MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella cf. novicida Fx1 chromosome

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017450	TTTAG	2	10	7700	7709	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017450	CATTT	2	10	12151	12160	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017450	TTTAG	2	10	13012	13021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017450	TAGCT	2	10	13556	13565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017450	TTGTT	2	10	19684	19693	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017450	TATAT	2	10	25065	25074	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017450	CTGTA	2	10	30918	30927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017450	GATTT	2	10	53399	53408	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017450	TTTTA	2	10	56415	56424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017450	TATAG	2	10	59367	59376	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017450	AATAA	2	10	61208	61217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017450	TCAAG	2	10	66504	66513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017450	CTATA	2	10	70421	70430	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017450	TATTT	2	10	71036	71045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017450	TAGAA	2	10	82575	82584	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017450	AATTT	2	10	85005	85014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017450	TTATT	2	10	85261	85270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017450	GATAA	2	10	89559	89568	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017450	TTGTT	2	10	93934	93943	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017450	GCCCT	2	10	103932	103941	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017450	TTAAC	2	10	107064	107073	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017450	CAACA	2	10	107574	107583	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017450	TAAAC	2	10	108542	108551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017450	CTTAT	2	10	112969	112978	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017450	TAGCT	2	10	119008	119017	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017450	AAAAT	2	10	122159	122168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017450	ATTTT	2	10	139444	139453	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017450	AGATT	2	10	151335	151344	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017450	ATGTA	2	10	153122	153131	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017450	TTATC	2	10	153132	153141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017450	TTTAT	2	10	155225	155234	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017450	TAATG	2	10	155259	155268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017450	TAAAG	2	10	156606	156615	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017450	TTAAG	2	10	190684	190693	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017450	AGATT	2	10	190778	190787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017450	TCTAA	2	10	202719	202728	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017450	AAAAT	2	10	218589	218598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017450	AAAAG	2	10	224091	224100	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017450	TAATA	2	10	238543	238552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017450	ATTTT	2	10	243217	243226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017450	ATTTC	2	10	251933	251942	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017450	AAATG	2	10	279622	279631	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017450	ATGTA	2	10	279787	279796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017450	GTTTA	2	10	284086	284095	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017450	TCATA	2	10	288007	288016	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017450	GTTTT	2	10	288731	288740	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017450	ATCTT	2	10	288828	288837	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017450	AAATA	2	10	288900	288909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017450	GTATT	2	10	293898	293907	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017450	GATTT	2	10	315433	315442	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017450	TAATA	2	10	315535	315544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017450	GTTTG	2	10	321774	321783	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017450	CAATT	2	10	321785	321794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017450	TTTAA	2	10	324215	324224	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017450	AATGA	2	10	324498	324507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017450	TAGAT	2	10	324510	324519	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017450	AAATT	2	10	326465	326474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017450	TATTT	3	15	326714	326728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017450	ATTTA	2	10	338779	338788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017450	AATCT	2	10	343179	343188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017450	GCGAT	2	10	351570	351579	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017450	AATCT	2	10	372872	372881	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017450	ATTTA	2	10	378787	378796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017450	TAGTT	2	10	384725	384734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017450	GATTT	2	10	386803	386812	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017450	CTGTC	2	10	393373	393382	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017450	TTTAT	2	10	395920	395929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017450	AATAA	2	10	402205	402214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017450	ATTAA	2	10	410578	410587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017450	TAACT	2	10	422993	423002	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017450	CTAAA	2	10	426849	426858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017450	GAATA	2	10	436810	436819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017450	TAATT	2	10	441400	441409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017450	TGAAA	2	10	455263	455272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017450	TAATT	2	10	460026	460035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017450	TTTTA	2	10	468995	469004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017450	AGTTA	2	10	469014	469023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017450	TTAAC	2	10	501953	501962	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017450	TTTTC	2	10	543173	543182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017450	AAACT	2	10	562909	562918	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017450	ATTTT	2	10	569538	569547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017450	ATTTA	2	10	573055	573064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017450	TTTAA	2	10	585012	585021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017450	ACAAA	2	10	589280	589289	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017450	CAGTC	2	10	593913	593922	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017450	ATTAT	2	10	597411	597420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017450	TATCT	2	10	599806	599815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017450	TTAAT	2	10	604984	604993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017450	TAAAA	2	10	634144	634153	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017450	TAGTT	2	10	637895	637904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017450	TATAA	2	10	651090	651099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017450	ATCTA	2	10	682534	682543	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017450	ATTTT	2	10	689014	689023	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017450	TATTT	2	10	696068	696077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017450	ATTAT	2	10	696939	696948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017450	TTATT	2	10	697236	697245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017450	TAGTA	2	10	706547	706556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017450	TTAAA	2	10	721476	721485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017450	TATAA	2	10	732445	732454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017450	TATAA	2	10	740318	740327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017450	TTTTG	2	10	749244	749253	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017450	TTATT	2	10	767462	767471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017450	GTTTT	2	10	769346	769355	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017450	TTTTA	2	10	779553	779562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017450	TTGAT	2	10	780961	780970	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017450	ATTTT	2	10	797339	797348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017450	TAATA	2	10	797411	797420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017450	TTAGT	2	10	812797	812806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017450	TGATT	2	10	819231	819240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017450	TATAG	2	10	819578	819587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017450	TCTAA	2	10	819711	819720	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017450	TGTGA	2	10	834041	834050	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017450	AATAA	2	10	834085	834094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017450	TGAAG	2	10	836261	836270	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017450	AGCTA	2	10	839589	839598	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017450	CATGA	2	10	893544	893553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017450	ATTAA	2	10	893572	893581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017450	ACTTA	2	10	898435	898444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017450	AAAAT	2	10	901079	901088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017450	TATTT	2	10	901713	901722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017450	TATTT	2	10	901725	901734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017450	TAAAT	2	10	916265	916274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017450	GTTTT	2	10	926456	926465	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017450	TTTTA	2	10	926632	926641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017450	ATATA	2	10	938533	938542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017450	CTCAT	2	10	938547	938556	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017450	AATAA	2	10	940843	940852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017450	AAATA	2	10	998268	998277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017450	ATATT	2	10	999098	999107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017450	TTAAT	2	10	999349	999358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017450	GTGTA	2	10	1006913	1006922	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017450	TTTGT	2	10	1012223	1012232	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017450	TAGTA	2	10	1031574	1031583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017450	TAAAT	2	10	1064795	1064804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017450	TATAA	2	10	1068646	1068655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017450	CAATA	2	10	1072582	1072591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017450	AAATA	2	10	1076068	1076077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017450	AAAAT	2	10	1076601	1076610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017450	TAATT	2	10	1110578	1110587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017450	CAAAA	2	10	1118742	1118751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017450	AATTA	2	10	1119479	1119488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017450	TTCTA	2	10	1144343	1144352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017450	AAAAT	2	10	1149624	1149633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017450	TTTAA	2	10	1153989	1153998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017450	CAATA	2	10	1158997	1159006	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017450	AAATG	2	10	1165016	1165025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017450	TTCAT	2	10	1166844	1166853	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.