MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017448	ATTTTT	2	12	19300	19311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017448	GGGCTT	2	12	26318	26329	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017448	GTCTTC	2	12	26644	26655	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017448	ATAAAG	2	12	37450	37461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017448	ATAAGA	2	12	46489	46500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017448	GCGGAC	2	12	47200	47211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017448	TTCGGT	2	12	48698	48709	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017448	TGGCGA	2	12	51374	51385	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017448	TTTGAA	2	12	141172	141183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017448	GGATTC	2	12	151158	151169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017448	ATGCCG	2	12	178826	178837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017448	TTTCTT	2	12	179223	179234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017448	AAGGCA	2	12	225385	225396	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017448	TTATCT	2	12	256704	256715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017448	TTGTTT	2	12	264068	264079	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017448	TGTTTT	2	12	264122	264133	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017448	ATGGTC	2	12	267093	267104	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017448	TTCACC	2	12	311386	311397	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017448	ACGGCA	2	12	332314	332325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017448	CAAAAA	2	12	351187	351198	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017448	TTTCAT	2	12	382629	382640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017448	CTTTTT	2	12	464801	464812	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017448	GAGCAC	2	12	494295	494306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017448	AAAAGA	2	12	501438	501449	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017448	AGTTAG	2	12	526752	526763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017448	CATCGG	2	12	543750	543761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017448	TGGACG	2	12	543911	543922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017448	CGAGCA	2	12	552298	552309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017448	ACGCAC	2	12	572399	572410	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017448	ATCGCG	2	12	573948	573959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017448	GCATAC	2	12	597091	597102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017448	ATTCCG	2	12	637130	637141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017448	TTTTGC	2	12	638713	638724	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017448	CATTTT	2	12	649892	649903	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017448	AAAATA	2	12	665445	665456	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017448	TTGGCA	2	12	681644	681655	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017448	TTTCAA	2	12	700133	700144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017448	ACAAAA	2	12	717782	717793	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017448	CCAAAC	2	12	718168	718179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017448	GTTTTT	2	12	741639	741650	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017448	TTGTAC	2	12	752827	752838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017448	TTATCT	2	12	790221	790232	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017448	GCCAAA	2	12	792015	792026	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017448	GTTCCG	2	12	796385	796396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017448	CCTTCG	2	12	843984	843995	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017448	CAGAAC	2	12	901247	901258	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017448	AGCAAA	2	12	980937	980948	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017448	TACGAA	2	12	1060168	1060179	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017448	ACAGAA	2	12	1072398	1072409	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017448	CATTGT	2	12	1079212	1079223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017448	TCCTTG	2	12	1080578	1080589	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017448	CGAGGA	2	12	1124004	1124015	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017448	ACCCTC	2	12	1126539	1126550	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017448	TCATAA	2	12	1127881	1127892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017448	AAACGA	2	12	1127946	1127957	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017448	CAAGCA	2	12	1165948	1165959	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017448	GCCCCG	2	12	1208814	1208825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017448	CCCGGG	2	12	1228950	1228961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017448	TCGCTT	2	12	1231414	1231425	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017448	AAAGCG	2	12	1307011	1307022	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017448	GTTCCC	2	12	1315058	1315069	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017448	ATCAAG	2	12	1319515	1319526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017448	CAAAAC	2	12	1342849	1342860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017448	AATAAA	2	12	1345118	1345129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017448	TTTCGC	2	12	1347397	1347408	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017448	GAAGCC	2	12	1351343	1351354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017448	CGTGAA	2	12	1351721	1351732	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017448	ATCTTC	2	12	1352209	1352220	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017448	CCTTTG	2	12	1360466	1360477	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017448	CAGCGA	2	12	1371115	1371126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017448	TTCAAA	2	12	1371387	1371398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017448	ACTATA	2	12	1372330	1372341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017448	CATCCG	2	12	1373215	1373226	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017448	AGCGGA	2	12	1373796	1373807	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017448	AAATCA	2	12	1376176	1376187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017448	TTACAC	2	12	1376792	1376803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017448	TGGGGC	2	12	1380517	1380528	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017448	AGCGAA	2	12	1384192	1384203	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017448	AGCCTT	2	12	1417017	1417028	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017448	TTGCAT	2	12	1431691	1431702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017448	CTTGAG	2	12	1436885	1436896	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017448	ACTTCG	2	12	1438848	1438859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017448	TCTTTT	2	12	1439189	1439200	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017448	CGTCTA	2	12	1450981	1450992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017448	GCCGAA	2	12	1470341	1470352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017448	TCGAAG	2	12	1470460	1470471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017448	CGGGGC	2	12	1480866	1480877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017448	TCTCGG	2	12	1488956	1488967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017448	CAGCTT	2	12	1497123	1497134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017448	ATTCTT	2	12	1514793	1514804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017448	TATAAA	2	12	1518860	1518871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017448	TTCCTG	2	12	1573823	1573834	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017448	ATCGGC	2	12	1574465	1574476	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017448	TTATAT	2	12	1574746	1574757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017448	AAGTTA	2	12	1594340	1594351	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017448	ATAAAT	2	12	1597254	1597265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017448	TTCGGC	2	12	1602910	1602921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017448	TTATGT	2	12	1608852	1608863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017448	CTATTT	2	12	1611519	1611530	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017448	GCGCAA	2	12	1616056	1616067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017448	ACAATA	2	12	1639343	1639354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017448	CTTCGC	2	12	1703165	1703176	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017448	GCTTTT	2	12	1723268	1723279	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017448	TCGGGG	2	12	1723550	1723561	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017448	AAAACG	2	12	1738182	1738193	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017448	TTTTCA	2	12	1746562	1746573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017448	TTCGCT	2	12	1754343	1754354	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017448	CGTACA	2	12	1757902	1757913	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017448	ATTCAA	2	12	1781327	1781338	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017448	TGGCTT	2	12	1788655	1788666	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017448	AACAAA	2	12	1803925	1803936	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017448	TTCGTA	2	12	1811672	1811683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017448	ACATAC	2	12	1823981	1823992	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017448	TGTTAA	2	12	1832097	1832108	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017448	TTACCA	2	12	1838463	1838474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017448	TTTCTT	2	12	1844831	1844842	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017448	GCAGGC	2	12	1874575	1874586	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017448	ACCGCG	2	12	1906136	1906147	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017448	ATGTTA	2	12	1974379	1974390	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017448	ACCGGA	2	12	1980409	1980420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017448	CAAAAA	2	12	1987350	1987361	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017448	AAGAAA	2	12	1993972	1993983	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017448	CAGTCG	2	12	2006032	2006043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017448	TAAAAT	2	12	2048620	2048631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017448	TACGCT	2	12	2071513	2071524	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017448	GTGCTC	2	12	2078939	2078950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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129	NC_017448	CGAAAC	2	12	2120413	2120424	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017448	TGGTCG	2	12	2139323	2139334	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017448	TAAAAA	2	12	2143216	2143227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017448	ATTTTG	2	12	2151716	2151727	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.