MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida Fx1 chromosome

Total Repeats: 25845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017450	CAA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791933
2	NC_017450	ATT	2	6	352	357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791933
3	NC_017450	TAA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791933
4	NC_017450	CAA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791933
5	NC_017450	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
6	NC_017450	AGT	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791933
7	NC_017450	AAG	2	6	502	507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
8	NC_017450	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791933
9	NC_017450	TGA	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791933
10	NC_017450	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
11	NC_017450	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385791933
12	NC_017450	AGC	3	9	669	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791933
13	NC_017450	TGG	2	6	729	734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385791933
14	NC_017450	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791933
15	NC_017450	TTA	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791933
16	NC_017450	TTC	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791933
17	NC_017450	GAT	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791933
18	NC_017450	GAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
19	NC_017450	CAG	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791933
20	NC_017450	TAC	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791933
21	NC_017450	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791933
22	NC_017450	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791933
23	NC_017450	GTT	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385791933
24	NC_017450	AAG	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791933
25	NC_017450	TGG	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385791933
26	NC_017450	GAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791933
27	NC_017450	TAT	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791934
28	NC_017450	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
29	NC_017450	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
30	NC_017450	CAA	2	6	2050	2055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791934
31	NC_017450	TCA	2	6	2061	2066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791934
32	NC_017450	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791934
33	NC_017450	ATG	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791934
34	NC_017450	CTA	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791934
35	NC_017450	AGA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791934
36	NC_017450	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
37	NC_017450	ATT	2	6	2460	2465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791934
38	NC_017450	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
39	NC_017450	GAA	2	6	2659	2664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791934
40	NC_017450	ATA	2	6	2723	2728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791934
41	NC_017450	ATC	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791934
42	NC_017450	AGT	3	9	2878	2886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791935
43	NC_017450	TAA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
44	NC_017450	CAC	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791935
45	NC_017450	TGA	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791935
46	NC_017450	ATA	2	6	3080	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
47	NC_017450	ACC	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791935
48	NC_017450	GAA	2	6	3185	3190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791935
49	NC_017450	TAT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791935
50	NC_017450	AAT	2	6	3252	3257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
51	NC_017450	ATG	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791935
52	NC_017450	TAA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
53	NC_017450	ATT	2	6	3340	3345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791935
54	NC_017450	TGA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791935
55	NC_017450	AAT	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
56	NC_017450	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791935
57	NC_017450	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
58	NC_017450	GAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791935
59	NC_017450	TTA	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791935
60	NC_017450	GCT	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385791935
61	NC_017450	CCA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791935
62	NC_017450	CCA	2	6	3665	3670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791935
63	NC_017450	TAA	2	6	3781	3786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
64	NC_017450	AAT	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
65	NC_017450	AGA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791935
66	NC_017450	TAA	2	6	3858	3863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791935
67	NC_017450	TTG	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385791935
68	NC_017450	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791935
69	NC_017450	TTA	2	6	4330	4335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791936
70	NC_017450	AGC	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791936
71	NC_017450	AGC	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791936
72	NC_017450	TAT	2	6	4413	4418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791936
73	NC_017450	CAA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791936
74	NC_017450	ATT	2	6	4450	4455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791936
75	NC_017450	TAA	2	6	4711	4716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791936
76	NC_017450	ATA	2	6	4763	4768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791936
77	NC_017450	AGC	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791936
78	NC_017450	GTA	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791936
79	NC_017450	GCT	2	6	4898	4903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385791936
80	NC_017450	CAG	2	6	4911	4916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791936
81	NC_017450	TAC	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791936
82	NC_017450	TGG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385791936
83	NC_017450	CTA	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791936
84	NC_017450	CTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791936
85	NC_017450	ACA	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791936
86	NC_017450	AGA	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791936
87	NC_017450	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791936
88	NC_017450	TCA	2	6	5609	5614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791936
89	NC_017450	CTT	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791936
90	NC_017450	ATC	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791937
91	NC_017450	TGC	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385791937
92	NC_017450	TAA	2	6	5890	5895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791937
93	NC_017450	ACA	2	6	5930	5935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791937
94	NC_017450	CAT	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791937
95	NC_017450	GTT	3	9	6172	6180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385791937
96	NC_017450	TTC	2	6	6184	6189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791937
97	NC_017450	ATT	2	6	6314	6319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791938
98	NC_017450	TTG	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385791938
99	NC_017450	GCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791938
100	NC_017450	TTA	2	6	6379	6384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791938
101	NC_017450	AGC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791938
102	NC_017450	AAT	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791938
103	NC_017450	ACT	2	6	6469	6474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791938
104	NC_017450	TAA	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791938
105	NC_017450	AAG	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791939
106	NC_017450	GAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791939
107	NC_017450	TAA	2	6	7004	7009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791939
108	NC_017450	AAT	2	6	7055	7060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791939
109	NC_017450	ATA	2	6	7189	7194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791939
110	NC_017450	AAT	2	6	7272	7277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791939
111	NC_017450	ACA	2	6	7278	7283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791939
112	NC_017450	TAG	2	6	7366	7371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791939
113	NC_017450	ATA	2	6	7461	7466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791939
114	NC_017450	CTT	2	6	7522	7527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791939
115	NC_017450	AGA	2	6	7572	7577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385791939
116	NC_017450	ATA	2	6	7733	7738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791940
117	NC_017450	ATT	2	6	7890	7895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791940
118	NC_017450	CTT	2	6	8383	8388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791941
119	NC_017450	ATC	2	6	8502	8507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791941
120	NC_017450	AGT	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791941
121	NC_017450	TTA	2	6	8752	8757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791941
122	NC_017450	TGC	2	6	9095	9100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385791942
123	NC_017450	TCA	2	6	9110	9115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791942
124	NC_017450	TAT	2	6	9156	9161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791942
125	NC_017450	TCT	2	6	9167	9172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385791942
126	NC_017450	TAA	2	6	9571	9576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791943
127	NC_017450	AGC	2	6	9585	9590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385791943
128	NC_017450	ACA	2	6	9594	9599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791943
129	NC_017450	ATA	2	6	9616	9621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791943
130	NC_017450	TAA	2	6	9715	9720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791943
131	NC_017450	GGA	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385791943
132	NC_017450	ATC	2	6	9836	9841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791943
133	NC_017450	TCC	2	6	9852	9857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385791943
134	NC_017450	TAT	2	6	9860	9865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791943
135	NC_017450	AAT	2	6	10047	10052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791944
136	NC_017450	TTA	2	6	10108	10113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791944
137	NC_017450	AAT	2	6	10139	10144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791944
138	NC_017450	TAC	2	6	10248	10253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791944
139	NC_017450	ATA	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791944
140	NC_017450	TAC	2	6	10289	10294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791944
141	NC_017450	TAA	2	6	10347	10352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791944
142	NC_017450	ATA	2	6	10362	10367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791944
143	NC_017450	ATT	2	6	10386	10391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791944
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145	NC_017450	ATA	2	6	10445	10450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791944
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147	NC_017450	ATC	2	6	10491	10496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791944
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151	NC_017450	TAT	2	6	10845	10850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791944
152	NC_017450	ATA	2	6	10909	10914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791944
153	NC_017450	CAA	2	6	11006	11011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385791944
154	NC_017450	GTA	2	6	11116	11121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791945
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157	NC_017450	ATC	2	6	11365	11370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791945
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159	NC_017450	TAA	2	6	11422	11427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791945
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161	NC_017450	TAA	2	6	11650	11655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791945
162	NC_017450	CAT	2	6	11688	11693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791945
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164	NC_017450	CAT	2	6	11751	11756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385791945
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171	NC_017450	TAA	2	6	12592	12597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791947
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250	NC_017450	TAT	2	6	19247	19252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385791956
251	NC_017450	TAG	2	6	19322	19327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385791956
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256	NC_017450	AAT	2	6	20234	20239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385791957
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272	NC_017450	ACC	2	6	21592	21597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385791958
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