MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella cf. novicida Fx1 chromosome

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017450	GACTTT	2	12	16691	16702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017450	ATAAGT	2	12	32019	32030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017450	TTAATT	2	12	43730	43741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017450	TTTAAA	2	12	71074	71085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017450	ATATTT	2	12	80662	80673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017450	TAAGAG	2	12	107619	107630	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017450	TTATAA	2	12	123573	123584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017450	TATTTT	2	12	129152	129163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017450	ATAAAT	2	12	130538	130549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017450	AGAAAA	2	12	143817	143828	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017450	TAAAAA	2	12	151287	151298	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017450	ATTTCC	2	12	153041	153052	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017450	TAAAGA	2	12	163755	163766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017450	TATAAA	2	12	176275	176286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017450	TAGTAT	2	12	181172	181183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017450	ATTTTT	2	12	218663	218674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017450	TTTTGT	2	12	219180	219191	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017450	TAAAAA	2	12	278482	278493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017450	TTATAA	2	12	304103	304114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017450	TTAGAT	2	12	360401	360412	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017450	CTAAAA	2	12	423022	423033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017450	AGAATA	2	12	436739	436750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017450	TGAAAT	2	12	439045	439056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017450	TAAAAT	2	12	443874	443885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017450	ATTTTT	2	12	444459	444470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017450	AAGTTA	2	12	464455	464466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017450	TTTAAT	2	12	522543	522554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017450	AAATAT	2	12	554415	554426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017450	AAAATC	2	12	562927	562938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017450	TTTTTC	2	12	594785	594796	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017450	AAATAT	2	12	623876	623887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017450	GCTTTA	2	12	624219	624230	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017450	CATAAA	2	12	628745	628756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017450	TTTATA	2	12	664644	664655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017450	ACAAAA	2	12	667952	667963	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017450	TGCTAA	2	12	733551	733562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017450	TTTGAT	2	12	733708	733719	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017450	TGCTAA	2	12	741424	741435	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017450	TTTGAT	2	12	741581	741592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017450	ATATAC	2	12	742924	742935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017450	TTTGAT	2	12	781328	781339	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017450	GTACTT	2	12	797454	797465	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017450	ATATCA	2	12	812696	812707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017450	AGTAAT	2	12	846608	846619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017450	TAATTA	2	12	882223	882234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017450	ATATAA	2	12	901680	901691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017450	TAATCT	2	12	903755	903766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017450	AATCAA	2	12	985018	985029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017450	AATCAA	2	12	998810	998821	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017450	TATTTC	2	12	999969	999980	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017450	AATTAT	2	12	1030347	1030358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017450	AACTAA	2	12	1055796	1055807	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017450	ACTTTA	2	12	1071913	1071924	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017450	TTAGAT	2	12	1071927	1071938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017450	ATAAAT	2	12	1094306	1094317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017450	TATTTT	2	12	1117001	1117012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017450	TATAAG	2	12	1150609	1150620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017450	TATTTA	2	12	1150629	1150640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017450	GATAGT	2	12	1164560	1164571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017450	AAATAT	2	12	1198303	1198314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017450	TATTTT	2	12	1268862	1268873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017450	GACTTA	2	12	1282719	1282730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017450	TTTTAT	2	12	1296546	1296557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017450	TAATTG	2	12	1371325	1371336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017450	ATTTCA	2	12	1373510	1373521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017450	CTTATT	2	12	1375814	1375825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017450	TAACAT	2	12	1448818	1448829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017450	ATTTTT	2	12	1455284	1455295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017450	TATTAC	2	12	1470573	1470584	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017450	CATTAA	2	12	1481082	1481093	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017450	ATACAA	2	12	1486789	1486800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017450	TTTCTT	2	12	1500985	1500996	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017450	AAAATA	2	12	1559477	1559488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017450	TCTCTT	2	12	1587220	1587231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017450	ATATTT	2	12	1625644	1625655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017450	AAAAAC	2	12	1649593	1649604	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017450	AATATA	2	12	1663398	1663409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017450	ATGTGG	2	12	1667111	1667122	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017450	GACTGA	2	12	1789597	1789608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017450	TTATCA	2	12	1799548	1799559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017450	ATTATC	2	12	1805238	1805249	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017450	ATTTCA	2	12	1851487	1851498	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017450	CTTATT	2	12	1853791	1853802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017450	CTTTTT	2	12	1866071	1866082	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017450	AAAAAG	2	12	1891646	1891657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017450	TATATT	2	12	1907792	1907803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.