MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida Fx1 chromosome

Total Repeats: 877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017450	CAAGAT	2	12	865	876	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385791933
2	NC_017450	TATTTC	2	12	2964	2975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385791935
3	NC_017450	CAGGTA	2	12	5148	5159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385791936
4	NC_017450	ATTTAT	2	12	5937	5948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791937
5	NC_017450	GCTACA	2	12	6538	6549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385791938
6	NC_017450	TATAAA	2	12	9527	9538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791943
7	NC_017450	TAATCT	2	12	12787	12798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385791947
8	NC_017450	AGATTA	2	12	15830	15841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385791951
9	NC_017450	TCTAGT	2	12	18590	18601	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385791955
10	NC_017450	TCAGCT	2	12	19404	19415	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385791956
11	NC_017450	CCACTT	2	12	19758	19769	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385791957
12	NC_017450	ATCAAA	2	12	19838	19849	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385791957
13	NC_017450	TATTTT	2	12	20027	20038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385791957
14	NC_017450	CTAAAA	2	12	23529	23540	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385791958
15	NC_017450	TTAGCA	2	12	25178	25189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385791960
16	NC_017450	ATAAGG	2	12	25381	25392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385791960
17	NC_017450	TGTAGC	2	12	25465	25476	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385791960
18	NC_017450	TGGTGA	2	12	26846	26857	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385791961
19	NC_017450	ACCAAT	2	12	26882	26893	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385791961
20	NC_017450	TATCAA	2	12	33922	33933	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385791969
21	NC_017450	TAAATT	2	12	35962	35973	50 %	50 %	0 %	0 %	385791971
22	NC_017450	CTTGAG	2	12	50552	50563	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385791983
23	NC_017450	ATCAAT	2	12	54102	54113	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385791986
24	NC_017450	AATACC	2	12	58893	58904	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385791988
25	NC_017450	CTGATA	2	12	59159	59170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385791988
26	NC_017450	AGCTGG	2	12	63694	63705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385791995
27	NC_017450	AGCCAA	2	12	67038	67049	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385792000
28	NC_017450	ATAATT	2	12	71286	71297	50 %	50 %	0 %	0 %	385792005
29	NC_017450	ATTGAT	2	12	71549	71560	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792005
30	NC_017450	AAGTTT	2	12	77313	77324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792009
31	NC_017450	ATAATT	2	12	79355	79366	50 %	50 %	0 %	0 %	385792012
32	NC_017450	AACAGT	2	12	81051	81062	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385792013
33	NC_017450	AATGGC	2	12	82454	82465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385792014
34	NC_017450	TTAAGG	2	12	83120	83131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792015
35	NC_017450	TAAAAA	2	12	84432	84443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385792017
36	NC_017450	TTATGT	2	12	86195	86206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385792020
37	NC_017450	AAGGAT	2	12	86737	86748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385792020
38	NC_017450	GTTATT	2	12	91248	91259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385792025
39	NC_017450	CTTGAG	2	12	92505	92516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385792026
40	NC_017450	AGCACC	2	12	92551	92562	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385792026
41	NC_017450	TCAATT	2	12	99982	99993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385792034
42	NC_017450	TGGTTT	2	12	108051	108062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792042
43	NC_017450	TAAAGG	2	12	109394	109405	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385792044
44	NC_017450	GTTGAT	2	12	110485	110496	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385792046
45	NC_017450	GTAAAT	2	12	114730	114741	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385792051
46	NC_017450	TTGAGA	2	12	125056	125067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792058
47	NC_017450	TTAGGC	2	12	125913	125924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385792058
48	NC_017450	TAAGTA	2	12	130124	130135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385792064
49	NC_017450	TATTGA	2	12	131790	131801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792066
50	NC_017450	GATCTA	2	12	134096	134107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385792068
51	NC_017450	AAATAT	2	12	136972	136983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792070
52	NC_017450	ACAGGT	2	12	139149	139160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385792073
53	NC_017450	TACAAC	2	12	140959	140970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385792075
54	NC_017450	TCCTTG	2	12	144805	144816	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385792080
55	NC_017450	AGCTAT	2	12	145732	145743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385792081
56	NC_017450	TAAAAG	2	12	149513	149524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385792084
57	NC_017450	AAATAA	2	12	150101	150112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385792085
58	NC_017450	AACTTC	2	12	152045	152056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385792087
59	NC_017450	TTATGA	2	12	154246	154257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792089
60	NC_017450	ATCAAA	2	12	156771	156782	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385792092
61	NC_017450	GTACAG	2	12	156944	156955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385792092
62	NC_017450	CAAAGT	2	12	161276	161287	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385792095
63	NC_017450	AAATGC	2	12	164628	164639	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385792098
64	NC_017450	TTTCAT	2	12	170661	170672	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385792103
65	NC_017450	CAGATA	2	12	172737	172748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385792104
66	NC_017450	ATCGTA	2	12	172959	172970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385792105
67	NC_017450	AAGGTA	2	12	172990	173001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385792105
68	NC_017450	TAATCT	2	12	175307	175318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385792107
69	NC_017450	ATCGCT	2	12	176076	176087	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385792108
70	NC_017450	TTGTGT	2	12	177424	177435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792110
71	NC_017450	GTTGCT	2	12	181092	181103	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385792114
72	NC_017450	TCATTA	2	12	181928	181939	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385792115
73	NC_017450	CAAATT	2	12	190108	190119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385792122
74	NC_017450	TTTTAT	2	12	190797	190808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385792123
75	NC_017450	TTAAGT	2	12	191538	191549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792123
76	NC_017450	ATTATA	2	12	196814	196825	50 %	50 %	0 %	0 %	385792129
77	NC_017450	CACCAA	2	12	198587	198598	50 %	0 %	0 %	50 %	385792131
78	NC_017450	TTTACA	2	12	202289	202300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385792135
79	NC_017450	ACTAGT	2	12	208451	208462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385792142
80	NC_017450	ATTAGT	2	12	214402	214413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792146
81	NC_017450	ATAAGT	2	12	215491	215502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385792147
82	NC_017450	GTTTAA	2	12	215782	215793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792147
83	NC_017450	TAGCTT	2	12	218410	218421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385792150
84	NC_017450	CATCAC	2	12	221669	221680	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385792153
85	NC_017450	TTTTGA	2	12	221682	221693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385792153
86	NC_017450	TAAAAG	2	12	223207	223218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385792155
87	NC_017450	TTATGG	2	12	225620	225631	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385792159
88	NC_017450	TAATCT	2	12	227204	227215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385792160
89	NC_017450	TGAAGC	2	12	229592	229603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385792163
90	NC_017450	AAAGAA	2	12	230697	230708	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385792164
91	NC_017450	AAAAGA	2	12	232179	232190	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385792166
92	NC_017450	TGGTGT	2	12	233208	233219	0 %	50 %	50 %	0 %	385792168
93	NC_017450	GTTTTT	2	12	233908	233919	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385792168
94	NC_017450	TGAAGT	2	12	235700	235711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792172
95	NC_017450	GCAAGA	2	12	236176	236187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385792173
96	NC_017450	CTGTTG	2	12	237258	237269	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385792173
97	NC_017450	AGGTTG	2	12	237867	237878	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385792173
98	NC_017450	TTTGGT	2	12	243785	243796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385792186
99	NC_017450	TGGGTG	2	12	244131	244142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385792187
100	NC_017450	TTGGTG	2	12	245260	245271	0 %	50 %	50 %	0 %	385792189
101	NC_017450	GGTATG	2	12	253794	253805	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385792202
102	NC_017450	TTTGAG	2	12	258180	258191	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385792205
103	NC_017450	ATATTG	2	12	260341	260352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792205
104	NC_017450	AAATGA	2	12	261008	261019	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385792205
105	NC_017450	TATAAT	2	12	261200	261211	50 %	50 %	0 %	0 %	385792206
106	NC_017450	GAGAAA	2	12	261770	261781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385792206
107	NC_017450	AAGAGC	2	12	268413	268424	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385792211
108	NC_017450	AAAGGT	2	12	269153	269164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385792212
109	NC_017450	AGTTAC	2	12	273883	273894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385792216
110	NC_017450	TACCAG	2	12	274414	274425	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385792217
111	NC_017450	ATCAAA	2	12	276335	276346	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385792220
112	NC_017450	AGTATG	2	12	280624	280635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385792225
113	NC_017450	GTAAAG	2	12	282465	282476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385792227
114	NC_017450	TGAATC	2	12	287017	287028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385792232
115	NC_017450	TCATCC	2	12	290469	290480	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385792235
116	NC_017450	GGTGAA	2	12	291197	291208	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385792236
117	NC_017450	TAGGTT	2	12	295775	295786	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385792239
118	NC_017450	TATAGT	2	12	297350	297361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385792241
119	NC_017450	AATATA	2	12	299418	299429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792242
120	NC_017450	TACAAA	2	12	300008	300019	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385792243
121	NC_017450	TAACAA	2	12	300023	300034	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385792243
122	NC_017450	ATTTTG	2	12	300184	300195	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385792243
123	NC_017450	GTCAAG	2	12	301734	301745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385792245
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230	NC_017450	ATATAA	2	12	539526	539537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385792473
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347	NC_017450	TTTACG	2	12	739431	739442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385792648
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462	NC_017450	GACCAG	2	12	949500	949511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385792858
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