MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 1408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017448	TTGC	2	8	1	8	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017448	CGAG	2	8	1629	1636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017448	AAAG	2	8	1882	1889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017448	CTGA	2	8	2174	2181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017448	CTAA	2	8	3992	3999	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017448	TTTC	2	8	9110	9117	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017448	AATA	2	8	15687	15694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017448	GCGG	2	8	18077	18084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017448	TTTA	2	8	20247	20254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017448	TGCG	2	8	22714	22721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017448	TTTA	2	8	23927	23934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017448	TTTG	2	8	26386	26393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017448	TAAC	2	8	27175	27182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017448	TTAA	2	8	27185	27192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017448	AAAG	2	8	37488	37495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017448	TTTC	2	8	41265	41272	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017448	GTTT	2	8	42306	42313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017448	ATTT	2	8	42391	42398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017448	AATT	2	8	46830	46837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017448	CCAT	2	8	47070	47077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017448	GCAA	2	8	47358	47365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017448	TGCT	2	8	48305	48312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017448	AATA	2	8	49196	49203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017448	TCTT	2	8	49218	49225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017448	TGCT	2	8	51422	51429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017448	TTGG	2	8	59030	59037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017448	AACT	2	8	71976	71983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017448	TAAA	2	8	73964	73971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017448	AAAT	2	8	77651	77658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017448	TTGC	2	8	86183	86190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017448	CTTG	2	8	86197	86204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017448	CAAG	2	8	86842	86849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017448	ATTG	2	8	87162	87169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017448	GGCG	2	8	98049	98056	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017448	ATTC	2	8	99548	99555	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017448	TTTC	2	8	99583	99590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017448	AAAT	2	8	99794	99801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017448	TGTC	2	8	102028	102035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017448	TTCT	2	8	114508	114515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017448	CTTG	2	8	124355	124362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017448	TTGC	2	8	124530	124537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017448	AAAG	2	8	124848	124855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017448	CTAT	2	8	141104	141111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017448	GCTC	2	8	141421	141428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017448	GATT	2	8	149272	149279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017448	CGCT	2	8	150721	150728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017448	AATT	2	8	151916	151923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017448	CTTC	2	8	152116	152123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017448	GCTG	2	8	152332	152339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017448	TTTA	2	8	152978	152985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017448	TAAT	2	8	156220	156227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017448	GCGG	2	8	161453	161460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017448	TGGT	2	8	170269	170276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017448	ATTT	2	8	178176	178183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017448	TCGT	2	8	178922	178929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017448	TTGC	2	8	179330	179337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017448	TAAA	2	8	179415	179422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017448	TCTT	2	8	179444	179451	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017448	TTGA	2	8	180221	180228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017448	ACCA	2	8	181778	181785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017448	TCCT	2	8	186579	186586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017448	AGTT	2	8	193459	193466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017448	TTTG	2	8	213083	213090	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017448	AGGA	2	8	213251	213258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017448	ATTT	2	8	214401	214408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017448	CATC	2	8	214499	214506	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017448	GTGA	2	8	215934	215941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017448	AAAC	2	8	219052	219059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017448	CAAG	2	8	225300	225307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017448	CTTT	2	8	225409	225416	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017448	CCCA	2	8	229927	229934	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_017448	ACGC	2	8	232654	232661	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017448	CTTT	2	8	235606	235613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017448	AAGT	2	8	235615	235622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017448	CAAA	2	8	238305	238312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017448	CTTT	2	8	240112	240119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017448	GAAA	2	8	246834	246841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017448	AGAA	2	8	248639	248646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017448	CCCG	2	8	248659	248666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017448	TGAA	2	8	258494	258501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017448	CTGT	2	8	258643	258650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017448	TAAT	2	8	261870	261877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017448	CATC	2	8	263204	263211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017448	CGAG	2	8	263420	263427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017448	CAAA	2	8	263533	263540	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017448	AGCG	2	8	263678	263685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017448	TACA	2	8	264244	264251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017448	TCGC	2	8	264430	264437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017448	TAAA	3	12	266963	266974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017448	CCCG	2	8	267161	267168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_017448	CAAA	2	8	271679	271686	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017448	TTTG	2	8	289394	289401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017448	CGGA	2	8	292297	292304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017448	GTTC	2	8	292521	292528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017448	GATA	2	8	292575	292582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017448	TGTC	2	8	293139	293146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017448	CTTT	2	8	293162	293169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017448	CGCC	2	8	311417	311424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_017448	GCGT	2	8	311731	311738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017448	TCAA	2	8	314906	314913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017448	TTGC	2	8	318726	318733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017448	TACT	2	8	319052	319059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017448	AAAG	2	8	319142	319149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017448	TCGT	2	8	328434	328441	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017448	TCAA	2	8	329343	329350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017448	CGTC	2	8	332008	332015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017448	AAGG	2	8	332136	332143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017448	GCCT	2	8	332520	332527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017448	GCAT	2	8	343338	343345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017448	GACG	2	8	343380	343387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017448	CACC	2	8	352204	352211	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_017448	ACGC	2	8	352220	352227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017448	ACAA	2	8	352331	352338	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017448	ATTT	2	8	352414	352421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017448	ATTT	2	8	352468	352475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017448	AGTT	2	8	352501	352508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017448	ATTT	2	8	354347	354354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017448	GCAA	2	8	354409	354416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017448	CAAA	2	8	363569	363576	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017448	TGAT	2	8	371239	371246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017448	CAGG	2	8	371811	371818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017448	ACCT	2	8	373475	373482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017448	AAAC	2	8	376021	376028	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017448	TAAT	2	8	420173	420180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017448	GCAA	2	8	427074	427081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017448	CCTT	2	8	427090	427097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017448	TTCC	2	8	427356	427363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017448	TTGC	2	8	427425	427432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017448	TCTT	2	8	428704	428711	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017448	CAAA	2	8	428912	428919	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017448	TAAA	2	8	428991	428998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017448	ACTT	2	8	436797	436804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017448	AGAA	2	8	439978	439985	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017448	CAAG	2	8	454768	454775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017448	TTGT	2	8	460932	460939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017448	CGCC	2	8	461036	461043	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_017448	TCCA	2	8	461182	461189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017448	AGCC	2	8	461282	461289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017448	TAAA	2	8	462687	462694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017448	AGGC	2	8	464421	464428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017448	GCCC	2	8	468507	468514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_017448	AAAT	2	8	468845	468852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017448	GAAA	2	8	469193	469200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017448	TTTG	2	8	475073	475080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017448	TAGT	2	8	476429	476436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017448	TCTG	2	8	476517	476524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017448	AAAC	2	8	477972	477979	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017448	TTAA	2	8	482149	482156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017448	AGGA	2	8	490976	490983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017448	GCAA	2	8	494332	494339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017448	AGCG	2	8	494703	494710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017448	CAAG	2	8	502248	502255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_017448	AACA	2	8	1382814	1382821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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