MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 4546

< Previous12345678910Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017449	CACT	2	8	1928165	1928172	25 %	25 %	0 %	50 %	387825418
4502	NC_017449	TAAA	2	8	1928235	1928242	75 %	25 %	0 %	0 %	387825418
4503	NC_017449	TTAC	2	8	1928263	1928270	25 %	50 %	0 %	25 %	387825419
4504	NC_017449	TCAA	2	8	1929142	1929149	50 %	25 %	0 %	25 %	387825421
4505	NC_017449	CAAA	2	8	1929414	1929421	75 %	0 %	0 %	25 %	387825421
4506	NC_017449	AAAT	2	8	1929608	1929615	75 %	25 %	0 %	0 %	387825422
4507	NC_017449	ATAA	2	8	1930257	1930264	75 %	25 %	0 %	0 %	387825422
4508	NC_017449	GATT	2	8	1930627	1930634	25 %	50 %	25 %	0 %	387825423
4509	NC_017449	ATAG	2	8	1930640	1930647	50 %	25 %	25 %	0 %	387825423
4510	NC_017449	ATTA	2	8	1931122	1931129	50 %	50 %	0 %	0 %	387825423
4511	NC_017449	TTGA	2	8	1931188	1931195	25 %	50 %	25 %	0 %	387825423
4512	NC_017449	TTTA	2	8	1932124	1932131	25 %	75 %	0 %	0 %	387825425
4513	NC_017449	TTTA	2	8	1932219	1932226	25 %	75 %	0 %	0 %	387825425
4514	NC_017449	TGGC	2	8	1932709	1932716	0 %	25 %	50 %	25 %	387825425
4515	NC_017449	ATTT	2	8	1933300	1933307	25 %	75 %	0 %	0 %	387825426
4516	NC_017449	GATT	2	8	1933748	1933755	25 %	50 %	25 %	0 %	387825426
4517	NC_017449	TAAA	2	8	1933927	1933934	75 %	25 %	0 %	0 %	387825426
4518	NC_017449	ATCT	2	8	1934782	1934789	25 %	50 %	0 %	25 %	387825426
4519	NC_017449	AAAT	2	8	1934942	1934949	75 %	25 %	0 %	0 %	387825426
4520	NC_017449	TCTA	2	8	1935101	1935108	25 %	50 %	0 %	25 %	387825426
4521	NC_017449	CTGT	2	8	1935220	1935227	0 %	50 %	25 %	25 %	387825426
4522	NC_017449	AAGA	2	8	1935982	1935989	75 %	0 %	25 %	0 %	387825427
4523	NC_017449	AAAT	2	8	1937344	1937351	75 %	25 %	0 %	0 %	387825428
4524	NC_017449	CTTT	2	8	1937456	1937463	0 %	75 %	0 %	25 %	387825428
4525	NC_017449	TATT	2	8	1937587	1937594	25 %	75 %	0 %	0 %	387825429
4526	NC_017449	TACT	2	8	1938094	1938101	25 %	50 %	0 %	25 %	387825430
4527	NC_017449	TGAT	2	8	1938314	1938321	25 %	50 %	25 %	0 %	387825430
4528	NC_017449	ATTA	2	8	1939904	1939911	50 %	50 %	0 %	0 %	387825433
4529	NC_017449	TTTG	2	8	1940115	1940122	0 %	75 %	25 %	0 %	387825433
4530	NC_017449	ATTT	2	8	1940315	1940322	25 %	75 %	0 %	0 %	387825433
4531	NC_017449	CTTT	2	8	1940472	1940479	0 %	75 %	0 %	25 %	387825433
4532	NC_017449	ATTT	2	8	1940977	1940984	25 %	75 %	0 %	0 %	387825434
4533	NC_017449	TATC	2	8	1941488	1941495	25 %	50 %	0 %	25 %	387825435
4534	NC_017449	ATTT	2	8	1942149	1942156	25 %	75 %	0 %	0 %	387825435
4535	NC_017449	ACTG	2	8	1942283	1942290	25 %	25 %	25 %	25 %	387825435
4536	NC_017449	TATC	2	8	1942521	1942528	25 %	50 %	0 %	25 %	387825435
4537	NC_017449	ATTT	2	8	1942584	1942591	25 %	75 %	0 %	0 %	387825435
4538	NC_017449	TTCT	2	8	1942842	1942849	0 %	75 %	0 %	25 %	387825436
4539	NC_017449	ATTA	2	8	1942917	1942924	50 %	50 %	0 %	0 %	387825436
4540	NC_017449	ATTG	2	8	1943498	1943505	25 %	50 %	25 %	0 %	387825437
4541	NC_017449	TTCT	2	8	1943850	1943857	0 %	75 %	0 %	25 %	387825437
4542	NC_017449	TGAT	2	8	1943886	1943893	25 %	50 %	25 %	0 %	387825437
4543	NC_017449	TTTA	2	8	1944117	1944124	25 %	75 %	0 %	0 %	387825437
4544	NC_017449	CTTT	2	8	1944622	1944629	0 %	75 %	0 %	25 %	387825437
4545	NC_017449	ATTT	2	8	1944668	1944675	25 %	75 %	0 %	0 %	387825437
4546	NC_017449	ATTT	2	8	1944932	1944939	25 %	75 %	0 %	0 %	387825437

< Previous12345678910Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.