MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	AAAAAC	2	12	1679	1690	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386263234
2	NC_017451	ACAAGA	2	12	3318	3329	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263237
3	NC_017451	AGTTGA	2	12	4998	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
4	NC_017451	CCAGAA	2	12	5924	5935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386263238
5	NC_017451	ATTGAT	2	12	7980	7991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263242
6	NC_017451	TGCTTT	2	12	8842	8853	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263243
7	NC_017451	TTGATA	2	12	9357	9368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263244
8	NC_017451	TTTCTG	2	12	11579	11590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263247
9	NC_017451	CGTGGA	2	12	13411	13422	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386263249
10	NC_017451	TGAAGC	2	12	13661	13672	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386263249
11	NC_017451	ATTTTG	2	12	17052	17063	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263250
12	NC_017451	TACAAT	2	12	18892	18903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386263252
13	NC_017451	TTTCTT	2	12	20870	20881	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386263255
14	NC_017451	TATTGA	2	12	22181	22192	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263256
15	NC_017451	TTATTT	2	12	23589	23600	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386263257
16	NC_017451	GTTGAT	2	12	32050	32061	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386263266
17	NC_017451	CCTCAA	2	12	46580	46591	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386263281
18	NC_017451	AAATGC	2	12	49490	49501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386263285
19	NC_017451	GATTTA	2	12	49967	49978	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263286
20	NC_017451	TTCCAG	2	12	50694	50705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263286
21	NC_017451	TGATAC	2	12	52080	52091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386263287
22	NC_017451	CGTTCT	2	12	52730	52741	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386263288
23	NC_017451	CCCAAG	2	12	53738	53749	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386263289
24	NC_017451	GCAAAA	2	12	58426	58437	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263293
25	NC_017451	TCTGGT	2	12	59154	59165	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386263294
26	NC_017451	ATAAAG	2	12	59173	59184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386263294
27	NC_017451	CAAACT	2	12	62254	62265	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386263296
28	NC_017451	AAACAA	2	12	63798	63809	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386263296
29	NC_017451	TATATG	2	12	64086	64097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263296
30	NC_017451	TTCGCT	2	12	71265	71276	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386263300
31	NC_017451	AAACTT	2	12	82393	82404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386263311
32	NC_017451	CTGCAG	2	12	85443	85454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386263314
33	NC_017451	AACAAA	2	12	89065	89076	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386263319
34	NC_017451	ATTTAT	2	12	90491	90502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263321
35	NC_017451	TGGCTG	2	12	92268	92279	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386263324
36	NC_017451	CTGCAT	2	12	93591	93602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263326
37	NC_017451	AAAACA	2	12	94210	94221	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386263326
38	NC_017451	GCACGT	2	12	96525	96536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386263328
39	NC_017451	CTCTTC	2	12	106122	106133	0 %	50 %	0 %	50 %	386263338
40	NC_017451	GCAAGA	2	12	107177	107188	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386263339
41	NC_017451	CGCAAA	2	12	108166	108177	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386263340
42	NC_017451	TGAAAT	2	12	108350	108361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386263340
43	NC_017451	GTGAAT	2	12	112314	112325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263344
44	NC_017451	TTATTG	2	12	119049	119060	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263350
45	NC_017451	AGATAA	2	12	126349	126360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386263357
46	NC_017451	ATTTTA	2	12	130326	130337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263360
47	NC_017451	TTTTAC	2	12	132598	132609	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386263362
48	NC_017451	ATTTTG	2	12	138803	138814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263367
49	NC_017451	TTATTT	2	12	139264	139275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386263367
50	NC_017451	GAAACA	2	12	144982	144993	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263375
51	NC_017451	AATAAG	2	12	148301	148312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386263379
52	NC_017451	ATGCAG	2	12	150429	150440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386263380
53	NC_017451	CTTGCA	2	12	151137	151148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263381
54	NC_017451	GTACGG	2	12	152347	152358	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386263382
55	NC_017451	TATTGA	2	12	154875	154886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263384
56	NC_017451	AATACC	2	12	158042	158053	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386263386
57	NC_017451	TTTGCT	2	12	161272	161283	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263391
58	NC_017451	GGCAAT	2	12	164933	164944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386263392
59	NC_017451	CACGAA	2	12	166902	166913	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386263395
60	NC_017451	ATTGGC	2	12	169668	169679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386263397
61	NC_017451	GTGGGC	2	12	171832	171843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386263399
62	NC_017451	GAAAAT	2	12	173079	173090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386263400
63	NC_017451	TTTAAG	2	12	174637	174648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263403
64	NC_017451	TCTTTG	2	12	180723	180734	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263409
65	NC_017451	CAATAA	2	12	181585	181596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386263410
66	NC_017451	GTATTG	2	12	181611	181622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386263410
67	NC_017451	TGGCAC	2	12	186661	186672	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386263413
68	NC_017451	TAAACC	2	12	188982	188993	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386263415
69	NC_017451	CAATAA	2	12	189985	189996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386263416
70	NC_017451	TGATTT	2	12	191904	191915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263418
71	NC_017451	TTTTAG	2	12	192658	192669	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263419
72	NC_017451	AGGCTA	2	12	193447	193458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386263420
73	NC_017451	GCAAAA	2	12	193668	193679	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263420
74	NC_017451	GCAAAA	2	12	193788	193799	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263420
75	NC_017451	TTGTGG	2	12	199794	199805	0 %	50 %	50 %	0 %	386263427
76	NC_017451	GCACTT	2	12	212216	212227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263441
77	NC_017451	CTTACT	2	12	215468	215479	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386263444
78	NC_017451	CTAAGC	2	12	215744	215755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386263445
79	NC_017451	ATTTCC	2	12	216195	216206	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386263445
80	NC_017451	TTTTTG	2	12	222224	222235	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386263451
81	NC_017451	ACCAAA	2	12	225096	225107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263455
82	NC_017451	CGTGAC	2	12	227076	227087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386263457
83	NC_017451	GCGTTG	2	12	230358	230369	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386263460
84	NC_017451	AGCCTT	2	12	231911	231922	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263462
85	NC_017451	TAAATT	2	12	234557	234568	50 %	50 %	0 %	0 %	386263463
86	NC_017451	CTTGAT	2	12	235438	235449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386263465
87	NC_017451	ACTCGT	2	12	243327	243338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263473
88	NC_017451	GAAGTG	2	12	250175	250186	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386263482
89	NC_017451	TTAATC	2	12	252589	252600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386263484
90	NC_017451	GCAGAA	2	12	254122	254133	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386263486
91	NC_017451	TAGATC	2	12	259388	259399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386263492
92	NC_017451	TAGATA	2	12	262782	262793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386263498
93	NC_017451	TGCTTT	2	12	264239	264250	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263499
94	NC_017451	TTCAAT	2	12	266668	266679	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386263503
95	NC_017451	CATCGG	2	12	269347	269358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386263505
96	NC_017451	TGATTG	2	12	271030	271041	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386263507
97	NC_017451	ACAACC	2	12	271900	271911	50 %	0 %	0 %	50 %	386263508
98	NC_017451	AAACCA	2	12	275845	275856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263511
99	NC_017451	ACGGTA	2	12	280532	280543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386263518
100	NC_017451	TCAAGT	2	12	282645	282656	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386263519
101	NC_017451	CTTGCA	2	12	289733	289744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263525
102	NC_017451	AAATTA	2	12	298252	298263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263532
103	NC_017451	ATTTGA	2	12	306564	306575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263542
104	NC_017451	ATCTAA	2	12	307236	307247	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386263542
105	NC_017451	ACCCGT	2	12	307845	307856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386263542
106	NC_017451	TCTTTC	5	30	307861	307890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263542
107	NC_017451	GCTATT	2	12	308580	308591	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386263542
108	NC_017451	TATCTT	2	12	311133	311144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386263544
109	NC_017451	ATTTGT	2	12	311275	311286	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263544
110	NC_017451	TGATGG	2	12	312106	312117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386263544
111	NC_017451	TGGCAT	2	12	314330	314341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386263545
112	NC_017451	ACAAAC	2	12	314837	314848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263546
113	NC_017451	CAAGAT	2	12	316494	316505	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386263548
114	NC_017451	AATATC	2	12	318448	318459	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386263550
115	NC_017451	CTGATC	2	12	320051	320062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263552
116	NC_017451	TGGAAT	2	12	321397	321408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263555
117	NC_017451	AGAGCC	2	12	321525	321536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263555
118	NC_017451	CCAGAA	2	12	321562	321573	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386263555
119	NC_017451	GAAAAG	2	12	321634	321645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263555
120	NC_017451	CCAAAA	2	12	321646	321657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263555
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122	NC_017451	GCGCGT	2	12	325111	325122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386263557
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230	NC_017451	TGTTCT	2	12	622213	622224	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263831
231	NC_017451	GGCGCA	2	12	625661	625672	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386263834
232	NC_017451	CTTGAT	2	12	627227	627238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386263834
233	NC_017451	CAATCG	2	12	632093	632104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386263837
234	NC_017451	ATCTAA	2	12	632926	632937	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386263839
235	NC_017451	ATTGGC	2	12	637432	637443	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386263842
236	NC_017451	TTTAGA	2	12	638913	638924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263843
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238	NC_017451	TAGCTT	2	12	644243	644254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386263847
239	NC_017451	TTTTAC	2	12	645737	645748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386263849
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243	NC_017451	TTGCTT	2	12	655250	655261	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386263860
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249	NC_017451	CATCTT	2	12	675723	675734	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386263881
250	NC_017451	TAAACG	2	12	683033	683044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386263886
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254	NC_017451	TGTTTA	2	12	689165	689176	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386263892
255	NC_017451	GCTAGA	2	12	691658	691669	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386263896
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257	NC_017451	CCAGTT	2	12	693134	693145	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263897
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259	NC_017451	CAGAAC	2	12	694717	694728	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386263897
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261	NC_017451	TTGTAG	2	12	700221	700232	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386263902
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284	NC_017451	CATAGG	2	12	771024	771035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386263959
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287	NC_017451	TTCCAT	2	12	782739	782750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386263969
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293	NC_017451	CAGCTT	2	12	799321	799332	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386263982
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300	NC_017451	TGGCGT	2	12	809188	809199	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386263991
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303	NC_017451	AGAATT	2	12	817545	817556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386263999
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305	NC_017451	AATGCC	2	12	825644	825655	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386264008
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309	NC_017451	TGAAGC	3	18	830039	830056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386264011
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314	NC_017451	ATTCTG	2	12	841908	841919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386264019
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324	NC_017451	GAAAAA	2	12	875003	875014	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386264044
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326	NC_017451	GAAGAT	2	12	885378	885389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386264052
327	NC_017451	TCGTGG	2	12	886228	886239	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386264053
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330	NC_017451	ATTGTG	2	12	888623	888634	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386264054
331	NC_017451	TGTGGT	2	12	888810	888821	0 %	50 %	50 %	0 %	386264054
332	NC_017451	TGTGCC	2	12	888908	888919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386264054
333	NC_017451	AGATAA	2	12	891841	891852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386264055
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335	NC_017451	AGCATT	2	12	893537	893548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386264056
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337	NC_017451	ATTACG	2	12	910450	910461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386264073
338	NC_017451	GAATTA	2	12	910891	910902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386264073
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341	NC_017451	GAAATT	2	12	923488	923499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386264089
342	NC_017451	ATGATA	2	12	923585	923596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386264089
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344	NC_017451	GAACAA	2	12	926711	926722	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386264091
345	NC_017451	TAAACG	2	12	931568	931579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386264096
346	NC_017451	AGTGGC	2	12	936352	936363	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386264099
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444	NC_017451	TTCACA	2	12	1153241	1153252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386264310
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447	NC_017451	ACTCAT	2	12	1160103	1160114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386264318
448	NC_017451	CGTGCT	2	12	1160671	1160682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386264319
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450	NC_017451	GCAATG	2	12	1163902	1163913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386264322
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452	NC_017451	TACGGT	2	12	1166856	1166867	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386264324
453	NC_017451	TAAGCA	2	12	1170078	1170089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386264326
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