MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	TA	3	6	2006	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017451	TA	3	6	3121	3126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017451	CG	3	6	8403	8408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017451	AT	3	6	35291	35296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017451	AT	3	6	39386	39391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017451	AG	3	6	48980	48985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017451	TA	3	6	58770	58775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017451	TG	3	6	58814	58819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017451	AT	3	6	58825	58830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017451	TA	3	6	60083	60088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017451	CA	3	6	60224	60229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017451	TC	3	6	80592	80597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017451	GC	5	10	82131	82140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017451	TA	3	6	90245	90250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017451	GA	3	6	94465	94470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017451	TC	3	6	114321	114326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017451	GA	3	6	115405	115410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017451	AT	3	6	120272	120277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017451	AG	3	6	120712	120717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017451	AT	3	6	123002	123007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017451	AT	3	6	131252	131257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017451	CT	3	6	131842	131847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017451	TC	3	6	143071	143076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017451	TC	3	6	148128	148133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017451	AT	3	6	149716	149721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017451	AC	3	6	165370	165375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017451	AG	3	6	168403	168408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017451	AC	3	6	182934	182939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017451	GC	3	6	183042	183047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017451	TC	3	6	183262	183267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017451	CT	3	6	183604	183609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017451	TC	3	6	196366	196371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017451	TA	3	6	219169	219174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017451	CA	3	6	220207	220212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017451	CA	3	6	220313	220318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017451	TC	3	6	243187	243192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017451	AT	3	6	243815	243820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017451	TA	3	6	248308	248313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017451	TA	3	6	248330	248335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017451	AG	3	6	249127	249132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017451	TC	3	6	249831	249836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017451	GT	3	6	258811	258816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017451	TA	3	6	258870	258875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017451	AT	3	6	259210	259215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017451	TA	3	6	260785	260790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017451	AG	3	6	262537	262542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017451	CA	3	6	262578	262583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017451	TA	3	6	264309	264314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017451	AT	3	6	264328	264333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017451	AT	3	6	284272	284277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017451	GT	3	6	317240	317245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017451	CT	3	6	322234	322239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017451	TA	3	6	322861	322866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017451	TA	3	6	325872	325877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017451	TA	3	6	325952	325957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017451	TA	3	6	330428	330433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017451	TA	3	6	337787	337792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017451	TA	3	6	341690	341695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017451	AT	3	6	349841	349846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017451	CA	3	6	357024	357029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017451	AT	3	6	357093	357098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017451	TG	3	6	357108	357113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017451	AC	3	6	358470	358475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017451	AC	3	6	358639	358644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017451	GA	3	6	358796	358801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017451	CA	3	6	358813	358818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017451	GA	3	6	359069	359074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017451	AG	3	6	359105	359110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017451	AC	3	6	360206	360211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017451	AG	3	6	360890	360895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017451	GA	3	6	361026	361031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017451	GT	3	6	362216	362221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017451	GA	3	6	362465	362470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017451	GA	3	6	362481	362486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017451	TA	3	6	362868	362873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017451	AT	3	6	366400	366405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017451	GC	3	6	378817	378822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017451	TG	3	6	379604	379609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017451	TA	3	6	380526	380531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017451	AT	3	6	380562	380567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017451	GT	3	6	382596	382601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017451	TA	4	8	386237	386244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017451	GC	3	6	390511	390516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017451	AT	3	6	392193	392198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017451	TC	3	6	398801	398806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017451	GT	3	6	402222	402227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017451	AG	4	8	404800	404807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017451	AG	3	6	414711	414716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017451	AT	3	6	426146	426151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017451	TG	4	8	434218	434225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017451	AC	3	6	436108	436113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017451	TA	3	6	436885	436890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017451	TG	3	6	443956	443961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017451	AT	3	6	447738	447743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017451	AT	4	8	449956	449963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017451	TA	3	6	466722	466727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017451	TA	3	6	468098	468103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017451	CA	3	6	468124	468129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017451	TA	3	6	472885	472890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017451	GC	3	6	477630	477635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017451	AT	3	6	477858	477863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017451	TG	3	6	477873	477878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017451	AC	3	6	479237	479242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017451	AC	3	6	479406	479411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017451	GA	3	6	479563	479568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017451	CA	3	6	479580	479585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017451	GA	3	6	479836	479841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017451	AG	3	6	479872	479877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017451	AC	3	6	480974	480979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017451	AG	3	6	481545	481550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017451	GA	3	6	481681	481686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017451	GT	3	6	482871	482876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017451	GA	3	6	483072	483077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017451	GA	3	6	483088	483093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017451	GA	3	6	483104	483109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017451	AT	3	6	483438	483443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017451	TA	3	6	483589	483594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017451	TA	3	6	483693	483698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017451	AT	3	6	487374	487379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017451	TA	3	6	500119	500124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017451	TA	3	6	503626	503631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017451	GA	3	6	515152	515157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017451	AT	3	6	523462	523467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017451	AT	3	6	526558	526563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017451	CA	3	6	526813	526818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017451	TG	3	6	532634	532639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017451	AT	3	6	561376	561381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017451	AG	3	6	562158	562163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017451	AT	3	6	562794	562799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017451	AT	3	6	566714	566719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017451	TA	3	6	571011	571016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017451	GA	4	8	575820	575827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017451	AT	3	6	594250	594255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017451	TC	3	6	598874	598879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017451	GA	3	6	598890	598895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017451	TA	3	6	600889	600894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017451	CT	3	6	603680	603685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017451	TA	3	6	611049	611054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017451	AT	3	6	616037	616042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017451	AT	3	6	620575	620580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017451	TA	4	8	620606	620613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017451	AC	3	6	620632	620637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017451	AG	3	6	635500	635505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017451	GA	3	6	658391	658396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017451	TC	3	6	658401	658406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017451	AC	3	6	669819	669824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017451	AT	3	6	680051	680056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017451	GA	3	6	681860	681865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017451	AT	3	6	681891	681896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017451	CT	3	6	695669	695674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017451	TA	3	6	695677	695682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017451	GA	3	6	696673	696678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017451	TG	3	6	707560	707565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.