453	TAGCT	2	10	5984	5993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017453	CTTTT	2	10	14595	14604	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017453	ATTAA	2	10	24687	24696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017453	GATTT	2	10	46235	46244	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017453	TTGGT	2	10	46436	46445	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017453	GATAG	2	10	47134	47143	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017453	TTAAT	2	10	47537	47546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017453	AATTT	2	10	59671	59680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017453	TTTAT	2	10	88781	88790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017453	GTTTT	2	10	93013	93022	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017453	AATGT	2	10	96820	96829	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017453	AATAT	2	10	96849	96858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017453	TTGAT	2	10	105737	105746	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017453	GGTGT	2	10	136324	136333	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017453	TTTAT	2	10	168824	168833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017453	TAAAA	2	10	173842	173851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017453	AGCTA	2	10	174678	174687	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017453	AGTAA	2	10	174868	174877	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017453	AATGT	2	10	182333	182342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017453	ATGTA	2	10	200341	200350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017453	TTATC	2	10	200351	200360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017453	TTTAT	2	10	202444	202453	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017453	TAATG	2	10	202478	202487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017453	TAAAG	2	10	203825	203834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017453	CTTTT	2	10	218732	218741	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017453	AATAA	2	10	245008	245017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017453	TCAAG	2	10	250304	250313	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017453	GCTAG	2	10	251200	251209	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017453	CTATA	2	10	254215	254224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017453	TATTT	2	10	254831	254840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017453	CTATA	2	10	261062	261071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017453	AAAAT	2	10	270463	270472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017453	ATTTT	2	10	287302	287311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017453	AGCAA	2	10	288797	288806	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017453	TTTAT	2	10	289056	289065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017453	ATACG	2	10	289620	289629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017453	TTAAG	2	10	293927	293936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017453	AGATT	2	10	294021	294030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017453	AAAAC	2	10	300579	300588	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017453	AAAAT	2	10	319399	319408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017453	TAATA	2	10	337748	337757	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017453	ATTTT	2	10	342423	342432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017453	ATTTC	2	10	351140	351149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017453	TCAAT	2	10	352891	352900	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017453	CTTGG	2	10	375400	375409	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017453	AGAAA	2	10	376914	376923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017453	ATTGA	2	10	381133	381142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017453	TAATT	2	10	383634	383643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017453	TGAAA	2	10	396383	396392	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017453	TAATT	2	10	401146	401155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017453	TTTTA	2	10	409072	409081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017453	AGTTA	2	10	409091	409100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017453	TTAAC	2	10	436406	436415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017453	CAAGA	2	10	441847	441856	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017453	AGTGT	2	10	441970	441979	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017453	TTTAA	2	10	444880	444889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017453	TCTCT	2	10	454564	454573	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017453	AACTT	2	10	459338	459347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017453	TTTTC	2	10	481455	481464	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017453	AAACT	2	10	501176	501185	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017453	ATTAT	2	10	509059	509068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017453	ATTTA	2	10	509076	509085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017453	CTAGG	2	10	513794	513803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017453	ATTTG	2	10	518683	518692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017453	ACAAA	2	10	524787	524796	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017453	ATTTA	2	10	527412	527421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017453	ATTAT	2	10	532906	532915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017453	TAATT	2	10	549339	549348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017453	AAGAA	2	10	552615	552624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017453	AGCTA	2	10	562844	562853	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017453	GTATT	2	10	570175	570184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017453	AACAA	2	10	575233	575242	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017453	ATTTG	2	10	583958	583967	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017453	GTTTT	2	10	587601	587610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017453	TTTTA	2	10	599299	599308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017453	TTGAT	2	10	600707	600716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017453	CTTTT	2	10	604757	604766	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017453	TAAAA	2	10	604897	604906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017453	TATCT	2	10	605166	605175	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017453	AAGAA	2	10	605692	605701	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017453	AACAA	2	10	605729	605738	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017453	TTATA	2	10	612004	612013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017453	ATTTT	2	10	612220	612229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017453	TAGAA	2	10	617501	617510	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017453	GATAT	2	10	618841	618850	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017453	TTTTA	2	10	619841	619850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017453	TAATT	2	10	638742	638751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017453	CTTTT	2	10	650301	650310	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017453	TAATA	2	10	662086	662095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017453	ATAAA	2	10	677253	677262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017453	TATAA	2	10	678282	678291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017453	ATTTT	2	10	680686	680695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017453	TATTT	2	10	681217	681226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017453	TTATA	2	10	688015	688024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017453	ATTTA	2	10	691869	691878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017453	AATAA	2	10	691963	691972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017453	TATCT	2	10	712520	712529	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017453	TTAAT	2	10	717698	717707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017453	GAAAA	2	10	725086	725095	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017453	AGGTG	2	10	737452	737461	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017453	CAAAT	2	10	737513	737522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017453	TAGTT	2	10	748982	748991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017453	TTAGA	2	10	750380	750389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017453	ATTTA	2	10	760901	760910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017453	TTTTG	2	10	773628	773637	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017453	AAATA	2	10	780499	780508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017453	TATTT	2	10	792904	792913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017453	ATTAT	2	10	793775	793784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017453	TTATT	2	10	794073	794082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017453	AAATG	2	10	795196	795205	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017453	ATAGT	2	10	795430	795439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017453	AAATT	2	10	802516	802525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017453	TATAT	2	10	824843	824852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017453	TAAAA	2	10	832138	832147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017453	ATATT	2	10	833496	833505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017453	AATAT	2	10	835098	835107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017453	ATTTA	2	10	852323	852332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017453	AATCT	2	10	856724	856733	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017453	ACTAC	2	10	857501	857510	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017453	GAACA	2	10	857938	857947	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017453	GCGAT	2	10	865127	865136	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017453	GCTTG	2	10	866068	866077	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017453	ATTTC	2	10	871534	871543	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017453	AGATA	2	10	878664	878673	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017453	AATCT	2	10	887233	887242	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017453	ATTTA	2	10	893144	893153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017453	TAGTT	2	10	899090	899099	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017453	TTAGA	2	10	899319	899328	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017453	GATTT	2	10	901167	901176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017453	CTGTC	2	10	907401	907410	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017453	TTTAT	2	10	909949	909958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017453	AATAA	2	10	916236	916245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017453	AGCTA	2	10	935777	935786	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017453	CTATT	2	10	942655	942664	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017453	AGCTA	2	10	945621	945630	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017453	CTAAC	2	10	945731	945740	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017453	TAGAG	2	10	959487	959496	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017453	ATTAA	2	10	989577	989586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017453	AATAA	2	10	991095	991104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017453	ACTTA	2	10	994440	994449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017453	ATTTA	2	10	994656	994665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017453	TATTT	2	10	996924	996933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017453	TATTT	2	10	996936	996945	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017453	AGCAA	2	10	1006484	1006493	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017453	AATAT	2	10	1007214	1007223	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017453	TAACT	2	10	1020262	1020271	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017453	CATAA	2	10	1020996	1021005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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289	NC_017453	ACTTT	2	10	1845626	1845635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_017453	TGATG	2	10	1845911	1845920	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017453	ATTTT	2	10	1853280	1853289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_017453	TAAAA	2	10	1861222	1861231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017453	TTCAA	2	10	1869600	1869609	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_017453	TAAAC	2	10	1876994	1877003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_017453	TAGCA	2	10	1882317	1882326	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
296	NC_017453	TTTTA	2	10	1892262	1892271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.