MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 1830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017448	GAAGT	2	10	2734	2743	40 %	20 %	40 %	0 %	385789062
2	NC_017448	CGGAA	2	10	3522	3531	40 %	0 %	40 %	20 %	385789062
3	NC_017448	TGAAA	2	10	4088	4097	60 %	20 %	20 %	0 %	385789063
4	NC_017448	ACGCT	2	10	7677	7686	20 %	20 %	20 %	40 %	385789065
5	NC_017448	AATAA	2	10	15738	15747	80 %	20 %	0 %	0 %	385789072
6	NC_017448	CTATC	2	10	15914	15923	20 %	40 %	0 %	40 %	385789072
7	NC_017448	CTGAA	2	10	18233	18242	40 %	20 %	20 %	20 %	385789073
8	NC_017448	GCATT	2	10	19358	19367	20 %	40 %	20 %	20 %	385789074
9	NC_017448	AATGA	2	10	21794	21803	60 %	20 %	20 %	0 %	385789076
10	NC_017448	GTTGG	2	10	24538	24547	0 %	40 %	60 %	0 %	385789079
11	NC_017448	CGGCG	2	10	25505	25514	0 %	0 %	60 %	40 %	385789080
12	NC_017448	GTTCG	2	10	26118	26127	0 %	40 %	40 %	20 %	385789080
13	NC_017448	AGCGG	2	10	30530	30539	20 %	0 %	60 %	20 %	385789085
14	NC_017448	GCACT	2	10	31097	31106	20 %	20 %	20 %	40 %	385789085
15	NC_017448	TTGTT	2	10	36391	36400	0 %	80 %	20 %	0 %	385789090
16	NC_017448	CATAC	2	10	37888	37897	40 %	20 %	0 %	40 %	385789091
17	NC_017448	CAAAG	2	10	37944	37953	60 %	0 %	20 %	20 %	385789091
18	NC_017448	GCTGC	2	10	40377	40386	0 %	20 %	40 %	40 %	385789096
19	NC_017448	CCGTT	2	10	42906	42915	0 %	40 %	20 %	40 %	385789098
20	NC_017448	ATTCA	2	10	44047	44056	40 %	40 %	0 %	20 %	385789099
21	NC_017448	TGGAA	2	10	45590	45599	40 %	20 %	40 %	0 %	385789101
22	NC_017448	TCTTT	2	10	49653	49662	0 %	80 %	0 %	20 %	385789102
23	NC_017448	GAAAA	2	10	55213	55222	80 %	0 %	20 %	0 %	385789104
24	NC_017448	GACGT	2	10	56684	56693	20 %	20 %	40 %	20 %	385789106
25	NC_017448	TCGCT	2	10	57018	57027	0 %	40 %	20 %	40 %	385789106
26	NC_017448	GCTTG	2	10	58382	58391	0 %	40 %	40 %	20 %	385789106
27	NC_017448	TTTGA	2	10	58787	58796	20 %	60 %	20 %	0 %	385789106
28	NC_017448	GAATG	2	10	58835	58844	40 %	20 %	40 %	0 %	385789106
29	NC_017448	AGACC	2	10	60706	60715	40 %	0 %	20 %	40 %	385789108
30	NC_017448	AGCGC	2	10	60861	60870	20 %	0 %	40 %	40 %	385789108
31	NC_017448	CGAAT	2	10	63040	63049	40 %	20 %	20 %	20 %	385789109
32	NC_017448	GCGTT	2	10	65113	65122	0 %	40 %	40 %	20 %	385789110
33	NC_017448	TTCGA	2	10	65956	65965	20 %	40 %	20 %	20 %	385789111
34	NC_017448	CAGGC	2	10	69402	69411	20 %	0 %	40 %	40 %	385789114
35	NC_017448	GGTCA	2	10	69659	69668	20 %	20 %	40 %	20 %	385789114
36	NC_017448	GCTCT	2	10	69891	69900	0 %	40 %	20 %	40 %	385789115
37	NC_017448	TTGGC	2	10	70915	70924	0 %	40 %	40 %	20 %	385789117
38	NC_017448	GCTTG	2	10	70974	70983	0 %	40 %	40 %	20 %	385789117
39	NC_017448	TGAAT	2	10	78160	78169	40 %	40 %	20 %	0 %	385789122
40	NC_017448	TTGCC	2	10	81560	81569	0 %	40 %	20 %	40 %	385789124
41	NC_017448	TGCGG	2	10	81735	81744	0 %	20 %	60 %	20 %	385789124
42	NC_017448	CCAAA	2	10	87560	87569	60 %	0 %	0 %	40 %	385789128
43	NC_017448	AATAA	2	10	87730	87739	80 %	20 %	0 %	0 %	385789128
44	NC_017448	TTTGC	2	10	89629	89638	0 %	60 %	20 %	20 %	385789129
45	NC_017448	AGCGG	2	10	89925	89934	20 %	0 %	60 %	20 %	385789129
46	NC_017448	ACCAA	2	10	90193	90202	60 %	0 %	0 %	40 %	385789129
47	NC_017448	CGTGG	2	10	90433	90442	0 %	20 %	60 %	20 %	385789130
48	NC_017448	TGTTT	2	10	94287	94296	0 %	80 %	20 %	0 %	385789133
49	NC_017448	GGCAA	2	10	94592	94601	40 %	0 %	40 %	20 %	385789134
50	NC_017448	TCGCT	2	10	95436	95445	0 %	40 %	20 %	40 %	385789135
51	NC_017448	TAGAA	2	10	101263	101272	60 %	20 %	20 %	0 %	385789136
52	NC_017448	CGGTG	2	10	110064	110073	0 %	20 %	60 %	20 %	385789145
53	NC_017448	ATCGC	2	10	111316	111325	20 %	20 %	20 %	40 %	385789146
54	NC_017448	TGTGG	2	10	113441	113450	0 %	40 %	60 %	0 %	385789148
55	NC_017448	ACTTC	2	10	113536	113545	20 %	40 %	0 %	40 %	385789149
56	NC_017448	CCAAT	2	10	114303	114312	40 %	20 %	0 %	40 %	385789150
57	NC_017448	GCTCA	2	10	123242	123251	20 %	20 %	20 %	40 %	385789157
58	NC_017448	TTCCG	2	10	123333	123342	0 %	40 %	20 %	40 %	385789157
59	NC_017448	AAGCT	2	10	124074	124083	40 %	20 %	20 %	20 %	385789157
60	NC_017448	CGTGT	2	10	126447	126456	0 %	40 %	40 %	20 %	385789159
61	NC_017448	GGAGC	2	10	128527	128536	20 %	0 %	60 %	20 %	385789160
62	NC_017448	CTTGA	2	10	135097	135106	20 %	40 %	20 %	20 %	385789164
63	NC_017448	CCACT	2	10	136206	136215	20 %	20 %	0 %	60 %	385789165
64	NC_017448	TATTT	2	10	138195	138204	20 %	80 %	0 %	0 %	385789167
65	NC_017448	GGTCG	2	10	145650	145659	0 %	20 %	60 %	20 %	385789173
66	NC_017448	AAAAG	2	10	146216	146225	80 %	0 %	20 %	0 %	385789174
67	NC_017448	GTCAA	2	10	147058	147067	40 %	20 %	20 %	20 %	385789175
68	NC_017448	CATTC	2	10	147164	147173	20 %	40 %	0 %	40 %	385789175
69	NC_017448	TGAGA	2	10	147288	147297	40 %	20 %	40 %	0 %	385789175
70	NC_017448	TGTTC	2	10	154283	154292	0 %	60 %	20 %	20 %	385789177
71	NC_017448	TAAAA	3	15	155572	155586	80 %	20 %	0 %	0 %	385789179
72	NC_017448	GCCTT	2	10	156437	156446	0 %	40 %	20 %	40 %	385789180
73	NC_017448	CTTGC	2	10	157435	157444	0 %	40 %	20 %	40 %	385789180
74	NC_017448	TGCTT	2	10	161038	161047	0 %	60 %	20 %	20 %	385789181
75	NC_017448	TCGCT	2	10	162764	162773	0 %	40 %	20 %	40 %	385789184
76	NC_017448	ACTGT	2	10	164081	164090	20 %	40 %	20 %	20 %	385789185
77	NC_017448	TGATG	2	10	165068	165077	20 %	40 %	40 %	0 %	385789186
78	NC_017448	AATTC	2	10	167387	167396	40 %	40 %	0 %	20 %	385789187
79	NC_017448	GCTGC	2	10	168541	168550	0 %	20 %	40 %	40 %	385789187
80	NC_017448	CTTGA	2	10	168584	168593	20 %	40 %	20 %	20 %	385789187
81	NC_017448	ATAGC	2	10	172290	172299	40 %	20 %	20 %	20 %	385789190
82	NC_017448	GCTCA	2	10	175771	175780	20 %	20 %	20 %	40 %	385789195
83	NC_017448	AAGCG	2	10	178113	178122	40 %	0 %	40 %	20 %	385789196
84	NC_017448	CGCTC	2	10	183092	183101	0 %	20 %	20 %	60 %	385789198
85	NC_017448	GTGCA	2	10	183727	183736	20 %	20 %	40 %	20 %	385789198
86	NC_017448	TGGGG	2	10	184835	184844	0 %	20 %	80 %	0 %	385789199
87	NC_017448	GGAAT	2	10	185529	185538	40 %	20 %	40 %	0 %	385789200
88	NC_017448	TTTAT	2	10	189176	189185	20 %	80 %	0 %	0 %	385789202
89	NC_017448	TTCGC	2	10	189947	189956	0 %	40 %	20 %	40 %	385789203
90	NC_017448	TGACG	2	10	193988	193997	20 %	20 %	40 %	20 %	385789207
91	NC_017448	GCGCA	2	10	194383	194392	20 %	0 %	40 %	40 %	385789207
92	NC_017448	ATCCG	2	10	195192	195201	20 %	20 %	20 %	40 %	385789208
93	NC_017448	GCTTT	2	10	195488	195497	0 %	60 %	20 %	20 %	385789209
94	NC_017448	TGGGG	2	10	197968	197977	0 %	20 %	80 %	0 %	385789211
95	NC_017448	TGATG	2	10	198667	198676	20 %	40 %	40 %	0 %	385789212
96	NC_017448	GCTTG	2	10	200119	200128	0 %	40 %	40 %	20 %	385789213
97	NC_017448	CAATT	2	10	200764	200773	40 %	40 %	0 %	20 %	385789214
98	NC_017448	TCGAT	2	10	206172	206181	20 %	40 %	20 %	20 %	385789217
99	NC_017448	AGAAA	2	10	213777	213786	80 %	0 %	20 %	0 %	385789222
100	NC_017448	CCTTG	2	10	216574	216583	0 %	40 %	20 %	40 %	385789227
101	NC_017448	TCGGG	2	10	223066	223075	0 %	20 %	60 %	20 %	385789232
102	NC_017448	CGGAA	2	10	223417	223426	40 %	0 %	40 %	20 %	385789232
103	NC_017448	CTGCC	2	10	224353	224362	0 %	20 %	20 %	60 %	385789233
104	NC_017448	AAAGC	2	10	225469	225478	60 %	0 %	20 %	20 %	385789234
105	NC_017448	GATGC	2	10	235365	235374	20 %	20 %	40 %	20 %	385789239
106	NC_017448	GCACC	2	10	236563	236572	20 %	0 %	20 %	60 %	385789240
107	NC_017448	GTCCG	2	10	237227	237236	0 %	20 %	40 %	40 %	385789240
108	NC_017448	CCCCT	2	10	243517	243526	0 %	20 %	0 %	80 %	385789243
109	NC_017448	ACGAC	2	10	244128	244137	40 %	0 %	20 %	40 %	385789244
110	NC_017448	TCATT	2	10	246658	246667	20 %	60 %	0 %	20 %	385789245
111	NC_017448	GATTG	2	10	247202	247211	20 %	40 %	40 %	0 %	385789246
112	NC_017448	CCAAG	2	10	249131	249140	40 %	0 %	20 %	40 %	385789249
113	NC_017448	AAACG	2	10	249564	249573	60 %	0 %	20 %	20 %	385789249
114	NC_017448	CGCGG	2	10	249588	249597	0 %	0 %	60 %	40 %	385789249
115	NC_017448	AAAAT	2	10	251238	251247	80 %	20 %	0 %	0 %	385789251
116	NC_017448	AACTG	2	10	252711	252720	40 %	20 %	20 %	20 %	385789253
117	NC_017448	TGAAA	2	10	253392	253401	60 %	20 %	20 %	0 %	385789253
118	NC_017448	CAATT	2	10	255017	255026	40 %	40 %	0 %	20 %	385789254
119	NC_017448	TTTCG	2	10	255879	255888	0 %	60 %	20 %	20 %	385789255
120	NC_017448	CAGAC	2	10	258268	258277	40 %	0 %	20 %	40 %	385789258
121	NC_017448	CCGCA	2	10	259279	259288	20 %	0 %	20 %	60 %	385789259
122	NC_017448	TGGCA	2	10	259952	259961	20 %	20 %	40 %	20 %	385789260
123	NC_017448	CGCTG	2	10	260139	260148	0 %	20 %	40 %	40 %	385789260
124	NC_017448	TTCTT	2	10	260842	260851	0 %	80 %	0 %	20 %	385789261
125	NC_017448	GGCAA	2	10	262557	262566	40 %	0 %	40 %	20 %	385789262
126	NC_017448	TAAAA	2	10	269203	269212	80 %	20 %	0 %	0 %	385789267
127	NC_017448	CGCTT	2	10	269553	269562	0 %	40 %	20 %	40 %	385789268
128	NC_017448	ATCGT	2	10	271052	271061	20 %	40 %	20 %	20 %	385789269
129	NC_017448	GCAAG	2	10	271768	271777	40 %	0 %	40 %	20 %	385789270
130	NC_017448	TTTTC	2	10	274380	274389	0 %	80 %	0 %	20 %	385789272
131	NC_017448	CCGCA	2	10	276009	276018	20 %	0 %	20 %	60 %	385789275
132	NC_017448	GCAAC	2	10	277144	277153	40 %	0 %	20 %	40 %	385789275
133	NC_017448	AGATA	2	10	278809	278818	60 %	20 %	20 %	0 %	385789276
134	NC_017448	CCAGA	2	10	278938	278947	40 %	0 %	20 %	40 %	385789276
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258	NC_017448	CGCAT	2	10	511896	511905	20 %	20 %	20 %	40 %	385789465
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