MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 25491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	ATG	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263234
2	NC_017451	GGT	3	9	37	45	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
3	NC_017451	TTA	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
4	NC_017451	TGG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
5	NC_017451	AAG	2	6	182	187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
6	NC_017451	TGC	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263234
7	NC_017451	CAG	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
8	NC_017451	CAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
9	NC_017451	CCG	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263234
10	NC_017451	ACA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
11	NC_017451	TGA	2	6	699	704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263234
12	NC_017451	CAA	2	6	712	717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
13	NC_017451	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263234
14	NC_017451	ATT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
15	NC_017451	GAA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
16	NC_017451	TGG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
17	NC_017451	TAC	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263234
18	NC_017451	GCA	2	6	1442	1447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
19	NC_017451	AGA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
20	NC_017451	CGT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263234
21	NC_017451	CTT	2	6	1571	1576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263234
22	NC_017451	CAA	2	6	1663	1668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
23	NC_017451	GAA	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
24	NC_017451	AAC	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
25	NC_017451	GCA	2	6	1828	1833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
26	NC_017451	ATT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
27	NC_017451	ATT	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017451	AAC	2	6	2027	2032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017451	TAT	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017451	GTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
31	NC_017451	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263235
32	NC_017451	GGT	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
33	NC_017451	GTG	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
34	NC_017451	CGT	3	9	2609	2617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
35	NC_017451	TTC	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263236
36	NC_017451	TTA	2	6	2679	2684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263236
37	NC_017451	TCG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
38	NC_017451	TGG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263236
39	NC_017451	CGT	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
40	NC_017451	AGC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263236
41	NC_017451	GTG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263236
42	NC_017451	ATA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263236
43	NC_017451	GCA	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263236
44	NC_017451	TAA	2	6	3071	3076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263236
45	NC_017451	TCA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017451	TGA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017451	TAA	2	6	3152	3157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263237
48	NC_017451	ACT	4	12	3226	3237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
49	NC_017451	GCA	2	6	3295	3300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263237
50	NC_017451	GCA	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263237
51	NC_017451	CAA	2	6	3385	3390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
52	NC_017451	TGG	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263237
53	NC_017451	CTT	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263237
54	NC_017451	GTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
55	NC_017451	AGA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
56	NC_017451	GAA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
57	NC_017451	GAA	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
58	NC_017451	TTG	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
59	NC_017451	AGA	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
60	NC_017451	GAA	3	9	3889	3897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
61	NC_017451	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263237
62	NC_017451	GTT	2	6	4000	4005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
63	NC_017451	TGA	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
64	NC_017451	TTC	2	6	4153	4158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263237
65	NC_017451	TAA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263237
66	NC_017451	GAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
67	NC_017451	AAG	2	6	4274	4279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
68	NC_017451	GCT	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
69	NC_017451	ACT	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
70	NC_017451	AAG	2	6	4469	4474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
71	NC_017451	ATT	2	6	4519	4524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263237
72	NC_017451	TTG	2	6	4556	4561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
73	NC_017451	ATG	2	6	4646	4651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
74	NC_017451	TGG	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263237
75	NC_017451	TGT	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
76	NC_017451	AAC	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
77	NC_017451	AGT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
78	NC_017451	ATG	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
79	NC_017451	TGC	2	6	4929	4934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
80	NC_017451	CGT	3	9	5053	5061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
81	NC_017451	AAG	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
82	NC_017451	TGT	2	6	5094	5099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
83	NC_017451	CAT	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
84	NC_017451	CAA	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
85	NC_017451	CTT	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017451	AAC	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263238
87	NC_017451	CAG	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263238
88	NC_017451	GGT	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263238
89	NC_017451	AGA	2	6	5485	5490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
90	NC_017451	GCG	2	6	5609	5614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386263238
91	NC_017451	TAG	3	9	5634	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
92	NC_017451	TTA	2	6	5684	5689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
93	NC_017451	CAT	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
94	NC_017451	TTA	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
95	NC_017451	TAG	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
96	NC_017451	GAA	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
97	NC_017451	ACT	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
98	NC_017451	CTT	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263238
99	NC_017451	GTA	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
100	NC_017451	ATC	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
101	NC_017451	TGA	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
102	NC_017451	TCG	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263238
103	NC_017451	ACT	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
104	NC_017451	ATT	2	6	6154	6159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
105	NC_017451	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
106	NC_017451	TAT	2	6	6255	6260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
107	NC_017451	GGT	2	6	6272	6277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263238
108	NC_017451	TTC	2	6	6290	6295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263238
109	NC_017451	ACA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263238
110	NC_017451	GTT	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263238
111	NC_017451	ATC	2	6	6497	6502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
112	NC_017451	ATA	2	6	6505	6510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263238
113	NC_017451	AGA	2	6	6544	6549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017451	ATT	2	6	6627	6632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017451	AAT	2	6	6659	6664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263239
116	NC_017451	CAA	2	6	6677	6682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263239
117	NC_017451	TTC	2	6	6684	6689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263239
118	NC_017451	AAT	2	6	6794	6799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263239
119	NC_017451	ATA	2	6	6925	6930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263239
120	NC_017451	GTT	2	6	7015	7020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263240
121	NC_017451	GTT	2	6	7066	7071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263240
122	NC_017451	CAT	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263240
123	NC_017451	TAA	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263240
124	NC_017451	TTG	2	6	7118	7123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263240
125	NC_017451	GTT	2	6	7135	7140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263240
126	NC_017451	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263240
127	NC_017451	TAA	2	6	7147	7152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263240
128	NC_017451	CAT	2	6	7165	7170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263240
129	NC_017451	ATC	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263240
130	NC_017451	ATT	2	6	7372	7377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263241
131	NC_017451	CAA	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263241
132	NC_017451	TGC	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263241
133	NC_017451	TCA	2	6	7502	7507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263241
134	NC_017451	ATT	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263241
135	NC_017451	TAT	2	6	7817	7822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263242
136	NC_017451	CTT	2	6	7847	7852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263242
137	NC_017451	AAT	2	6	8004	8009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263242
138	NC_017451	TTA	2	6	8020	8025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263242
139	NC_017451	TCA	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263242
140	NC_017451	TCA	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263242
141	NC_017451	TAA	2	6	8379	8384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017451	TGG	2	6	8485	8490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263243
143	NC_017451	CGT	2	6	8761	8766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263243
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145	NC_017451	CTT	2	6	8985	8990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263243
146	NC_017451	CAA	2	6	9000	9005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263243
147	NC_017451	TCT	2	6	9074	9079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263243
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150	NC_017451	TTA	2	6	9317	9322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263244
151	NC_017451	GAA	2	6	9443	9448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263244
152	NC_017451	ATT	2	6	9462	9467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263244
153	NC_017451	ATA	2	6	9534	9539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017451	TCG	2	6	9583	9588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263245
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156	NC_017451	TTG	2	6	9665	9670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263245
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159	NC_017451	TCT	2	6	9937	9942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263245
160	NC_017451	TCT	2	6	10021	10026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263245
161	NC_017451	ACA	2	6	10063	10068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263245
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163	NC_017451	GTT	2	6	10304	10309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017451	TAT	2	6	10330	10335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017451	TTG	2	6	10434	10439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263246
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170	NC_017451	GTT	2	6	10573	10578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263246
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174	NC_017451	CAT	2	6	10922	10927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263246
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192	NC_017451	ATA	2	6	12476	12481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263248
193	NC_017451	ATA	2	6	12554	12559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017451	AAG	2	6	12560	12565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017451	CAA	2	6	12582	12587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263249
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232	NC_017451	ATT	2	6	14902	14907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_017451	GTG	2	6	15149	15154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263250
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250	NC_017451	TGT	2	6	16401	16406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263250
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252	NC_017451	TGA	2	6	16459	16464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263250
253	NC_017451	ATC	2	6	16488	16493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263250
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255	NC_017451	CTT	2	6	16555	16560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263250
256	NC_017451	GCC	2	6	16612	16617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263250
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258	NC_017451	ATG	2	6	16874	16879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263250
259	NC_017451	AAC	2	6	16923	16928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263250
260	NC_017451	ATT	2	6	17040	17045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263250
261	NC_017451	TAA	2	6	17098	17103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263250
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263	NC_017451	CGT	2	6	17297	17302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263250
264	NC_017451	CGT	2	6	17381	17386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263250
265	NC_017451	ATG	2	6	17636	17641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263251
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272	NC_017451	TAA	2	6	18262	18267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017451	AGA	2	6	18417	18422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263252
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279	NC_017451	TGA	2	6	18939	18944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263252
280	NC_017451	TAA	2	6	18983	18988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017451	TTC	2	6	19055	19060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263253
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289	NC_017451	ACG	2	6	19646	19651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263253
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291	NC_017451	AAT	2	6	19940	19945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263253
292	NC_017451	TTC	2	6	19980	19985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263253
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297	NC_017451	ATC	2	6	20131	20136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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