MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 1521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	TCTGG	2	10	3368	3377	0 %	40 %	40 %	20 %	386263237
2	NC_017451	TTGAT	2	10	3704	3713	20 %	60 %	20 %	0 %	386263237
3	NC_017451	TCGTA	2	10	4233	4242	20 %	40 %	20 %	20 %	386263237
4	NC_017451	CACAC	2	10	6220	6229	40 %	0 %	0 %	60 %	386263238
5	NC_017451	AAAAG	2	10	6554	6563	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017451	AGTTA	2	10	7396	7405	40 %	40 %	20 %	0 %	386263241
7	NC_017451	TTGAT	2	10	8703	8712	20 %	60 %	20 %	0 %	386263243
8	NC_017451	TGAAA	2	10	9289	9298	60 %	20 %	20 %	0 %	386263244
9	NC_017451	CCATT	2	10	12670	12679	20 %	40 %	0 %	40 %	386263249
10	NC_017451	AAACC	2	10	13994	14003	60 %	0 %	0 %	40 %	386263249
11	NC_017451	GCATT	2	10	14713	14722	20 %	40 %	20 %	20 %	386263249
12	NC_017451	CTTTC	2	10	14924	14933	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017451	ATTTT	2	10	15739	15748	20 %	80 %	0 %	0 %	386263250
14	NC_017451	CTTAT	2	10	17585	17594	20 %	60 %	0 %	20 %	386263251
15	NC_017451	AATCC	2	10	18917	18926	40 %	20 %	0 %	40 %	386263252
16	NC_017451	TATTT	2	10	20100	20109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017451	CTTGC	2	10	21879	21888	0 %	40 %	20 %	40 %	386263256
18	NC_017451	TCATT	2	10	23558	23567	20 %	60 %	0 %	20 %	386263257
19	NC_017451	TTGAA	2	10	23844	23853	40 %	40 %	20 %	0 %	386263258
20	NC_017451	TATCG	2	10	25157	25166	20 %	40 %	20 %	20 %	386263259
21	NC_017451	AAAGC	2	10	26770	26779	60 %	0 %	20 %	20 %	386263260
22	NC_017451	ACTGG	2	10	29724	29733	20 %	20 %	40 %	20 %	386263263
23	NC_017451	ACGAA	2	10	31204	31213	60 %	0 %	20 %	20 %	386263265
24	NC_017451	GCATC	2	10	32936	32945	20 %	20 %	20 %	40 %	386263267
25	NC_017451	ATAAA	2	10	35247	35256	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017451	TGTTC	2	10	35601	35610	0 %	60 %	20 %	20 %	386263273
27	NC_017451	TTTCA	2	10	35885	35894	20 %	60 %	0 %	20 %	386263273
28	NC_017451	ATTAC	2	10	36939	36948	40 %	40 %	0 %	20 %	386263273
29	NC_017451	TTTTC	2	10	37054	37063	0 %	80 %	0 %	20 %	386263273
30	NC_017451	AAAAT	2	10	37447	37456	80 %	20 %	0 %	0 %	386263275
31	NC_017451	AAGAA	2	10	39656	39665	80 %	0 %	20 %	0 %	386263277
32	NC_017451	TGGTA	2	10	39788	39797	20 %	40 %	40 %	0 %	386263277
33	NC_017451	AAGAT	2	10	43288	43297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017451	AATGA	2	10	43727	43736	60 %	20 %	20 %	0 %	386263279
35	NC_017451	CAGTA	2	10	44599	44608	40 %	20 %	20 %	20 %	386263279
36	NC_017451	GTTTG	2	10	44760	44769	0 %	60 %	40 %	0 %	386263279
37	NC_017451	GCGTT	2	10	45276	45285	0 %	40 %	40 %	20 %	386263280
38	NC_017451	TTTAA	2	10	45478	45487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017451	ATTTT	2	10	45500	45509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017451	GATTA	2	10	46209	46218	40 %	40 %	20 %	0 %	386263281
41	NC_017451	TTTTG	2	10	47181	47190	0 %	80 %	20 %	0 %	386263282
42	NC_017451	TGGAA	2	10	47688	47697	40 %	20 %	40 %	0 %	386263283
43	NC_017451	GGTTG	2	10	49461	49470	0 %	40 %	60 %	0 %	386263285
44	NC_017451	GAAAA	2	10	50294	50303	80 %	0 %	20 %	0 %	386263286
45	NC_017451	TACAA	2	10	54197	54206	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017451	CTTCA	2	10	54236	54245	20 %	40 %	0 %	40 %	386263290
47	NC_017451	ACGCA	2	10	55383	55392	40 %	0 %	20 %	40 %	386263290
48	NC_017451	TTAAC	2	10	56642	56651	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017451	ATGAT	2	10	58670	58679	40 %	40 %	20 %	0 %	386263293
50	NC_017451	ATTCC	2	10	62403	62412	20 %	40 %	0 %	40 %	386263296
51	NC_017451	TAATT	2	10	62654	62663	40 %	60 %	0 %	0 %	386263296
52	NC_017451	ATCAA	2	10	63778	63787	60 %	20 %	0 %	20 %	386263296
53	NC_017451	GTGAA	2	10	64783	64792	40 %	20 %	40 %	0 %	386263297
54	NC_017451	TTGGA	2	10	69444	69453	20 %	40 %	40 %	0 %	386263298
55	NC_017451	GTTTA	2	10	71780	71789	20 %	60 %	20 %	0 %	386263300
56	NC_017451	TATTT	2	10	72371	72380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017451	TATAT	2	10	72431	72440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017451	TTCAG	2	10	74011	74020	20 %	40 %	20 %	20 %	386263303
59	NC_017451	TTTTC	2	10	79922	79931	0 %	80 %	0 %	20 %	386263309
60	NC_017451	TTTGA	2	10	80117	80126	20 %	60 %	20 %	0 %	386263309
61	NC_017451	CCAGC	2	10	81018	81027	20 %	0 %	20 %	60 %	386263310
62	NC_017451	ACGCA	2	10	84550	84559	40 %	0 %	20 %	40 %	386263312
63	NC_017451	ATCAA	2	10	85551	85560	60 %	20 %	0 %	20 %	386263314
64	NC_017451	TTTCC	2	10	86351	86360	0 %	60 %	0 %	40 %	386263315
65	NC_017451	TTTTA	2	10	89019	89028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017451	TGAAT	2	10	90114	90123	40 %	40 %	20 %	0 %	386263320
67	NC_017451	AATGC	2	10	90917	90926	40 %	20 %	20 %	20 %	386263322
68	NC_017451	ACGTA	2	10	90986	90995	40 %	20 %	20 %	20 %	386263322
69	NC_017451	AACTT	2	10	91560	91569	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017451	GCTTA	2	10	92363	92372	20 %	40 %	20 %	20 %	386263325
71	NC_017451	AAATT	2	10	92783	92792	60 %	40 %	0 %	0 %	386263325
72	NC_017451	TAATT	2	10	95245	95254	40 %	60 %	0 %	0 %	386263327
73	NC_017451	TGAAT	2	10	95305	95314	40 %	40 %	20 %	0 %	386263327
74	NC_017451	ATGAA	2	10	95926	95935	60 %	20 %	20 %	0 %	386263328
75	NC_017451	ATTTA	2	10	96772	96781	40 %	60 %	0 %	0 %	386263329
76	NC_017451	GCAGA	2	10	96794	96803	40 %	0 %	40 %	20 %	386263329
77	NC_017451	ATGGA	2	10	97419	97428	40 %	20 %	40 %	0 %	386263330
78	NC_017451	TAAAA	2	10	97588	97597	80 %	20 %	0 %	0 %	386263330
79	NC_017451	TGGAA	2	10	97993	98002	40 %	20 %	40 %	0 %	386263330
80	NC_017451	TAAAG	2	10	98473	98482	60 %	20 %	20 %	0 %	386263330
81	NC_017451	ATTGT	2	10	98618	98627	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017451	TCTTT	2	10	99113	99122	0 %	80 %	0 %	20 %	386263331
83	NC_017451	GATTT	2	10	101536	101545	20 %	60 %	20 %	0 %	386263334
84	NC_017451	CATTT	2	10	101741	101750	20 %	60 %	0 %	20 %	386263335
85	NC_017451	GGATA	2	10	103249	103258	40 %	20 %	40 %	0 %	386263336
86	NC_017451	TCAAT	2	10	103714	103723	40 %	40 %	0 %	20 %	386263336
87	NC_017451	CTAGA	2	10	104244	104253	40 %	20 %	20 %	20 %	386263337
88	NC_017451	TGGAC	2	10	105305	105314	20 %	20 %	40 %	20 %	386263337
89	NC_017451	TTTTC	2	10	106741	106750	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017451	GAATT	2	10	107052	107061	40 %	40 %	20 %	0 %	386263339
91	NC_017451	AGTAC	2	10	108584	108593	40 %	20 %	20 %	20 %	386263341
92	NC_017451	TACCG	2	10	111461	111470	20 %	20 %	20 %	40 %	386263343
93	NC_017451	ACATC	2	10	112913	112922	40 %	20 %	0 %	40 %	386263344
94	NC_017451	ATTTT	2	10	114523	114532	20 %	80 %	0 %	0 %	386263345
95	NC_017451	AAAGT	2	10	115979	115988	60 %	20 %	20 %	0 %	386263346
96	NC_017451	ATGAA	2	10	116960	116969	60 %	20 %	20 %	0 %	386263348
97	NC_017451	TATGG	2	10	118741	118750	20 %	40 %	40 %	0 %	386263349
98	NC_017451	TAAAA	2	10	119678	119687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017451	ATTTT	2	10	119711	119720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017451	AACTT	2	10	119726	119735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017451	GATTT	2	10	119825	119834	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017451	TGGAT	2	10	122741	122750	20 %	40 %	40 %	0 %	386263351
103	NC_017451	GAAAA	2	10	123698	123707	80 %	0 %	20 %	0 %	386263352
104	NC_017451	TTATT	2	10	124782	124791	20 %	80 %	0 %	0 %	386263354
105	NC_017451	GGTTG	2	10	133444	133453	0 %	40 %	60 %	0 %	386263362
106	NC_017451	GCATT	2	10	137506	137515	20 %	40 %	20 %	20 %	386263366
107	NC_017451	CCTTT	2	10	138923	138932	0 %	60 %	0 %	40 %	386263367
108	NC_017451	TTAAT	2	10	139634	139643	40 %	60 %	0 %	0 %	386263368
109	NC_017451	ATTAT	2	10	140582	140591	40 %	60 %	0 %	0 %	386263370
110	NC_017451	GCGGA	2	10	140721	140730	20 %	0 %	60 %	20 %	386263370
111	NC_017451	TGAAA	2	10	143275	143284	60 %	20 %	20 %	0 %	386263373
112	NC_017451	AATGA	2	10	145603	145612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017451	GCAAT	2	10	147016	147025	40 %	20 %	20 %	20 %	386263377
114	NC_017451	GAAAT	2	10	147855	147864	60 %	20 %	20 %	0 %	386263378
115	NC_017451	TAATT	2	10	148780	148789	40 %	60 %	0 %	0 %	386263379
116	NC_017451	AATTA	2	10	149158	149167	60 %	40 %	0 %	0 %	386263379
117	NC_017451	GCAAG	2	10	151878	151887	40 %	0 %	40 %	20 %	386263381
118	NC_017451	AAAAG	2	10	152369	152378	80 %	0 %	20 %	0 %	386263382
119	NC_017451	GGAAC	2	10	152616	152625	40 %	0 %	40 %	20 %	386263382
120	NC_017451	TCAAT	2	10	153201	153210	40 %	40 %	0 %	20 %	386263383
121	NC_017451	CAAAA	2	10	153397	153406	80 %	0 %	0 %	20 %	386263383
122	NC_017451	GTGGC	2	10	154277	154286	0 %	20 %	60 %	20 %	386263384
123	NC_017451	CCGTT	2	10	154386	154395	0 %	40 %	20 %	40 %	386263384
124	NC_017451	GTGAA	2	10	155108	155117	40 %	20 %	40 %	0 %	386263384
125	NC_017451	GAAGA	2	10	155161	155170	60 %	0 %	40 %	0 %	386263384
126	NC_017451	AATAG	2	10	155590	155599	60 %	20 %	20 %	0 %	386263385
127	NC_017451	TCAGG	2	10	156697	156706	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017451	TACCA	2	10	157698	157707	40 %	20 %	0 %	40 %	386263386
129	NC_017451	CGCCT	2	10	160027	160036	0 %	20 %	20 %	60 %	386263389
130	NC_017451	ATAAA	2	10	160437	160446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017451	TATGA	2	10	164336	164345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017451	ACAAA	2	10	164377	164386	80 %	0 %	0 %	20 %	386263392
133	NC_017451	AACAT	2	10	167150	167159	60 %	20 %	0 %	20 %	386263395
134	NC_017451	CTTTT	2	10	167663	167672	0 %	80 %	0 %	20 %	386263395
135	NC_017451	TAAAA	2	10	168307	168316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017451	AAATT	2	10	169012	169021	60 %	40 %	0 %	0 %	386263396
137	NC_017451	ATTTA	2	10	169657	169666	40 %	60 %	0 %	0 %	386263397
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196	NC_017451	TAAAA	2	10	247635	247644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_017451	TAAAA	2	10	317250	317259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017451	AGATT	2	10	317501	317510	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017451	TTCAA	2	10	320300	320309	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
254	NC_017451	TAAAA	2	10	322217	322226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017451	CGCAC	2	10	324760	324769	20 %	0 %	20 %	60 %	386263557
256	NC_017451	TTATT	2	10	325826	325835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017451	AGATT	2	10	325896	325905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017451	GTAAT	2	10	326786	326795	40 %	40 %	20 %	0 %	386263558
259	NC_017451	ACGCC	2	10	328693	328702	20 %	0 %	20 %	60 %	386263558
260	NC_017451	AGAGC	2	10	329095	329104	40 %	0 %	40 %	20 %	386263558
261	NC_017451	TCAGA	2	10	330357	330366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_017451	TTTAT	2	10	330396	330405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017451	GTTTC	2	10	330739	330748	0 %	60 %	20 %	20 %	386263559
264	NC_017451	TTCAA	2	10	330980	330989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_017451	GCGAT	2	10	332071	332080	20 %	20 %	40 %	20 %	386263560
266	NC_017451	ACGAC	2	10	334738	334747	40 %	0 %	20 %	40 %	386263564
267	NC_017451	AGAAA	2	10	334865	334874	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017451	TCGTA	2	10	335726	335735	20 %	40 %	20 %	20 %	386263565
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401	NC_017451	ATTGA	2	10	512168	512177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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