MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida Fx1 chromosome

Total Repeats: 1234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017450	AAGAA	2	10	1325	1334	80 %	0 %	20 %	0 %	385791933
2	NC_017450	TAAAG	2	10	3871	3880	60 %	20 %	20 %	0 %	385791935
3	NC_017450	CATAC	2	10	3958	3967	40 %	20 %	0 %	40 %	385791935
4	NC_017450	AAATG	2	10	5191	5200	60 %	20 %	20 %	0 %	385791936
5	NC_017450	CATTT	2	10	6625	6634	20 %	60 %	0 %	20 %	385791938
6	NC_017450	CTTTT	2	10	8432	8441	0 %	80 %	0 %	20 %	385791941
7	NC_017450	GATTT	2	10	9934	9943	20 %	60 %	20 %	0 %	385791943
8	NC_017450	TATAA	2	10	10428	10437	60 %	40 %	0 %	0 %	385791944
9	NC_017450	TAAAT	2	10	10602	10611	60 %	40 %	0 %	0 %	385791944
10	NC_017450	AACTT	2	10	12906	12915	40 %	40 %	0 %	20 %	385791947
11	NC_017450	ATTTT	2	10	14045	14054	20 %	80 %	0 %	0 %	385791949
12	NC_017450	ATATC	2	10	14117	14126	40 %	40 %	0 %	20 %	385791949
13	NC_017450	ATTTT	2	10	14212	14221	20 %	80 %	0 %	0 %	385791949
14	NC_017450	ATATT	2	10	17429	17438	40 %	60 %	0 %	0 %	385791954
15	NC_017450	ATTTT	2	10	17834	17843	20 %	80 %	0 %	0 %	385791955
16	NC_017450	ATTTG	2	10	17893	17902	20 %	60 %	20 %	0 %	385791955
17	NC_017450	AAAGA	2	10	18611	18620	80 %	0 %	20 %	0 %	385791955
18	NC_017450	TTGTT	2	10	19202	19211	0 %	80 %	20 %	0 %	385791956
19	NC_017450	CATTT	2	10	21634	21643	20 %	60 %	0 %	20 %	385791958
20	NC_017450	ATAGT	2	10	23964	23973	40 %	40 %	20 %	0 %	385791959
21	NC_017450	ATATT	2	10	24108	24117	40 %	60 %	0 %	0 %	385791959
22	NC_017450	AAAAT	2	10	27536	27545	80 %	20 %	0 %	0 %	385791961
23	NC_017450	TCAGC	2	10	27800	27809	20 %	20 %	20 %	40 %	385791962
24	NC_017450	GTTTA	2	10	28227	28236	20 %	60 %	20 %	0 %	385791962
25	NC_017450	TCAAA	2	10	28478	28487	60 %	20 %	0 %	20 %	385791963
26	NC_017450	GAAAA	2	10	30309	30318	80 %	0 %	20 %	0 %	385791964
27	NC_017450	CTTGT	2	10	30382	30391	0 %	60 %	20 %	20 %	385791964
28	NC_017450	AAACA	2	10	30487	30496	80 %	0 %	0 %	20 %	385791964
29	NC_017450	AAATA	2	10	30595	30604	80 %	20 %	0 %	0 %	385791964
30	NC_017450	TTATC	2	10	31206	31215	20 %	60 %	0 %	20 %	385791965
31	NC_017450	TTGAT	2	10	32531	32540	20 %	60 %	20 %	0 %	385791967
32	NC_017450	GTAAA	2	10	32943	32952	60 %	20 %	20 %	0 %	385791968
33	NC_017450	TACAA	2	10	33370	33379	60 %	20 %	0 %	20 %	385791968
34	NC_017450	TCTAA	2	10	33843	33852	40 %	40 %	0 %	20 %	385791969
35	NC_017450	TTTCT	2	10	34362	34371	0 %	80 %	0 %	20 %	385791969
36	NC_017450	TTTTA	2	10	34418	34427	20 %	80 %	0 %	0 %	385791969
37	NC_017450	AATAT	2	10	35098	35107	60 %	40 %	0 %	0 %	385791970
38	NC_017450	AGTTT	2	10	39502	39511	20 %	60 %	20 %	0 %	385791974
39	NC_017450	CTTGT	2	10	43332	43341	0 %	60 %	20 %	20 %	385791977
40	NC_017450	AGTTT	2	10	45265	45274	20 %	60 %	20 %	0 %	385791979
41	NC_017450	GATAA	2	10	46382	46391	60 %	20 %	20 %	0 %	385791980
42	NC_017450	TAAAC	2	10	47236	47245	60 %	20 %	0 %	20 %	385791980
43	NC_017450	CGTAT	2	10	53159	53168	20 %	40 %	20 %	20 %	385791985
44	NC_017450	TTTTC	2	10	54869	54878	0 %	80 %	0 %	20 %	385791986
45	NC_017450	AGATT	2	10	60582	60591	40 %	40 %	20 %	0 %	385791990
46	NC_017450	CTTTT	2	10	62955	62964	0 %	80 %	0 %	20 %	385791994
47	NC_017450	CAACC	2	10	64386	64395	40 %	0 %	0 %	60 %	385791995
48	NC_017450	ATTTT	2	10	65893	65902	20 %	80 %	0 %	0 %	385791998
49	NC_017450	CTAGA	2	10	66333	66342	40 %	20 %	20 %	20 %	385791999
50	NC_017450	GCAAA	2	10	66401	66410	60 %	0 %	20 %	20 %	385791999
51	NC_017450	TACAG	2	10	72691	72700	40 %	20 %	20 %	20 %	385792006
52	NC_017450	TCAAG	2	10	73181	73190	40 %	20 %	20 %	20 %	385792006
53	NC_017450	TTATC	2	10	73698	73707	20 %	60 %	0 %	20 %	385792006
54	NC_017450	TAGTT	2	10	73906	73915	20 %	60 %	20 %	0 %	385792006
55	NC_017450	AAAAT	2	10	74583	74592	80 %	20 %	0 %	0 %	385792006
56	NC_017450	TGTGA	2	10	74969	74978	20 %	40 %	40 %	0 %	385792007
57	NC_017450	AGTTT	2	10	76278	76287	20 %	60 %	20 %	0 %	385792008
58	NC_017450	GCTTT	2	10	76660	76669	0 %	60 %	20 %	20 %	385792008
59	NC_017450	CAAGA	2	10	78591	78600	60 %	0 %	20 %	20 %	385792011
60	NC_017450	TACAA	2	10	78813	78822	60 %	20 %	0 %	20 %	385792011
61	NC_017450	TAGAG	2	10	81120	81129	40 %	20 %	40 %	0 %	385792013
62	NC_017450	ATATT	2	10	83110	83119	40 %	60 %	0 %	0 %	385792015
63	NC_017450	TATTT	2	10	83972	83981	20 %	80 %	0 %	0 %	385792016
64	NC_017450	TACTT	2	10	85546	85555	20 %	60 %	0 %	20 %	385792019
65	NC_017450	TTTGA	2	10	86596	86605	20 %	60 %	20 %	0 %	385792020
66	NC_017450	AGGCT	2	10	87904	87913	20 %	20 %	40 %	20 %	385792022
67	NC_017450	TTCAA	2	10	88100	88109	40 %	40 %	0 %	20 %	385792022
68	NC_017450	AATTT	2	10	91143	91152	40 %	60 %	0 %	0 %	385792025
69	NC_017450	TTTGT	2	10	91422	91431	0 %	80 %	20 %	0 %	385792025
70	NC_017450	ATTTT	2	10	92489	92498	20 %	80 %	0 %	0 %	385792026
71	NC_017450	CTAAA	2	10	94159	94168	60 %	20 %	0 %	20 %	385792027
72	NC_017450	GTTTA	2	10	94936	94945	20 %	60 %	20 %	0 %	385792029
73	NC_017450	TGAAA	2	10	95965	95974	60 %	20 %	20 %	0 %	385792031
74	NC_017450	AAATT	2	10	97969	97978	60 %	40 %	0 %	0 %	385792032
75	NC_017450	TGTAC	2	10	98843	98852	20 %	40 %	20 %	20 %	385792033
76	NC_017450	TTTTA	2	10	103033	103042	20 %	80 %	0 %	0 %	385792038
77	NC_017450	TATTT	2	10	103264	103273	20 %	80 %	0 %	0 %	385792038
78	NC_017450	TGTTT	2	10	109282	109291	0 %	80 %	20 %	0 %	385792044
79	NC_017450	CAAGA	2	10	112268	112277	60 %	0 %	20 %	20 %	385792048
80	NC_017450	ATGCG	2	10	114593	114602	20 %	20 %	40 %	20 %	385792051
81	NC_017450	TTGAT	2	10	115172	115181	20 %	60 %	20 %	0 %	385792051
82	NC_017450	AGGGT	2	10	116689	116698	20 %	20 %	60 %	0 %	385792052
83	NC_017450	AATCA	2	10	117546	117555	60 %	20 %	0 %	20 %	385792052
84	NC_017450	ATGGT	2	10	117580	117589	20 %	40 %	40 %	0 %	385792052
85	NC_017450	TTTGC	2	10	117840	117849	0 %	60 %	20 %	20 %	385792053
86	NC_017450	CGTAC	2	10	117984	117993	20 %	20 %	20 %	40 %	385792053
87	NC_017450	TTCAA	2	10	118355	118364	40 %	40 %	0 %	20 %	385792053
88	NC_017450	ATGCA	2	10	120490	120499	40 %	20 %	20 %	20 %	385792054
89	NC_017450	ATAAA	2	10	122739	122748	80 %	20 %	0 %	0 %	385792056
90	NC_017450	AATAA	2	10	122892	122901	80 %	20 %	0 %	0 %	385792056
91	NC_017450	GGGAT	2	10	126423	126432	20 %	20 %	60 %	0 %	385792058
92	NC_017450	TTGAT	2	10	126475	126484	20 %	60 %	20 %	0 %	385792058
93	NC_017450	AAATT	2	10	128480	128489	60 %	40 %	0 %	0 %	385792061
94	NC_017450	TTTAG	2	10	128999	129008	20 %	60 %	20 %	0 %	385792062
95	NC_017450	TTATT	2	10	130253	130262	20 %	80 %	0 %	0 %	385792064
96	NC_017450	TATTT	2	10	132004	132013	20 %	80 %	0 %	0 %	385792066
97	NC_017450	AGATG	2	10	133270	133279	40 %	20 %	40 %	0 %	385792067
98	NC_017450	CTTGC	2	10	140503	140512	0 %	40 %	20 %	40 %	385792075
99	NC_017450	TATAT	2	10	141311	141320	40 %	60 %	0 %	0 %	385792076
100	NC_017450	ATTTT	2	10	145623	145632	20 %	80 %	0 %	0 %	385792081
101	NC_017450	TAAAT	2	10	148310	148319	60 %	40 %	0 %	0 %	385792082
102	NC_017450	TTTAC	2	10	149332	149341	20 %	60 %	0 %	20 %	385792084
103	NC_017450	TAGTT	2	10	151026	151035	20 %	60 %	20 %	0 %	385792086
104	NC_017450	CTTCT	2	10	151491	151500	0 %	60 %	0 %	40 %	385792087
105	NC_017450	TGATC	2	10	151916	151925	20 %	40 %	20 %	20 %	385792087
106	NC_017450	TTAAC	2	10	152146	152155	40 %	40 %	0 %	20 %	385792087
107	NC_017450	TAGCA	2	10	152477	152486	40 %	20 %	20 %	20 %	385792087
108	NC_017450	CAAAG	2	10	154939	154948	60 %	0 %	20 %	20 %	385792090
109	NC_017450	TAAGT	2	10	156579	156588	40 %	40 %	20 %	0 %	385792091
110	NC_017450	AAGAA	2	10	161956	161965	80 %	0 %	20 %	0 %	385792096
111	NC_017450	GTATG	2	10	163303	163312	20 %	40 %	40 %	0 %	385792096
112	NC_017450	AAATC	2	10	164785	164794	60 %	20 %	0 %	20 %	385792098
113	NC_017450	TAAAA	2	10	164826	164835	80 %	20 %	0 %	0 %	385792098
114	NC_017450	ATTCT	2	10	165612	165621	20 %	60 %	0 %	20 %	385792099
115	NC_017450	AAACT	2	10	165669	165678	60 %	20 %	0 %	20 %	385792099
116	NC_017450	TCCAG	2	10	168197	168206	20 %	20 %	20 %	40 %	385792101
117	NC_017450	TGCTT	2	10	168415	168424	0 %	60 %	20 %	20 %	385792101
118	NC_017450	TTTGT	2	10	168549	168558	0 %	80 %	20 %	0 %	385792101
119	NC_017450	ATTGA	2	10	168844	168853	40 %	40 %	20 %	0 %	385792101
120	NC_017450	AACCA	2	10	169228	169237	60 %	0 %	0 %	40 %	385792102
121	NC_017450	ATTTG	2	10	171523	171532	20 %	60 %	20 %	0 %	385792104
122	NC_017450	GCATC	2	10	172506	172515	20 %	20 %	20 %	40 %	385792104
123	NC_017450	ATTTT	2	10	177788	177797	20 %	80 %	0 %	0 %	385792110
124	NC_017450	CTTAT	2	10	181683	181692	20 %	60 %	0 %	20 %	385792115
125	NC_017450	GGCAG	2	10	184705	184714	20 %	0 %	60 %	20 %	385792117
126	NC_017450	AGCAA	2	10	185549	185558	60 %	0 %	20 %	20 %	385792118
127	NC_017450	TTTAT	2	10	185807	185816	20 %	80 %	0 %	0 %	385792118
128	NC_017450	ATACG	2	10	186371	186380	40 %	20 %	20 %	20 %	385792118
129	NC_017450	TAAAG	2	10	187612	187621	60 %	20 %	20 %	0 %	385792121
130	NC_017450	AGCTA	2	10	187843	187852	40 %	20 %	20 %	20 %	385792121
131	NC_017450	AATCT	2	10	194342	194351	40 %	40 %	0 %	20 %	385792126
132	NC_017450	TTTGG	2	10	195739	195748	0 %	60 %	40 %	0 %	385792127
133	NC_017450	GTTTG	2	10	198779	198788	0 %	60 %	40 %	0 %	385792131
134	NC_017450	AGATA	2	10	199877	199886	60 %	20 %	20 %	0 %	385792132
135	NC_017450	ATACT	2	10	200843	200852	40 %	40 %	0 %	20 %	385792134
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